国自然申请| “代谢重编程”研究的“经典”和“创新”模式

学术   2024-11-03 17:01   上海  

上期我们介绍了“代谢重编程”研究中的坑,主要说的是代谢酶的“同工酶”这个问题(有很多人喜欢用“代谢重编程”报项目,但是坑太多了……)今天我们说代谢重编程研究的“经典”和“创新”模式

顾名思义,既然叫“重编程”,那就有一套既有的“编程”系统,而在某个条件刺激下导致原有的系统被“重排”。先前很多团队从“能量代谢”的角度关注代谢重编程对细胞供能的影响,即细胞在条件1的情况下以供能方式A为主,而在条件2的情况下以供能方式B为主:细胞所用的主要能量来源方式是糖酵解途径,但是在某些细胞亚型(或者条件下)中,细胞能量获取来源发生改变,更多从脂质的β-氧化途径获取能量

不过现在大家关注“代谢重编程”实际上更看重的是:代谢重编程产生的代谢物作为信号传递分子的新角色,即代谢物本身也可以参与到信号转导的过程中。比如大家非常熟悉的乳酸,作为蛋白翻译后修饰的底物成分不仅介导组蛋白、还介导非组蛋白的乳酸化修饰,从而参与基因的转录调控或者影响蛋白定位以及蛋白-蛋白互作结合。

因此我们说的“创新”模式就从这个开始,比如昨天我们介绍的Cell Metabolism上的研究,说的是果糖通过作为信号分子增强己糖激酶2HK2)与内质网钙通道ITPR3的相互作用(中科院最新Cell Metabolism研究:免疫代谢研究的经典案例!)。之所以说创新,这里果糖的作用并不是被代谢后进入糖酵解途径然后给细胞功能,而是作为了信号分子来发挥作用所以大家把“果糖”当做“小分子药物”来理解,是不是就能get到创新点了?

以此类推,这种“创新”模式的关键就是:把代谢物(当然也包括肠道菌群来源的代谢物)看作小分子药物,从而鉴定其发挥作用的靶点,从而确定其参与信号转导和具体细胞功能的作用机制。

那如果关注的是代谢酶呢?

不知大家是否记得之前我们介绍过的一篇推文:分子老还能不能报基金?结合国自然新热点机制发到Cell子刊够吗?!

这项研究说的是PKM2这个经典的糖酵解关键酶,在细胞核内可以与特定RNA结构结合,直接影响基因转录,是不是也是很“颠覆性”的发现?


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