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b 天津中医药大学研究生院
c 天津市第二人民医院检验科
d 呼吸科，天津市儿童医院（天津大学儿童医院）
e 天津大学生命科学学院，天津市微纳生物材料与检疗技术工程中心，天津市生物大分子结构功能与应用重点实验室
摘要
呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus，RSV）是引起儿童急性下呼吸道感染住院的主要病原体。随着社区及学校重新开放，COVID-19后时代RSV的卷土重来引起密切关注。为了解COVID-19流行前后天津地区合胞病毒的传播模式、优势毒株和基因型变异，我们对2017年7月至2022年6月间天津市住院儿童共19531份鼻咽拭子样本进行评估。采用直接免疫荧光法和PCR筛选RSV阳性样本并进行亚型鉴定，进一步利用Sanger测序分析G基因的第二高变区(HVR2)突变。研究结果显示，16.46% (3,215/19,531)样本呈现RSV阳性，在2020年12月至2021年2月，RSV出现一个流行高峰，平均阳性率达35.77% (519/1,451)。ON1型和BA9型是天津市2017年7月至2022年6月间高频交替感染的主导株，此外，在COVID-19流行期间，新的替换突变如BA9基因型中的N296Y、K221T、N230K、V251A和ON1基因型的L226I也相继出现。临床特征分析显示，RSV-A组和RSV-B组之间没有显著差异。本研究为临床防治提供理论依据，但还需要进一步探究宿主对ON1和BA9不同谱系的免疫反应的调节机制作用。
Fig. 1. Flowchart of the study.
Fig. 3. Age distribution of RSV in children aged 0–14 years with ALRIs in Tianjin, China, from July 2017 to June 2022.
Fig. 5. Phylogenetic tree of representative RSV-A and RSV-B strains isolated from inpatients aged 0–14 years based on the C-terminal HVR2 region of the G gene.
Fig. 6. Alignments of the deduced amino acid sequences of the HVR2 region of the G protein of RSV-A/B strains isolated from Tianjin and the ON1 /BA9 original reference strains.
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