序列信息上传
首先可以根据需要上传想要检索的序列,上传方式可以直接在输入框中输入氨基酸序列,也可以选择在左上角的选择上传方式中选择通过序列上传或通过GeneBank ID上传。
数据上传
上传数据后需要根据需要选择想要检索的内容,如果上传的是核苷酸序列,序列类型需要选择核苷酸,如果搜索的片段有编码蛋白的能力数据库选择可以同时选择核苷酸数据库和蛋白质数据库,一般来说核苷酸序列申请的专利较多,所以可以选择同时进行专利检索。
结果分析
当然,同时选择进行核苷酸和蛋白质数据库检索需要的时间比单一数据库要长一些,大约5分钟可以完成检索。
检测结果一般分为:序列、专利、文献、其他库和分析视图几个部分。我们以序列为例看一下检测到的具体信息。如果对序列信息有要求,可以根据需求限制搜索条件,精准定位需要查询的序列。
在限定了序列的精确要求后,可以只查询和目标序列百分百匹配的区段,这样可以保证去除冗余的干扰数据,最大限度提高结果的准确性。
可以根据需要选择想要检索的物种来源,例如我们想查看一下人源序列信息,选择Homo sapiens,如果要求检索信息要和目标序列完全一致,则选择100%匹配,这些功能可以在左侧工具栏进行序列过滤筛选。
如果对相关序列的专利感兴趣,则可以直接点击左侧的专利过滤,根据需求筛选专利详细信息。
此外,智慧芽bio生物序列库还支持链接其他数据库,可以联动GENBANK、CAS、EBI等数据库更详细的分析不同数据库中对相关序列的描述和收录情况。它允许用户进行跨数据库的联动分析,从而获得对核苷酸序列的全面理解,轻松帮科研人解决序列检索难题。
总结