6.4/Q1,孟德尔优秀作业来抄~浙江大学医学院GWAS+孟德尔+共定位证实了吸烟、DNA 甲基化和 CRC 风险之间的显着关联

文摘   2024-08-14 18:00   陕西  

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文章标题:Dissecting the pathogenic effects of smoking and its hallmarks in blood DNA methylation on colorectal cancer risk

中文标题:剖析吸烟的致病作用及其在血液中的标志 DNA 甲基化对结直肠癌风险的影响

发表期刊:Ecotoxicology and Environmental Safety 

发表时间:2023年10月

影响因子:6.4/Q1

研究背景

吸烟被认为是结直肠癌 (CRC) 的危险因素,但其复杂性和潜在途径尚未完全了解。

究思路

采用双样本孟德尔随机化(MR)分析,分析吸烟行为和血液中相关DNA甲基化的遗传仪器,结合结直肠癌的汇总水平GWAS数据,理清两者之间的关系。还进行了共定位分析和前瞻性基因-环境相互作用分析作为复制。

结果分析

1. 双样本孟德尔随机估计吸烟行为对结直肠癌风险的影响

IVs解释了5种吸烟表型的方差为0.13-1.81%,F统计量范围为403.52-14204.16。我们的 MR 分析确定了遗传预测的 SmkInit 与 CRC 风险之间令人信服的关联。

2. 吸烟行为对CRC风险的多变量孟德尔随机化估计

遗传预测的 SmkInit 和 SmkCes 对 CRC 风险的独立影响。遗传预测的 SmkInit 增加 1-SD 与 CRC 风险较高独立相关,OR 为 1.51 (95% CI:1.13, 2.03),而遗传学 SmkCes 显示出独立的保护作用,OR 为 0.68 (95% CI:0.47, 0.99)。

3. CRC上吸烟相关甲基化的双样本孟德尔随机估计

这些关联不仅重申了烟草使用对结直肠癌风险的致病作用,而且表明了戒烟的益处。当对结肠癌和直肠癌进行分层时,在单变量和多变量MR分析中都没有证据表明遗传预测的吸烟行为存在关联,这可能是由于统计功效非常有限。

4. CpG 位点甲基化和 CRC 易感性的共定位证据区域图

尽管没有携带 CRC 的风险等位基因,但与非吸烟者相比,目前具有 rs616263 CC 基因型的吸烟者患 CRC 的风险高 43%,相对风险 (RR) 为 1.43 (95% CI:1.19, 1.72);目前具有rs10899189 TT基因型的吸烟者每10年后戒烟风险增加13%。

文章小结

单变量MR分析确定了开始吸烟对CRC风险的致病作用具有说服力的证据,并观察到戒烟具有保护作用的提示性证据。多变量MR分析显示,这些关联与其他吸烟表型和饮酒无关。发现 CpG 位点 cg17823346 [ZMIZ1] 的遗传预测甲基化可降低 CRC 风险;而基因预测的 CG02149899 甲基化会增加 CRC 风险。共定位和基因-环境相互作用分析进一步证明了cg17823346 [ZMIZ1]以及cg02149899的表观遗传修饰与CRC风险之间的关系。证实了吸烟、DNA 甲基化和 CRC 风险之间的显着关联。

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