再回首,数年前真是生信利好的时代!

学术   健康   2024-10-14 20:00   上海  

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2024-08-09

现在发生信论文基本都是要做实验验证的!相比而言,前几年真是生信论文利好的时代!随便在线数据库做做分析,就能发论文!Sirtuins家族是一类有抗衰老作用的去乙酰化酶,广泛存在于细菌、真核和哺乳动物。在人类中,Sirtuins家族由七个成员 (SIRT1-7) 组成。在细胞应对各种压力的反应(如氧化或毒性应激)中,Sirtuins基因发挥非常关键的作用。研究发现,适当的生活方式,如体育活动和饮食,可通过增加Sirtuins蛋白去乙酰化酶活性来影响健康寿命,但其在肿瘤免疫中的作用,尚不清楚

2022年1月,BioMed Research International杂志发表题为Bioinformatic Analysis of the Effect of the Sirtuin Family on Differentiated Thyroid Carcinoma的生信论文。完全通过在线数据库分析,探究了抗衰老基因Sirtuins家族在甲状腺癌中的作用。

摘要:Sirtuins与分化型甲状腺癌 (DTC) 的发生有关。然而,Sirtuins在分化型甲状腺癌中的作用及其临床价值仍然不明确。使用的数据库包括Oncomine、cBioPortal、Kaplan-Meier Plotter、GEPIA、THPA、LinkedOmics 和 GSCALite,没有湿实验。研究发现,分化型甲状腺癌组织中的SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5和SIRT6下调。而且,SIRT2、SIRT4和SIRT5的表达水平降低与晚期肿瘤分期相关。生存分析表明,SIRT4 mRNA 表达水平增加与分化型甲状腺癌患者的总生存期 (OS) 改善相关。此外,SIRT2、SIRT3、SIRT4和SIRT5 mRNA 水平高的分化型甲状腺癌患者具有更高的无病生存期 (DFS)。这些结果表明,SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5和 SIRT6 是分化型甲状腺癌治疗的潜在靶点,SIRT2、SIRT3、SIRT4和SIRT5是分化型甲状腺癌预后的新型潜在生物标志物。

差异分析(转录和蛋白水平)

相关分析

遗传分析

生存分析

信号通路

根据在线工具的结果,Sirtuins家族在分化型甲状腺癌中的表达差异和生存期的结果都没有那么好,也没有实验验证,但文章都发表了。上面的分析,有小伙伴可能不到半小时就全部复现出来了。

数年前,真是生信利好的时代!大家都轻松一下!

芒果师兄聊生信
1.生信技能和基因编辑。2.论文发表和基金写作。3. 健康管理和医学科研资讯。4.幸福之路,读书,音乐和娱乐。
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