10.7/Q1,北京大学第六医院纯生信10+运用GWAS+孟德尔+共定位共同揭示肠道抗炎药靶基因与精神疾病的关联

文摘   2024-08-07 18:10   陕西  

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文章标题:Association of intestinal anti-inflammatory drug target genes with psychiatric Disorders: A Mendelian randomization study

中文标题:肠道抗炎药靶基因与精神疾病的关联:一项孟德尔随机化研究

发表期刊:Journal of advanced research 

发表时间:2024年5月

影响因子:10.7/Q1

研究背景

精神疾病是全球公共卫生负担沉重的负担,药物选择有限。肠脑轴连接炎症性肠病和精神疾病,这些疾病通常有合并症。虽然一些证据表明抗炎药有助于治疗精神疾病,但肠道抗炎药的具体作用仍不清楚。

究方法

 我们使用来自大脑中现有表达数量性状位点 (eQTL) 和蛋白质 QTL 的汇总数据,以及疾病的公共全基因组关联研究进行了双样本孟德尔随机化 (MR)。我们还探讨了肠道菌群的介导作用。统计数据包括六种精神疾病,涉及9,725-500,199人。共定位分析增强了MR证据。

结果分析

1. 药物靶点对精神病学结局的因果效应

MR 分析显示,杏仁核中硫嘌呤 S-甲基转移酶 (TPMT) 基因表达增加与 BD 风险升高相关。

2. TPMT 和 ACAT1 的共定位结果

为了进一步保证MR结果的稳定性,我们分别在杏仁核中表达的TPMT与在颈脊髓和OCD中表达的BD和ACAT1进行了共定位分析。具体来说,我们观察到 TPMT 基因表达和 BD 之间可能共定位的迹象,后验概率为 61.6%,这赋予了假设 4 准确的可能性最高。

3. 调解分析

为了进一步评估药物靶点与精神疾病之间的关联是否会影响肠道微生物群的丰度,我们进行了两步 MR 分析。首先,使用TPMT的遗传仪器来估计基因表达对介质的因果效应

文章小结

 我们发现了杏仁核中TPMT(奥沙拉嗪的靶标)表达与双相情感障碍(BD)风险之间的因果关系(比值比[OR]=1.08;P = 4.29 × 10-4).即使将乙状结肠和全血 eQTL 视为暴露,也观察到这种关联。共定位分析显示,TPMT表达与BD之间存在共享的遗传变异(rs11751561),后验概率为61.6%。有趣的是,这种因果效应受到蔷薇属肠道微生物群丰度降低的影响(效应比例 = 10.05%)。此外,ACAT1表达升高与更高的强迫症风险相关(OR=1.62;P = 3.64 × 10-4;后验概率 = 3.1 %)。

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