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文章标题：A multi-dimensional approach to unravelthe intricacies of lactylation related signaturefor prognostic and therapeutic insightin colorectal cancer
中文标题：一个多维的方法来解开乳酸化相关的特征的复杂性在结肠直肠癌的预后和治疗见解
发表期刊：Journal of Translational Medicine
发表时间：2024年2月
影响因子：6.1/Q1
研究背景
研究方法
利用AUCell算法在单细胞RNA测序数据中的相关性分析，以及TCGA数据集中的cox回归和套索回归分析，并在GEO数据集中得到证实，我们确定了预测结直肠癌预后的23个基因特征。随后，我们分析了乳酸化相关基因风险与临床特征、突变景观、生物学功能、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和药物敏感性之间的关联。
结果分析
1. CRC中整体乳酸化水平上调，与肿瘤进展相关
首先，我们对我们的 CRC 样本进行了验证，结果显示与邻近的正常组织相比，癌组织中的整体乳酸化水平升高。与正常结肠上皮细胞系NCM46相比，这一观察结果在CRC细胞系中得到了进一步证实。
2. 从单细胞转录组鉴定 CRC 中的乳酰化相关基因 （LRGs）
为了鉴定主要反映乳酸化修饰的基因，我们对单细胞测序数据进行了深入分析。经过质量控制，精心挑选了46,286个高质量细胞进行后续分析。
3. 新型LRG特征揭示了对CRC预后的强大预测能力
鉴于LRGs与促肿瘤通路之间的相关性，我们对它们在预测CRC预后方面的作用的可能性很感兴趣。由于scRNA-seq数据的样本量有限，我们选择进一步分析TCGA队列以提取LRG预后特征。
4. LRGS中中心基因表达模式的验证
为了进一步符合构成LRGS的这些乳酸化基因在肿瘤微环境（TME）中的分布，我们重新分析了scRNA-seq数据。
5. LRG特征相关生物学机制的预测
为了探索高风险组和低风险组之间转录组和遗传变异的分子意义，并深入了解与高风险组生存率低相关的生物学过程，我们深入研究了 TCGA 队列中 LRGS 模型的基因组异质性。
6. LRG评分重塑免疫细胞浸润格局
最近的研究强调了炎症微环境在结直肠癌发展中的关键作用，特别是免疫细胞和基质细胞与肿瘤细胞的激活状态和相互作用。
文章小结
乳酸化相关基因风险模型在改善结直肠癌患者的管理和提高治疗结果方面显示出巨大的潜力，特别是在代谢和免疫逃避的交叉点上。这一发现强调了整体乳酸化在CRC中的临床相关性，并为鉴于CRC中乳酸浓度高的机制研究和靶向治疗策略奠定了基础。
