1万小时定律是个非常热门的概念。但是，1万小时并非一个放之四海而皆准的整理，它有很多的限定条件。“刻意练习”下的1万小时才有用！那如何通过刻意练习成为杰出人物呢？一、产生兴趣；二、专注认真Focus；三、获得反馈Feedback；四、修正创新Fix。作为技能性学习，敲代码、理解代码和使用代码是从生信菜鸟转变成生信大佬的必由之路！
在纯生信21天中，我们就已经分享，对于生信研究，大趋势是生信筛选+生信验证+湿实验。公共数据库目前可用，R语言处理GEO和TCGA数据则成为趋势。湿实验逐渐成为必须，因为更可靠。目前，单细胞、多组学的干湿结合研究，或许是目前发表生信论文最快的方式！
########--------R包安装--------########## 榴莲说：在开这个R语言专栏前，其实反反复复纠结一件事情，到底是从《R语言实战》还是《R数据科学》开始分享。毋庸置疑，这两本书在R语言方面都是挺有代表性的。《R语言实战》更倾向于R语言零基础入门学习，更偏基础理论学习和统计建模。## 《R数据科学》更倾向于入门的数据科学应用，会丢给你一个小例子，然后引你深入学习，非常有意思（英文资料网址：https://r4ds.had.co.nz/）。事实上，作为生信学习R语言更倾向于应用，所以尝试以《R数据科学》为主，《R语言实战》为辅的方式，开启R语言专栏。欢迎大家一起探讨学习。## R包，简单直白的理解，就是别人写好的工具包，你可以不需要知道这个工具是怎么开发的、甚至不清楚这个工具全部的功能，但你知道在什么时候用什么工具，使用工具的正确方式以及清楚工具的结果解释就可以。R包通常包括：R 函数、实例数据、预编译代码的集合，包括 R 程序，注释文档、实例、测试数据等。# 01_CRAN：官方存储库，它是一个由全球 R 社区维护的 ftp 和 Web 服务器网络http="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"install.packages("ggplot2", repo=site) # 单个包安装install.packages(c("ggplot2", "ggforce","ggsci")) # 多个包安装# 02_Bioconductor：这是一个专题库，用于生物信息学的开源软件install.packages('BiocManager') # 安装BiocManagerlibrary(BiocManager) # import 已经安装的BiocManagerBiocManager::install(c("GSEABase","GSVA","clusterProfiler" ),ask = F,update = F) # 利用BiocManager安装其他的包# 03_Github：不是R语言特有的。只有这个平台，没有与之相关的审核机制install.packages('devtools') # 安装devtools包library(devtools) # import devtools包devtools::install_github("calligross/ggthemeassist") # 从github安装# 04_手动安装，从网站下载相关压缩包，然后本地读取download.file("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/amap/amap_0.6.tar.gz","amap_0.6.tar.gz") # 下载R包install.packages("amap_0.6.tar.gz",repos=NULL) # 安装R包
对于处理了很多项目，储存很多代码的电脑来说，R 或 RStudio的更新可能带来原有代码无法运行，数据无法复现的问题。因此，在实施项目前，可以先把 R 和 RStudio都更新到最新版；在实施项目后，尽量不要更新，直到项目完成！个人观点，供参考！代码如下：
http="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN" #设置镜像install.packages("installr") #R的安装library(installr)updateR() #R的更新#打开RStudio, 点击“help”下面的“Check for Updates”即可更新 RStudio
installr::updateR(fast = T,copy_packages = T) #更新R,不更新包
参考资料：https://www.r-project.org/
.libPaths() #默认文件夹位置
getwd() #获取数据位置setwd() #更改数据位置
b、使用setwd()转变当前工作文件的路径。但R for Data Science并不推荐这种方式！
####----R_Learning_Preparations----####rm(list = ls()) #删除路径下的所有对象gc() #在储存空间中完全删除所有对象，并报告内存使用情况getwd() #获得工作路径stringsAsFactors = FALSE #当数据框含有字符时，字符不要转化为因子
追溯历史，2006年统计之都网站的成立似乎可以算做 R 语言在中国的元年，尽管两年后才有了第一届中国 R 语言会议。统计之都（Capital of Statistics，简称 COS）成立于2006年5月，旨在推广与应用统计学知识，创建成中国的统计学门户网站。统计之都网站最初由谢益辉（现为RStudio软件工程师）创办，现由世界各地志愿者共同管理和维护。
统计之都的成员在 R 相关书籍翻译上做出了大量的工作！翻译《R语言实战》的高涛、肖楠和陈钢，翻译《R语言编程艺术》的陈堰平、邱怡轩、潘岚锋和熊喜，整理《153分钟学习R》的刘思喆，“Y叔”余光创等都是统计之都的成员（https://cosx.org/members/）。感谢！！
在之后几年里，R 语言的推广似乎并没有多大进展。直到2013年11月，生信菜鸟团创建！创始人曾健明（Jimmy），开始把 R 语言培训推广开来。2016年8月，生信技能树创建，是中国第一家专注于生信知识体系完善、促进生信学习交流的论坛。2018年，他们建立了专业的线下培训体系；2019年开始在全国各主要城市培训。后来由于疫情，培训形式主要是线上。他们在 R 语言的推广上做出了巨大贡献！说实话，尽管 R 语言培训如雨后春笋，但是最知名的，可能还是生信技能树以及专门分享单细胞内容的单细胞天地！
因为疫情，2020年前后涌现了一大批生信相关的公众号。芒果师兄聊生信就是在2020年初诞生的，芒果团队则是在与果友不断互动中形成的。与其他团队不同，芒果师兄聊生信侧重于生信技能在科研中的实际应用，致力于搭建临床和科研沟通桥梁，并结合临床知识和科学前沿，与医生朋友一起学习，共同成长！
