PubMed 停止更新了?
这几天,很多医疗用户表示,检索不到 11 月 7 号之后的文献,天塌了啊...「PubMed 停更」的话题,这几天在各大平台迅速引起热议。
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就在刚才,丁香园收到了 PubMed 团队对于停更情况的回复。
每日更新的 PubMed,国内外都停更?
PubMed,人称「科研界的 abandon」。
它包含来自多个 NLM(美国国家医学图书馆)文献资源的生物医学文献的引文和摘要,根据其官网公布的信息,NLM 每天都会生成包含新引文、修订引文和已删除引文的更新文件,实现「每日更新文件」。
图源:PubMed
但就在前几日,华中地区某高校实验室研究员对我们表示,以往每日一更的 PubMed,好像停止录入新文献了:「尽管尚能检索到 11、12 日上线的文献,但翻遍数据库,也暂未发现在今年 11 月 7 日后见刊的论文;通常来说,论文会在见刊后一段时间正式上线。」
停更的情况,并不只在国内。
同时期,一位在国外的医疗工作者也表示无法检索到 11 月 7 日后上线的文献。更有研究者在社交平台上每天「掰着手指头」怒数 PubMed 停更的日子。
图源:社交平台
基于此,丁香园向 PubMed 团队咨询最近停更的相关情况,并在 14 日凌晨 4:15 收到回复:这几天确实没更新,但刚刚补上了。
邮件中,PubMed 团队表示:「对于新引文和修订引文更新的延迟表示歉意,该问题现已解决, PubMed 中已有最新引文。」此外,对于「有人称在 PubMed Central(PMC)找到了新文献」,团队还强调,PMC 和PubMed 是互相独立的数据库。
邮件正文:We apologize for the delay in new citations and citation updates being available in PubMed. This issue has now been resolved and new citations are now available in PubMed.
Lastly, to clarify your question 4:PubMed and PubMed Central are separate databases.
图源:丁香园
科研工作者在线崩溃?目前已恢复更新
此次遇上「PubMed 停更」,不少人在线崩溃、表示「科研暂停,开始等待」,并为后续无法正常检索、获取文献资料担忧。
图源:@生信笨小孩
实际上,PubMed 被大家发现停更,也不是第一次了。
此前,PubMed 曾分别在 2013 年、2018 年正式停更过。在 2018 年的停更公告中,PubMed 团队表示「由于政府资金的失误,PubMed 上的信息可能无法更新。」就在第二天,该团队再次发布公告,称 PubMed 再度开放。
图源:社交平台
正处于博士阶段的李立(化名)对此早已放平心态:「在这几年的科研生活中,好几次遇到不更新的了,比如今年年初,就停更了十几天;基于政府资助资金维持的 PubMed,出现不稳定的情况在所难免。」
但另一方面,尽管文献更新存在延迟、不稳定等情况,PubMed 依旧占据了李立科研之路的大半部分:「对于我来说,文献检索只是 PubMed 很小的一个功能,在这之外,它还汇总整理了海量的人类基因组数据和病历数据。」
「如果 PubMed 不再持续更新,则需要去分散的各个国家数据中心找,过程将变得繁琐异常。」
在国内某 985 高校研究所工作的研究员肖陈(化名),并非 PubMed 的习惯用户。相比于 Pubmed 本身的停更,他更担心其他数据库紧随其后的停摆:「PubMed 作为 NCBI 旗下的数据库,和其他 NCBI 数据库有很强的关联性,如果它彻底停更,对其他数据库影响就很大。」
「比如说,一条新的蛋白数据或者组学数据上传到其他数据库,就需要关联对应文献,如果这个文献 Pubmed 因为停更没有收录,那关联到哪呢?当然也可以用 DOI(Digital Object Unique Identifier,指数字对象唯一标识符),但整个系统就会有点崩了。」
但同时肖陈也认为,PubMed 并非科研工作者们的唯一选择,还有很多其他的数据库可供使用。
14 日,PubMed 已恢复更新、可正常检索。
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