cMET检测:从实验室到临床,精准医疗的实践之路

健康   2024-11-04 09:30  


cMET的背景

  • cMET(也称为Met/MET/c-MET),位于染色体7q21-31,一种受体酪氨酸激酶,主要在各种组织的上皮细胞表达;cMET是一个αβ异二聚体,由一个胞外区、一个跨膜区和一个胞内酪氨酸激酶区3部分组成;

  • cMET由其唯一配体肝细胞生长因子(HGF)激活‘’

    1. HGF与cMET结合后,促使c-MET分子形成同源二聚体或多聚体,这是激活酪氨酸激酶活性的前提。
    2. 二聚体化后的cMET在特定的酪氨酸残基(如Y1349和Y1356)发生自身磷酸化。这些磷酸化位点作为多底物对接位点,允许其他信号分子结合。
    3. 激活的cMET触发下游信号级联反应,包括PI3K/Akt、RAS/RAF/MEK/ERK(MAPK)等途径,这些途径调节细胞存活、增殖、运动等生物学行为。


cMET在肿瘤中的作用机理

  • cMET蛋白过表达:在肿瘤细胞中cMET蛋白水平异常增高。cMET过表达通常通过增强HGF信号通路,促进肿瘤细胞的生长、迁移和侵袭。

  • cMET基因扩增:cMET基因的拷贝数在肿瘤细胞中显著增加。基因扩增通常伴随着cMET蛋白的过表达和信号通路的过度激活。

  • cMET基因突变:基因突变可能会导致cMET受体的自发活化(即不需要HGF的结合),从而持续激活下游信号通路。

  • cMET融合:基因重排后产生的融合基因会编码一种融合蛋白,该蛋白通常包含cMET的激酶结构域。这种融合蛋白可能不再依赖于肝细胞生长因子(HGF)的结合即可被激活,从而持续地激活cMET下游信号通路。


  • 非小细胞肺癌中cMET异常的发生率和临床意义

  • cMET靶点药物获批情况:


cMET的检测方法

  • 由于cMET在肿瘤中的机制不同,所以基于不同的机制,检测方法也各不相同。

cMET蛋白表达的检测困难

cMET蛋白过表达成为药物临床研究的重要生物标志物。在TATTON、SAVANNAH、INSIGHT、NCT01610336等多项临床研究中,IHC作为MET过表达检测方法被列为入组标准之一。
2024年9月27日,艾伯维c-Met的ADCTelisotuzumab Vedotin(Teliso-v,ABBV-399)提交FDA关于治疗既往接受过治疗的c-Met蛋白过表达、表皮生长因子受体(EGFR)野生型晚期/转移性非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)患者的适应症。
IHC检测是个常规检测,但是对于cMET这个靶点来说,存在如下问题:
  • 抗体的选择:

    1.NMPA获批cMET抗体都是I类备案抗体,共有58家,目前尚未伴随诊断的抗体获批用于临床。
    2. 在SAVANNAH、TATTON、NCT02099058等多个大型临床研究中,Ventana MET(SP44)IHC检测法均被用作MET过表达的诊断入组标准方法学。

  • 判读方法:

    1.由于现在尚无cMET过表达的药物获批,所以对于cMET过表达IHC判读只有判读方法的推荐;
    2.在“非小细胞肺癌MET免疫组织化学检测和判读标准中国专家共识(2023版)”中,对于目前常用的2种判读方法Clinical Score和H score推荐使用Clinical score的方法;
    3.Clinical score是指:结合染色强度和阳性肿瘤细胞比例进行MET IHC评分;
    4.H-score评分系统进行MET表达的判读。该标准根据公式“1×(弱着色的肿瘤细胞百分数)+2×(中等着色的肿瘤细胞百分数)+3×(强着色的肿瘤细胞百分数)”计算最终的H-score,结果范围为0~300。
    5.对于cutoff值的选择:目前的研究主要集中在H score≥150或者Clinical score≥25%或50%;


  • cMET表达的定位:

