本周六直播预告:
PIK3CA突变肿瘤细胞释放的花生四烯酸通过诱导染色质重塑促进结肠上皮恶性转化。
研究主要关注“PIK3CA突变肿瘤细胞如何通过释放花生四烯酸(AA)影响周围正常细胞,促进肿瘤进展”,研究发现PIK3CA突变肿瘤细胞通过旁分泌外泌体中的AA诱导H3K4三甲基化,导致肠上皮细胞(IECs)恶性转化。具体机制为PIK3CA突变维持SGK3-FBW7介导的cPLA2蛋白稳定性,增加AA合成,并通过外泌体传递至IECs,AA直接结合Menin并增强Menin与MLL1/2甲基转移酶的相互作用。
2.组蛋白修饰
组蛋白乳酸化增强ALKBH3活性促进肿瘤进展并减少早幼粒细胞白血病蛋白核凝聚体。
研究主要关注“组蛋白乳酸化如何通过增强ALKBH3活性影响肿瘤抑制蛋白PML的核凝聚体形成”,研究发现组蛋白乳酸化通过增加ALKBH3表达和去除SP100A的m1A甲基化,YTHDF1识别m1A修饰的SP100A转录本,增加其RNA稳定性和翻译效率,从而减少PML凝聚体的形成,促进癌症的恶性转化。
ENL识别组蛋白β-羟丁酰化以调节基因转录。
研究主要关注“组蛋白β-羟丁酰化(Kbhb)的识别蛋白及其在基因表达中的作用”,研究发现ENL作为一种新型的组蛋白β-羟丁酰化效应器,能够识别并结合H3K9bhb,ENL与H3K9bhb的相互作用抑制了MYC等驱动细胞增殖基因的表达。
3. 基因缺失/扩增
MGA缺失通过调节线粒体氧化磷酸化引发Richter综合征转化。
研究主要关注“MGA缺失如何通过调节线粒体氧化磷酸化(OXPHOS)导致慢性淋巴细胞白血病(CLL)向Richter综合征转化”,研究发现MGA缺失导致Nme1(核苷二磷酸激酶)表达上调,Nme1作为MGA的靶标,通过促进线粒体异常和OXPHOS增强,驱动CLL向Richter综合征转化。
4. 增强子
FTO基因内含子元件缺失激活IRX3癌基因导致T细胞急性淋巴细胞性白血病。
研究主要关注“基因组非编码区域变异如何通过新的机制激活癌基因”,研究发现FTO基因内一个CTCF结合位点缺失,导致lncRNA CRNDE的活性超级增强子与IRX3启动子发生异常的增强子劫持,进而促进IRX3癌基因异常表达,从而促进T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)进展。
5. SNP风险位点
高通量鉴定系统性红斑狼疮中的功能性调控SNPs。
研究主要关注“系统性红斑狼疮(SLE)风险位点中的非编码变异如何影响疾病风险”,研究从87个SLE风险位点中鉴定出2180个单核苷酸多态性(SNPs),其中52个SNPs可能与转录因子和B细胞相关蛋白的结合有关。其中风险等位基因rs2297550增强了转录因子IKZF1的结合从而调节IKBKE的表达,携带rs2297550个体中干扰素/NF-κB调节因子IKKε表达水平明显增加。
6. 解旋酶和R Loop
ARIP4解旋酶通过解除R-loop促进雄激素介导的转录诱导。
研究主要关注“RNA聚合酶II(Pol II)在转录起始位点(TSSs)的暂停与DNA双链断裂(DSBs)之间的关系及其在雄激素信号转导中的作用”,研究发现雄激素受体(AR)相互作用蛋白4(ARIP4)解旋酶是雄激素依赖性转录诱导的驱动因子。具体机制为ARIP4优先与暂停的Pol II共占TSSs,并与拓扑异构酶IIβ复合物,介导激素刺激下的短暂DSB形成,ARIP4缺乏会阻碍暂停的Pol II释放,并导致高度转录的AR靶基因处R-loop积累。
7. miRNA
