作者
付艺亮，李飞，朱云，黄陆慈，李秋萍，张瀚文，钟礼立，张海邻，罗征秀，卢根，邓继岿，曹凌峰，吴滢，靳蓉，李磊，许黎黎，陈祥鹏，谢正德单位
a儿童呼吸道感染性疾病北京市重点实验室，儿童重大疾病教育部重点实验室，国家呼吸疾病临床研究中心，国家儿科学重点学科（首都医科大学），首都医科大学北京儿童医院，国家儿童保健中心北京儿科研究所，北京b中国医学科学院儿童危重感染研究室，北京
c湖南省人民医院，湖南师范大学第一附属医院，长沙
d温州医科大学第二附属医院，育英儿童医院，儿童呼吸病科，温州
e重庆医科大学附属儿童医院，国家儿童健康与疾病临床研究中心，儿童发育与疾病教育部重点实验室，重庆市儿科学重点实验室，重庆
f广州市妇女儿童医疗中心，广州
g深圳市儿童医院感染科，深圳
h复旦大学附属儿童医院检验科，上海
i上海交通大学医学院上海儿童医学中心国家儿童医学中心检验科，上海
j贵阳市妇幼保健院，贵阳
呼吸道合胞病毒（Respiratory Syncytial Virus, RSV）是引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染（acute lower respiratory tract infection, ALRTI）的最重要病因之一。本研究涵盖中国2017至2021年间9个省份10家医院的500份RSV阳性咽拭子样本，通过基因扩增获得了396个RSV-F基因的完整序列；与GenBank和GISAID数据库中下载的151个中国RSV-F基因序列进行系统发育和遗传多样性分析。结果显示，2017年至2021年中国流行的RSV-F基因相对保守，但在6个中和抗原位点决定区和p27区发现了频率≥10%的AA突变：即RSV A中V384I（位点Ⅰ）、N276S（位点II）、R213S（位点Ø）和K124N（p27）；RSV B中F45L（位点I）、M152I/L172Q/S173L/I185V/K191R（位点V）和R202Q/I206M/ Q209R（位点Ø）。对比2020年前后RSV-F的突变频率，RSV A变化不大，而RSV B中K191R、I206M和Q209R的频率增加了10%以上。值得注意的是，RSV B中nirsevimab作用位点S211N的突变频率从0%增加到1.15%。A, B分离代表株与各自原型株RSV-F预测结构构象相似，均方根偏差（root-mean-square deviation， RSMD）值低。这些结果可为我国RSV单克隆抗体和疫苗的相关研发提供基础数据参考。Fig. 1. Phylogenetic analysis of the fusion gene of RSV A (n = 245) and RSV B (n = 306). Fig. 2. Amino acid mutations of the full-length (574 amino acids) fusion glycoprotein of RSV A (n = 242) and RSV B (n = 305) compared respectively with Long and CH18537.
Fig. 3. Visualization of amino acid variations at six sites of the fusion glycoprotein in different conformations.![]()
Fig. 4. Differences in mutational frequencies of the fusion glycoprotein between the time before and after 2020.![]()
Fig. 5. Analysis of changes in the fusion glycoprotein conformation.
Table. 1. Spatiotemporal distribution of the number of RSV A/B fusion gene sequences included in this study.
a Numbers before and behind “/” indicated the number of RSV A and RSV B fusion glycoprotein gene sequences.
b Gansu, Hubei, and Shandong Provinces were not included in the ten provinces.c Sequence downloaded from GenBank missing “Province/Municipality” information.
Table. 2. Amino acid mutations at six sites and in the p27 region of the fusion glycoprotein of RSV A and RSV B based on deduced amino acid sequences.
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Abbreviations: V, variation; F, frequency.a Determination of these sites was refered to reference (Rossey et al., 2018).b The form of amino acid changes was shown as “A position B”.![]()
Fig. S1. Phylogenetic analysis of the fusion gene of RSV A (n = 245) and RSV B (n = 306). 相关阅读：
《中国病毒学（英文）》Virologica Sinica, 是中国科学院武汉病毒研究所和中国微生物学会共同主办的病毒学领域的专业学术期刊。主要刊载病毒学及分支领域的前沿研究及最新进展。本刊最新影响因子（JCR2023）4.3, 5年影响因子 4.3, 排位进入病毒学领域Q1区，CiteScore 2023 9.3, 连续十一年入选“中国最具国际影响力学术期刊”（TOP 5%）。期刊于2022年变更为以金色开放获取模式出版的开源期刊（Open Access Journal），与科爱出版社合作全球出版传播。本刊为中国科技核心期刊，且被SCI、PubMed/Medline、PubMed Central、Scopus等数据库收录。