1. 胞膜表达强弱应作为MET染色结果判读的主要依据,胞质染色则作为辅助判断,对于仅有胞质染色而无胞膜染色的病例,可根据标准进行判读,但需在报告中注明。


cMET扩增的检测困难

荧光原位杂交(FISH)通常被认为是评估MET基因拷贝数的金标准。基于组织的下一代测序(NGS)也可以用来同时检测MET扩增和其他可操作的生物标志物。对于cMET扩增,目前存在的问题如下:

  • 判读的阈值

1.临床试验中对MET扩增的定义各不相同,MET与染色体7着丝粒(MET/CEP7)的比例从≥1.8到≥3.0不等;

2.目前还没有临床上NGS的阈值,NCCN指南承认高水平MET扩增的定义尚未确定,但拷贝数大于10被认为是符合将结果定性为高水平MET扩增的标准。

3.检测的样本类型:真实世界研究使用了NGS(12项研究)和/或FISH(11项研究)来检测MET扩增:组织样本(13项),组织或液体样本(7项),液体样本(1项),没有提供样本信息(2项);

  • 检测成本及时间

    1. 没有发现评估专门检测MET扩增的经济影响的研究;

    2. 从Medicare和美国商业支付者的角度来看,当检测临床指南推荐(EGFR, ALK, ROS1, BRAF, KRAS, MET, HER2, RET, 和 NTRK1)中包含的所需基因组改变时,NGS比单基因检测节省了成本。

    3. NGS的平均TAT时间更短(2周)可以启动相应的靶向治疗,而其他检测方法单基因测序(8-9周)或热点套餐检测(3周)。

  • 检测方法的选择:FISH vs NGS;组织 vs 液态活检;

    1.德国的一项研究表明,当考虑高度扩增的MET(基因拷贝数>10)时,NGS与FISH之间的一致性更高;

    2. NGS可能较难检测到表达水平较低的情况(即低或中等MET扩增);


cMET14号外显子跳突的检测困难

cMET 14跳突是NSCLC的驱动基因突变之一,是筛选MET抑制剂靶向治疗获益人群的重要分子标志物。目前用于识别METex14突变肿瘤的方法包括NGS、Sanger测序和基于RNA的检测方法,如RT-PCR和基于RNA的NGS。
  • 检测方法的选择:

1. DNA的NGS,基于杂交捕获的灵敏度高于基于扩增子的NGS方法。
2. RNA的NGS比DNA的NGS灵敏度更高,因为DNA法在捕获METex14改变的广度上可能有限制。



  • NGS检测的局限:
      1. 肿瘤纯度:在分析过程中正常细胞通常与肿瘤细胞混合
      2. DNA质量:如果旧肿瘤样本会增加噪声
      3. 基因组大片段的改变会增加计算困难并降低准确性;

小结

cMET异常较其他基因变异更加复杂,应根据需要检测的cMET异常形式,结合送检样本类型、检测成本、检测实验室能力条件以及试剂获证情况等综合评估,合理选择检测方法,必要时考虑进行多平台相互验证。
专家共识推荐 NSCLC MET 检测路径如下:

目前国内已颁布2个关于MET的检测共识,分别是2022年《非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识》和2023年《非小细胞肺癌MET免疫组织化学检测和判读标准中国专家共识》,可以用于日常工作的指导和参考。

参考文献:

1. c-MET-integrin cooperation: Mechanisms, tumorigenic effects, and therapeutic relevance

2. 晚期非小细胞肺癌MET扩增介导获得性耐药的研究进展

3.Advances in MET tyrosine kinase inhibitors in gastric cancer

4.非小细胞肺癌MET免疫组织化学检测和判读标准中国专家共识(2023版)

5.MET alterations in NSCLC—Current Perspectives and Future Challenges

6.Non-small cell lung cancer with MET amplification:review of epidemiology,associated disease characteristics,testing procedures,burden,and treatments

7.MET-Dependent Solid Tumors: Molecular Diagnosis and Targeted Therapy

8.MET Exon 14 Skipping in NSCLC: A Systematic Literature Review of Epidemiology, Clinical Characteristics, and Outcomes

9.非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识



  1. 一文总结不同癌种HER2免疫组化、FISH如何判读?

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