假基因GSTM3P1的lncRNA靶向降解肾脏保护性miR-668促进缺血性急性肾损伤。
研究主要关注“特定lncRNA在急性肾损伤(AKI)中的作用及其机制”,研究发现来自假基因GSTM3P1的新型lncRNA通过与肾脏保护性miR-668相互作用并促进其降解,介导缺血性AKI。具体机制为GSTM3P1直接结合成熟miR-668,通过靶向降解途径诱导其降解,GSTM3P1过表达增加了ATP耗尽后肾脏近曲小管细胞凋亡,而这一效应可被miR-668挽救。
8. RNA修饰
RNPS1稳定NAT10蛋白促进癌症中的翻译过程。
研究主要关注“NAT10及其蛋白伴侣在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用”,研究发现RNA结合蛋白富含丝氨酸结构域1(RNPS1)在HNSCC中显著上调,RNPS1通过直接蛋白相互作用抑制NAT10被E3泛素连接酶ZSWIM6泛素化降解,从而促进HNSCC中NAT10的高表达。具体机制为NAT10的上调介导特定tRNA ac4C修饰的增强,进而促进IL-6信号、IL-8信号和PTEN信号等途径中基因的翻译过程,这些途径在调节HNSCC恶性进展中起作用,最终影响HNSCC患者的生存和预后。
9.RNA二聚体
LncRNA MILIP通过结合tRNAs促进蛋白质合成驱动三阴性乳腺癌。
研究主要关注“LncRNA MILIP在三阴性乳腺癌(TNBC)中的作用及其机制”,研究发现MILIP通过与转运RNA(tRNA)结合促进蛋白质合成,支持TNBC细胞存活、增殖和肿瘤形成。具体机制为MILIP与真核生物翻译延伸因子1α1(eEF1α1)相互作用,并与类型II tRNAs tRNALeu和tRNASer通过它们的可变环形成RNA-RNA二聚体,促进eEF1α1与这些tRNAs的结合,破坏MILIP与eEF1α1或tRNAs之间的相互作用会减少蛋白质合成和细胞活力。
10.RNA 二级结构rG4
核PKM2与预mRNA中的G-四链体结合揭示其基因调控作用。
研究主要关注“核PKM2作为一种非典型RNA结合蛋白在肿瘤进展中的基因表达调控作用”,研究发现核定位的PKM2特异性与前体mRNA中的折叠RNA G-四链体(rG4)结构相互作用,PKM2占据rG4位点阻止了抑制性RNA结合蛋白(如HNRNPF)的结合,从而促进含rG4的前体mRNA表达。具体机制为PKM2通过控制折叠和未折叠rG4s的平衡影响基因表达,阻止PKM2核积累可以抑制三阴性乳腺癌细胞中的rG4ome,减少癌细胞的迁移和侵袭。
11.RNA 可变剪接
剪接因子PQBP1通过抑制BAX表达促进卵巢癌进展。
研究主要关注“剪接因子PQBP1在卵巢癌进展中的作用及其机制”,研究发现PQBP1过表达促进肿瘤进展并预示卵巢癌预后不良。具体机制为PQBP1优先结合外显子区域并调节外显子跳跃,特别是通过促进BAX基因的外显子2跳跃,产生截短的异构体,该异构体通过非编码介导的mRNA降解而降解,使癌细胞对凋亡产生抵抗。
12. 核RNA外切体复合物
MTR4/hnRNPK复合体监控异常多聚腺苷酸化RNA。
研究主要关注“RNA监控系统如何识别并降解由转录终止、剪接和多聚腺苷酸化异常产生的RNA”,研究发现MTR4与hnRNPK复合体共同识别并降解含有多个外显子的异常多聚腺苷酸化RNA(3XTs)。具体机制为MTR4不稳定化由转录读穿一个或多个外显子产生的内含子多聚腺苷酸化转录本,hnRNPK识别含有多个外显子的3XTs,异常蛋白KCTD13 3XT是hnRNPK-MTR4-RNA外切体途径的靶标,并形成异常凝聚体(KeXT)。