文章标题：Transcriptional signals of transformation in human cancer
中文标题：人类癌症转化的转录信号
发表期刊：Genome Med
发表时间：20240109
影响因子：10.4/Q1
研究背景
恶性转化的基础是细胞状态向分化程度较低的或干细胞样细胞状态的变化。因此，癌症可能广泛保留细胞起源状态或转变为类似于更原始的细胞类型，即组织特异性胎儿或原始胚胎细胞。癌症呈现哪种细胞状态（原始状态或其他状态）是癌症生物学的一个基本问题，因为它提供了癌症形成后果的净读数。
研究方法
使用单细胞图谱来研究转录方面的癌症转化。我们在广泛的成人和儿童癌症中使用了大量转录组，使用先前建立的方法来询问它们与正常细胞状态的关系。我们使用单细胞癌症转录组以及结直肠癌和肝癌的器官特异性图谱来扩展和验证这些发现。
研究结果
1.单细胞图谱研究转录方面的癌症转化
对于对照群体（胚母细胞），即使提供了658368个胎儿和产后细胞，绝大多数大量转录组信号也可以通过早期胚胎和原肠胚形成参考来解释。相比之下，根据组织特异性参考，实体癌几乎没有保留早期胚胎信号。作者发现儿童肿瘤与成人肿瘤中保留的胎儿信号量或“胎儿性”之间存在强烈而一致的差异。
2. 单细胞癌症转录组器官特异性图谱
成人和胎儿肝细胞（单独或联合），是成人肝细胞癌的主要细胞信号，肝母细胞瘤如预期的那样倾向于胎儿肝细胞。当作者从参考转录组中去除AFP时，这种信号的优势仍然存在，这表明它不是由这种转录物单独驱动的。单细胞mRNA分析验证了作者的大量转录组发现，即成人肝细胞癌可被视为异常的成人肝细胞，其中一些转化为胎儿肝细胞状态。相比之下，大多数儿童肝母细胞瘤细胞与胎儿肝细胞相匹配。
文章小结
我们的分析揭示了成人癌症分化状态的细微差别，其中大多数成人肿瘤最好用出生后细胞来解释，但不能用恢复到产前状态来解释。相比之下，“胎儿样”转录组是儿童肿瘤几乎普遍存在的特征，这可能是由于它们可能起源于发育。总体而言，这些发现表明，在转录组水平上，癌症转化是一个高度组织和癌症类型特异性的过程，而不是成人癌症的一般标志（对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！）
