论文荐读|扬州大学周萍萍课题组:代谢工程改造酿酒酵母发酵生产咖啡酸

企业   2024-10-18 15:55   北京  

论文荐读

代谢工程改造酿酒酵母发酵生产咖啡酸

作者:袁豆豆,周秀琪,庞雪晴,杜家艳,周萍萍*


单位:扬州大学 生物科学与技术学院


基金项目:

国家自然科学基金项目(32371480,32001032);扬州大学“高端人才支持计划”资助;江苏省大学生创新创业训练计划项目(202211117105Y)

摘要及关键词

摘要:咖啡酸是一种天然酚酸类化合物,具有抗氧化、抗肿瘤、抗炎等多种生物学活性,咖啡酸也是迷迭香酸、绿原酸和咖啡酸苯乙酯等高附加值化合物合成的重要前体,在医药、食品和化妆品等行业具有较大的应用价值。为实现咖啡酸绿色可持续生产,在前期构建的产咖啡酸酿酒酵母菌株中,敲除苯丙氨酸途径中的预苯酸脱水酶基因(PHA2),将咖啡酸产量提高42%。而敲除色氨酸途径中邻氨基苯甲酸合成酶基因(TRP2),对咖啡酸积累影响不大。之后,回补了URA3HIS3MET15营养标记基因,然后将工程菌株在5 L的发酵罐中进行了补料分批发酵,使得咖啡酸产量达到了9.3 g/L,是目前文献中报道微生物发酵生产咖啡酸的最高水平,该研究为咖啡酸的绿色生产以及其衍生物的高效微生物合成奠定了基础。

关键词:酿酒酵母;咖啡酸;预苯酸脱水酶;邻氨基苯甲酸合成酶;生物合成


主要结论

     课题组在前期的研究中,以L-酪氨酸为前体,通过引入咖啡酸合成所需的基因以及敲除苯丙氨酸反馈抑制的Aro3、过表达酪氨酸反馈抑制不敏感突变体Aro4K229L和Aro7G141S、敲除丙酮酸脱羧酶Aro10和表达运动发酵单胞菌来源的环己二烯脱氢酶TyrC(图1),构建了一株产咖啡酸的酿酒酵母菌株YCA113-8B(Appl. Microbiol. Biotechnol., 2021, 105:5809-5818)。在该菌株中,L-苯丙氨酸和L-酪氨酸都是由预苯酸转化形成,L-苯丙氨酸途径是L-酪氨酸衍生物的主要竞争途径。阻断这条竞争途径可以使得碳代谢流转向L-酪氨酸衍生物的生物合成。在苯丙氨酸合成途径中,预苯酸脱水酶(PHA2)可以催化预苯酸生成苯丙酮酸,苯丙酮酸在芳香族氨基酸转移酶(Aro8/Aro9)作用下合成苯丙氨酸。为了进一步提高咖啡酸产量,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑系统敲除了YCA113-8B菌株基因组中的PHA2基因,构建了YCA113-16B菌株。经摇瓶培养72 h后,结果如图2所示,相比于YCA113-8B菌株,咖啡酸的产量提高了42%,达到了807.3 mg/L。此外,敲除PHA2后,细胞的生物量没有明显变化。



图 1 酿酒酵母中咖啡酸生物合成途径

Fig. 1 The biosynthetic pathway of caffeic acid in Saccharomyces cerevisiae

图2 敲除PHA2TRP2对咖啡酸的影响

Fig. 2 The effect of knocking out PHA2 and TRP2 on caffeic acid production.

另一方面,莽草酸途径生成的分支酸会在邻氨基苯甲酸合酶(TRP2)催化下,生成邻氨基苯甲酸,将碳代谢流转向L-色氨酸合成途径。为了进一步提高咖啡酸的产量,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑系统进一步将YCA113-16B菌株基因组中的TRP2基因进行敲除,获得YCA113-20B菌株。经摇瓶培养后,敲除TRP2基因后,YCA113-20B菌株咖啡酸产量略微下降(图2)。推测原因如下:色氨酸分支途径相对较复杂,有TRP1-TRP5五个酶通过六步反应将分支酸转化到色氨酸。其中在第一步反应中,除了TRP2能催化分支酸转化成邻氨基苯甲酸外,TRP3作为一个双功能的酶,含有谷氨酰胺酰胺转移酶和吲哚-3-甘油磷酸合酶两个独立的催化结构域,可与TRP2协同,催化分支酸向邻氨基苯甲酸的转化,因此仅敲除TRP2无法完全阻断色氨酸支路。
为了进一步提高咖啡酸的产量,计划选用摇瓶中咖啡酸产量相对较高的菌株进行补料分批发酵实验。然而,YCA113-16B是HIS3MET15营养缺陷型菌株,且YCA113-16B菌株中,携带有URA3营养缺陷基因的TYPE3-M-gPHA2质粒容易在传代中丢失。为了在补料分批发酵中,避免组氨酸、甲硫氨酸和尿嘧啶缺乏影响细胞生长,首先,在去除了TYPE3-M-gPHA2质粒的YCA113-16B(-)菌株中,整合了URA3营养标记基因,获得了URA3能够稳定遗传的YCA113-23B菌株,在此基础上,回补了HIS3营养标记基因,获得了YCA113-23BH菌株,进一步回补了MET15营养标记基因,获得了YCA113-23BHM菌株。为了考察这些营养缺陷型基因回补后,对菌株咖啡酸和生物量的影响,先进行了摇瓶发酵实验。结果显示,在摇瓶发酵中,进行上述营养缺陷基因回补,对生物量和产量没有造成明显的影响(图3)。因此,最终选用了YCA113-23BHM菌株在5 L的发酵罐中进行了补料分批发酵,测试了其生产性能。结果如图4所示,经过103 h发酵,咖啡酸产量达到了9.3 g/L,是目前文献中报道的微生物合成咖啡酸的最高产量。但在补料分批发酵中,菌株的生物量较低,OD600最高约为137。因此需进一步优化发酵培养基以及补料工艺,以期提高生物量,从而提高咖啡酸产量。

图3 回补URA3HIS3MET15营养缺陷基因对咖啡酸产量和生物量影响

Fig. 3 Effects of URA3, HIS3, and MET15 auxotrophic marker genes complementation on caffeic acid production and biomass

图4 YCA113-23BHM菌株分批补料发酵合成咖啡酸

 Fig. 4 Fed-batch fermentation of YCA113-23BHM to improve the production of caffeic acid


团队简介



周萍萍,扬州大学生物科学与技术学院副教授,硕士生导师。主要从事萜类及芳香族化合物的微生物生物合成研究,荣获了江苏省双创博士、扬州市“绿扬金凤计划”优秀博士、扬州大学拔尖人才等称号。先后主持了国家自然科学面上项目基金、国家自然科学青年基金、江苏自然科学青年基金、中国博士后基金、江苏省高校自然科学面上基金等项目,在国内外权威期刊上发表学术论文20余篇,获授权发明专利6项。



引用格式


袁豆豆, 周秀琪 ,庞雪晴 ,等 .代谢工程改造酿酒酵母发酵生产咖啡酸[J]. 食品与发酵工业, 2024, 50(19):17-24.

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图文供稿| 作   者

编辑排版| 严浩东

内容审核| 董   玲


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