1901年3月，岑春煊调任山西巡抚，到任不久，即查出山西防军骚扰抢掠地方的情形，岑春煊奏请将十几名管带和哨官即行革职，永不叙用，统领交部议处。
1902年7月，岑春煊调任广东巡抚，原拟入京陛见后南行赴任，结果四川哥老会蜂起作乱，清廷命岑春煊即赴成都署理四川总督，岑春煊平定川内袍哥之乱后，创办警政，处置了一批贪官墨吏，四川官场风气为之一振。
1903年4月，朝廷因广西到处匪患，命岑春煊再度署理两广总督，督办广西军务，岑春煊赴任后驻扎在梧州，严查后，得知广西匪乱的根源是过于贪婪的广西巡抚王之春的广西提督苏元春的纵容，于是请旨革去二人官职。
于是岑春煊整顿广西官场吏治，参劾：南宁知符惠荣勒财滥杀；知县姜之燮招摇纳贿；知县华照借案勒索；管带杨发贵约束下属不严；右江道道员易顺鼎自便私图、不顾大局；代理象州知州周朋寿；副将张兴国蒙混领饷、纵兵抢劫。
拘捕了贪残嗜杀成性、酷愈猛虎得知县陈景华，可惜被其同党劫走，逃到了越南。
广东官员被岑春煊参劾的有：清乡无功的陆路提督程允和，贪污残忍的知州徐仁杰等人，及其一些违法乱纪的军官，南海县知县舞弊受贿逃到了澳门，贿买荷兰人庇护，被岑春煊引渡回国，治以严惩。
岑春煊在广西平匪，历时两年多，匪患平定后，岑春煊上表朝廷论功请奖达三百多人，其中有日后的民国两广名将陆荣廷、龙济光等人。
1905年5月，朝廷命岑春煊兼任粤海关监督，该肥缺以往是肥水不流外人田，监督都由内务府奏派，一年一换，度支部定下征額，每年500万两白银，但每年上交度支部均在300万两左右。
岑春煊兼任此职后，当年征收即达660万两白银，岑春煊查出，书办周荣耀贪污200多万两，到京以巨款贿赂军机处领班大臣奕劻，获任出使比利时国大臣，尚未出洋，即被岑春煊参劾革职。
1906年9月，岑春煊调任云贵总督未到任，请假到上海看病，1907面3月3日，朝廷调岑春煊为四川总督，并不让其入京请训，岑毓煊大怒，以为是自己反复参劾的奕劻，与直隶总督兼北洋大臣袁世凯从中作梗，不让自己入京面圣。
岑春煊乘船从上海抵达武汉，电请顺道入京：深念巴蜀道远，以后觐见无日，必须向慈禧和光绪面陈种种危迫情形云云。
不等朝廷批准，即乘火车倍北上，4月29其抵达入京。
封疆大吏无诏入京，等同谋反，可是岑春煊是慈禧太后和光绪帝的第一宠臣，慈禧和光绪非但没有责备他，反而接连三天召见岑春煊。
岑春煊谈到时局日非，悲愤异常，痛哭流涕，参劾奕劻：“近年亲贵弄权，贿赂公行，以致中外效尤，纪纲扫地，皆由亲王奕劻贪庸误国，引用非人，若不力图刷新政治，重整纪纲，臣恐人心离散之日，虽欲勉强维持，亦无挽回无术了。”
慈禧闻言，颇不高兴，反问：“何至人心离散？你有何证据，可详细奏明。”
岑春煊反问慈禧：“臣请问今日中国政治，是好是坏？”
慈禧答道：“因为不好才改良的。”
岑春煊又问：“改良是真的，还是假的？”
慈禧气道：“改良还有假的？这是怎么说？”
岑春煊答：“太后固然是真心改良政治，但以臣观察，奉行之人在欺蒙朝廷。朝廷下诏创行新政，现在政治不惟不能刷新，反较从前更加腐败。从前卖官鬻缺尚是小的，现在内而侍郎，外而督抚，皆可用钱买得，政以贿成，丑闻四播，所以臣说改良是假的。”
看慈禧未答，岑春煊又问：“太后知道出洋的学生有多少？”
慈禧答道：“听说东洋有七八千，西洋不清楚，想必也有几千。”
岑春煊说：“臣听说的，也是如此。古人以士为四民之首，是因为士心所崇尚的，民皆信从。过几年出洋学生回到国内，眼见政治腐败如此，这就是人心离散之时，到此地步，臣实不敢再说了。”
说罢失声痛哭，慈禧也哭了，说：“我很久没听到你说话了，谁知政事竟败坏到这个样子。”
（未完待续）
