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文章标题：Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
中文标题：多组学分析显示细胞具有新型致癌簇TRAP1low/CAMSAP3low，在早期子宫内膜癌中出现更具侵略性的行为和不良的预后
发表期刊：Molecular Cancer
发表时间：2024年6月
影响因子：27.7/Q1
研究背景
研究方法
我们通过对24例不同生存结局的早期子宫内膜样 EC 患者的癌症和癌旁组织进行蛋白质组学分析后，筛选出 13 种差异表达蛋白，同时通过单细胞转录组 （scRNA-seq） 进一步鉴定出 2 种富含 p53 信号通路的蛋白。
结果分析
1.早期 EC 中预后相关蛋白的多组学鉴定和 TRAP1 的表征低/CAMSAP3低簇
对 34 个 DEPs 进行 LASSO 分析，通过交叉匹配上述三类获得 13 个预后蛋白：AK3、ATF2、NUMA1、CACHD1、ZMPSTE24、TRAP1、COG3、CAMSAP3、COX4I1、PGPEP1、UBL5、HADHA 和 SNRPGP15。13 种候选蛋白显示出良好的结果预测。通过 scRNA-seq 进行差异表达分析，3 个差异表达基因 （DEG） 与蛋白质组学数据一致：NUMA1、TRAP1 和 CAMSAP3。CellChat 的细胞间相互作用分析表明，上皮细胞与免疫细胞的相互作用最密切。
2. 预后蛋白的验证及其预测 EC 患者死亡风险的能力
癌旁组 TRAP1 和 CAMSAP3 表达高于预后不同的癌症组。死亡患者肿瘤组织中 TRAP1 和 CAMSAP3 的表达低于存活患者。根据子宫内膜病变的 TRAP1 和 CAMSAP3 特征计算的低表达评分的患者在所选队列中的存活率显著降低。患者5年生存率也显著降低，表明 I-II EC 患者的预后最差 。
文章小结
TRAP1 和 CAMSAP3 与早期 EC 患者的预后密切相关，并显著提高了通过 IHC 检测 TP53 的疗效。TRAP1low/CAMSAP3low簇通过受体-配体对相互作用与髓系细胞密切相关。本研究为 EC 患者分流的早期预后因素提供了理论依据。（对文章研究思路感兴趣的老师，欢迎关注CC一起交流）
