加速mRNA疗法研发:利用智慧芽bio生物序列库高效检索核苷酸序列与专利分析

学术   2024-09-09 10:07   北京  

8月24日,Moderna宣布,欧盟委员会(EC)已批准其呼吸道合胞病毒(RSV)mRNA疫苗mRESVIA(mRNA-1345)上市,作为全球首款针对非新冠病毒的mRNA疫苗,为60岁及以上成年人提供了预防RSV引起的下呼吸道疾病(RSV-LRTD)和急性呼吸疾病的保护。Moderna目前已向全球多个监管单位提交了mRNA-1345的上市许可申请。这一成就不仅证明了mRNA技术在新冠疫苗之外的广阔应用前景,也标志着mRNA疗法在其他疾病防治领域取得的突破性进展。
mRNA疗法正引领一场医疗革新,它通过巧妙设计的信使RNA分子,赋予人体细胞生产特定蛋白质的能力,这些蛋白质是治疗或预防某些疾病的关键。与传统药物相比,mRNA疗法具有独特的优势:它不会与人体基因组发生整合,作用短暂,并最终由身体自然代谢,因而被誉为"激活身体内部的制药工厂"。这种创新的治疗方法,正成为药物研发的新宠。
mRNA疫苗的成功研发,依赖于对核苷酸序列的精确获取和专利信息的深入理解。传统的核苷酸序列检索工具和网站包括一些历史悠久且广泛使用的数据库,如美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GenBank、欧洲分子生物学实验室(EMBL)的EMBL-Bank,以及日本DNA数据库(DDBJ)。这些数据库因其庞大的数据量、丰富的序列信息以及长期积累的科研价值而受到重视。它们提供了基础的搜索和检索功能,支持科研人员访问大量的公共序列数据。
智慧芽bio生物序列库提供了一个更为流畅的解决方案,它允许用户快速搜索序列信息,进行多维度的数据探索,并利用其知识产权管理功能。能够在大多数情况下,通过单一数据库实现多信息检索。
由于mRNA-1345的序列信息目前仍是保密状态,因此接下来我们会通过一个具体的序列示例,来一探究竟,看看如何在这个数据库中高效地检索核苷酸信息。
首先,通过网址(https://bio.zhihuiya.com/)登录进入到数据库主界面。进入首页后,可以根据需要可以选择常规检索、短序列检索、Motif检索、片段检索、通式检索和修饰检索等,如果不确定检索的内容符合哪一项,选择常规检索一般都适用。

序列信息上传


首先可以根据需要上传想要检索的序列,上传方式可以直接在输入框中输入氨基酸序列,也可以选择在左上角的选择上传方式中选择通过序列上传或通过GeneBank ID上传。

数据上传


上传数据后需要根据需要选择想要检索的内容,如果上传的是核苷酸序列,序列类型需要选择核苷酸,如果搜索的片段有编码蛋白的能力数据库选择可以同时选择核苷酸数据库和蛋白质数据库,一般来说核苷酸序列申请的专利较多,所以可以选择同时进行专利检索。

结果分析


当然,同时选择进行核苷酸和蛋白质数据库检索需要的时间比单一数据库要长一些,大约5分钟可以完成检索。

检测结果一般分为:序列、专利、文献、其他库和分析视图几个部分。我们以序列为例看一下检测到的具体信息。如果对序列信息有要求,可以根据需求限制搜索条件,精准定位需要查询的序列。

在限定了序列的精确要求后,可以只查询和目标序列百分百匹配的区段,这样可以保证去除冗余的干扰数据,最大限度提高结果的准确性。

可以根据需要选择想要检索的物种来源,例如我们想查看一下人源序列信息,选择Homo sapiens,如果要求检索信息要和目标序列完全一致,则选择100%匹配,这些功能可以在左侧工具栏进行序列过滤筛选。

如果对相关序列的专利感兴趣,则可以直接点击左侧的专利过滤,根据需求筛选专利详细信息。

如果想查询相关序列的文献或对该序列的研究信息感兴趣,则可以直接点击左侧的文献查看,里面根据不同数据库收录对文献进行了分类,还可以根据需要筛选不同作者、期刊、机构和发表年份等信息,快速了解相关序列的研发情况。

此外,智慧芽bio生物序列库还支持链接其他数据库,可以联动GENBANK、CAS、EBI等数据库更详细的分析不同数据库中对相关序列的描述和收录情况。它允许用户进行跨数据库的联动分析,从而获得对核苷酸序列的全面理解,轻松帮科研人解决序列检索难题。

总结


mRNA疗法正引领医疗创新,以前所未有的速度和精度为治疗和预防疾病提供了新途径,展示了其在广泛疾病防治领域的应用潜力。智慧芽bio数据库的使用,加速了核苷酸序列的检索和专利信息的深入分析,为科研人员提供了强有力的支持,推动了mRNA药物研发的进程,为未来的医疗健康领域带来了无限可能。


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