题目:Psoriasis may increase the risk of idiopathicpulmonary fibrosis: a two-sample Mendelianrandomization study
题目:银屑病可能增加特发性肺纤维化的风险:一项双样本孟德尔随机化研究
期刊:J Dermatol.
分数:5.8/Q1
时间:202402
研究背景
尽管一些研究表明银屑病可能导致特发性肺纤维化 (IPF) 的风险,但没有研究报告它们之间存在明确的因果关系。我们的目的是使用孟德尔随机化 (MR) 设计探索银屑病与 IPF 之间的潜在关系。
研究方法
为了探索银屑病与IPF之间的因果关系,我们使用了来自欧洲血统的最大全基因组关联研究(GWAS)的遗传仪器,包括银屑病(5314例,457,619例对照)和IPF(1028例,196,986例对照)。我们的主要分析采用逆方差加权(IVW)方法和随机效应模型进行,其他四种分析互补:加权中位数法、加权模式、多变量MR法和MR-Egger法。
研究思路
结果分析
1. 银屑病相关SNP
基于 5314 例银屑病对照和 457,619 例病例的总样本。摘要样本几乎完全是欧洲血统。MR分析中使用的所有SNP均具有稳健性,F统计量大于10。
2.银屑病对IPF风险的影响
采用IVW、加权中位数法和MR-Egger回归来估计银屑病与IPF风险的因果关系。IVW分析显示,遗传预测的银屑病会增加IPF的风险。
3. 富集分析
使用从 MR 研究获得的 20 个 SNP 的 GO 和 KEGG 富集分析结果。BP生物过程、CC细胞成分分析、MF分子功能分析。
文章小结
本文针对间质性肺病中最普遍的特发性肺纤维化(IPF)进行了深入研究。该研究依托于公开可获取的大规模临床数据,并采用了当前生物信息学研究中广泛使用的孟德尔随机化方法,探讨了免疫性疾病银屑病与特发性肺纤维化之间的潜在因果联系。通过仅使用统计学方法,成功完成了一篇6分的高质量数据分析论文!