文章标题：Combined single cell and spatial transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity of hedgehog pathway in gastric cancer
中文标题：单细胞和空间转录组联合分析揭示了胃癌中 hedgehog 通路的细胞异质性
发表期刊：Genes Immun
发表时间：20240909
影响因子：5.0/Q1
研究背景
胃癌（GC）是全球范围内癌症相关死亡的主要原因之一，患者的预后差异显著。然而，基于 hedgehog 通路的 GC 的潜在治疗靶点尚未明确确定。近年来，增强型CT（ceMDCT）被广泛用于评估胃癌的病变特征，尤其是CT检测的肠外静脉侵犯（EMVI），已被证明是预测远处转移和不良预后的独立风险因素。
研究方法
研究纳入13名T4aN+M0的胃癌患者，结合单细胞测序数据和空间转录组学，深入研究了 hedgehog 通路在 GC 中的作用。通过CIBERSORT和WGCNA分析筛选出M2巨噬细胞相关基因模块，并与EMVI相关基因进行重叠分析，最终筛选出候选基因。基于综合评分算法，研究来自 GC 肿瘤组织的成纤维细胞的特征。
研究结果
1.免疫细胞浸润与WGCNA模块分析
利用TCGA数据库中371名胃癌患者的免疫细胞浸润情况。CIBERSORT算法识别了22种免疫细胞浸润情况，其中M2型巨噬细胞与“midnightblue”模块显著相关（P < 0.05）。
2. EMVI-M2预后基因模型的构建与验证
通过单变量COX回归分析筛选出的两个核心预后基因EGFLAM和GNG11，并利用LASSO回归构建了EMVI-M2预后基因模型。在TCGA训练集和GEO验证集中，Kaplan-Meier曲线显示高风险组患者的OS显著低于低风险组，表明模型具有良好的预后预测能力。
3. 肿瘤突变负荷（TMB）与单基因突变率分析
研究TMB和单基因突变率在高风险组和低风险组中的差异。高风险组的TMB显著高于低风险组，而单基因突变率在低风险组中更高。结合EMVI相关风险评分和TMB状态，发现高TMB/低风险组的生存率最高，而低TMB/高风险组的生存率最低。
4. 风险评分与免疫细胞浸润的关联
EGFLAM和GNG11与M2型巨噬细胞、纤维母细胞和内皮细胞显著相关，免疫得分和基质得分在高风险组中显著升高，表明高风险组具有更复杂的肿瘤微环境。
5. 免疫检查点抑制剂（ICIs）治疗敏感性分析
EGFLAM表达低的患者对PD-1和CTLA-4抑制剂的反应更好（P < 0.05），而高表达的患者对ICIs治疗的敏感性较低。此外，EGFLAM和GNG11与多种免疫检查点基因（如PD-L1、CTLA-4）呈正相关。
文章小结
本研究揭示了EMVI与M2型巨噬细胞在胃癌免疫微环境及患者预后中的重要作用，EGFLAM可能通过削弱免疫治疗效果在胃癌免疫逃逸中发挥关键作用。EGFLAM和GNG11有望成为免疫治疗的潜在靶点。（对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！）
