作者
方耀辉，王君，孙建青，苏正元，陈声耀，肖坚，倪军，胡志红，何玉邦，沈姝，邓菲单位
a 中国科学院武汉病毒研究所，病毒学国家重点实验室与国家病毒资源库
b 中国科学院大学
c 青海湖国家级自然保护区管理局
d 湖北江夏实验室
e 新疆病媒传染病重点实验室
摘要
蜱虫是中国西部青藏高原地区的主要寄生虫，可能会给农业和畜牧业带来直接的经济损失。尽管已对威胁人类和动物的蜱传病原体进行了广泛的研究，但地方优势蜱种携带的病毒组成仍然未知。本研究采集了青海湖周边的草原革蜱，并通过宏基因组测序鉴定了属于至少6个病毒科的13种病毒。其中有4种病毒在蜱虫中的丰度最高，包括已知的Xīnjiāng tick-associated virus 1 (XJTAV1)，以及三种新病毒：Qīnghǎi Lake virus 1，Qīnghǎi Lake virus 2 (QHLV1和QHLV2，未分类)，和 Qīnghǎi Lake virus 3 (QHLV3，属于布尼亚病毒目，白纤病毒科，乌库病毒属)。这四种病毒在草原革蜱中广泛分布，它们的最小感染率分别为8.2%、49.5%、6.2%和24.7%。进一步，在二代测序数据中发现了一条序列疑似为QHLV3的M片段。生物信息学方法预测该片段编码病毒糖蛋白，且信号肽裁剪位点、N-糖基化位点和跨膜区等，均与白纤病毒科病毒糖蛋白有相似性。利用杆状病毒表达系统检测确认该蛋白具有N-糖基化修饰，并可被剪切。此外，在其他蜱虫病毒组的测序数据中，利用该M片段找到了与之序列相似的其他乌库病毒的M片段，而这些乌库病毒原本也被认为缺少M片段。本研究通过研究草原革蜱的病毒组，促进了我们对高原地区蜱传病毒多样性的认识。而QHLV3 M 片段的发现表明，提示之前认为缺少 M 片段的乌库病毒以及相似的布尼亚病毒应具有与典型布尼亚病毒相同的基因组结构。这将促进我们对乌库病毒遗传和进化的理解，并有助于新病毒的发现。
表1 通过RNA-seq从草原革蜱的蜱池中鉴定出的病毒
表2 在其他蜱池中发现的QHLV3或与QHLV3相关的推测M片段序列
表3 使用嵌套PCR检测草原革蜱中 XJTAV1、QHLV1、QHLV2和QHLV3的感染率最低
附图 S2 热图显示了2016年和2017年从5个池中鉴定出的病毒丰度
附图 S3 XJTAV1、QHLV1和QHLV2的基因组组织。黑线代表contigs，黄色箭头代表ORFs，紫色区域代表保守区域
附图 S4 Phenuivirus家族中RdRp、GP和NP的病毒蛋白序列身份的成对比较
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