案件背景
广东省惠州市一家投资公司A，2016年3月16日从惠州市另一家企业B手中购买了惠州市某房地产开发公司15%的股权，合同价格1,500万元。
2018年2月5日，投资公司A将持有的上述股权转让给惠州市C实业公司，合同价格1,700.00万元。
两次股权转让过程中，投资公司A除了于2018年1月29日缴纳了从B受让股权时应缴纳的印花税7,500元外，没有申报缴纳其它税款，也没有提供两次股权转让时点的资产评估报告。
主管税务机关经调查发现，投资公司A除持有房地产开发公司15%的股权外，未开展其他实质性经营业务，也没有其他资产。
税务机关从房地产开发公司直接取得的评估报告显示，在基准日2018年1月31日，房地产开发公司市场评估价值为24,496.5万元, 投资公司A所持有的15%股权市场价值为3,674.48万元（计算：24,496.50×15%）。投资公司A与C实业公司签订的股权转让价格1,700.00万元明显低于市场价。
税务机关又进一步获悉，投资公司A的两位自然人股东已经于2018年1月26日将所持有的投资公司A 100%股权以税后165,300,000元的价格转让给深圳某投资置业公司。
纳税解析
印花税
主管税务机关认定投资公司A没有按照规定申报缴纳印花税。
投资公司A将房地产开发公司15%的股权转让给C实业公司时，股权转让合同没有按照“产权转移书据“缴纳印花税。
怎么计算印花税呢？
是按照合同约定的价格，还是按照评估报告计算的价格？或者是根据股东转让价款推定的价格？
《印花税法》第五条规定，应税产权转移书据的计税依据，为产权转移书据所列的金额。
因此税务机关采用的是合同价格。
合同约定价款1,700万元，所以投资公司A在2018年2月所属期应申报缴纳印花税8,500元（计算：17,000,000.00×0.5‰）。
企业所得税
主管税务机关认定投资公司A没有按照规定就股权的转让所得申报缴纳企业所得税。
怎样确定股权转让收入呢？
税务机关首先排除了合同价格。认为合同价格1,700万明显低于房地产开发公司15%的股权在评估基准日2018年1月31日的股东权益市场价值即3,674.48万元。在核心资产未发生变化的情况下，合同价格也明显低于深圳投资置业公司购买投资公司A 100%股权支付的对价（即税后价款16,530万元）。而且投资公司A未对股权转让收入偏低提供正当理由。
接着税务机关排除了按照评估报告计算的价格。房地产开发公司拥有的全部资产是一块商业用地。在房地产开发公司提供的评估报告中每平方米土地的评估价值为1,297.61元。而当地政府公布的同等级别城镇基准地价为每平方米1,980元。评估单价明显低于该地块实际价值。
最后税务机关采用根据股东转让价款推定的价格。税务机关这样认定的理由包括：
1、两次交易时间接近。2018年1月26日投资公司A的两位自然人股东将投资公司A 100%股权转让给深圳投资置业公司。2018年2月5日投资公司A将房地产开发公司15% 股权转让给C实业公司，两次股权转让时间间隔不到一个月。
2、两次股权转让虽然标的不同，但核心资产一致。均为房地产开发公司15%股权。
3、未发现深圳投资置业公司与投资公司A两位原自然人股东存在关联关系。可以认定他们之间的股权转让价格为公允价格。
关于股权转让成本，税务机关并没有直接采用投资公司A于2016年3月16日的受让合同价格1,500万元。而是根据税务机关针对企业B股权转让另案调查后确认的结果，认定投资公司A此次股权转让成本为17,117,160.17元。
关于股权转让成本，税务机关并没有直接采用投资公司A于2016年3月16日的受让合同价格1,500万元。而是根据税务机关针对企业B股权转让另案调查后确认的结果，认定投资公司A此次股权转让成本为17,117,160.17元。
投资公司A股权转让所得为189,565,570.3元（计算：165,300,000÷80%+165,300,000×0.5‰-17,117,160.17-8,500。注：165,300,000÷80% 是将股权转让的税后价换算成税前价）。
投资公司A需补缴企业所得税47,399,892.58元（189,565,570.30×25%），投资公司A的行为属于偷税，需缴纳0.5倍罚款23,699,946.29元。
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