2024-08-09
2022年1月,BioMed Research International杂志发表题为Bioinformatic Analysis of the Effect of the Sirtuin Family on Differentiated Thyroid Carcinoma的生信论文。完全通过在线数据库分析,探究了抗衰老基因Sirtuins家族在甲状腺癌中的作用。
摘要:Sirtuins与分化型甲状腺癌 (DTC) 的发生有关。然而,Sirtuins在分化型甲状腺癌中的作用及其临床价值仍然不明确。使用的数据库包括Oncomine、cBioPortal、Kaplan-Meier Plotter、GEPIA、THPA、LinkedOmics 和 GSCALite,没有湿实验。研究发现,分化型甲状腺癌组织中的SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5和SIRT6下调。而且,SIRT2、SIRT4和SIRT5的表达水平降低与晚期肿瘤分期相关。生存分析表明,SIRT4 mRNA 表达水平增加与分化型甲状腺癌患者的总生存期 (OS) 改善相关。此外,SIRT2、SIRT3、SIRT4和SIRT5 mRNA 水平高的分化型甲状腺癌患者具有更高的无病生存期 (DFS)。这些结果表明,SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5和 SIRT6 是分化型甲状腺癌治疗的潜在靶点,SIRT2、SIRT3、SIRT4和SIRT5是分化型甲状腺癌预后的新型潜在生物标志物。
差异分析(转录和蛋白水平)
相关分析
遗传分析
生存分析
信号通路
根据在线工具的结果,Sirtuins家族在分化型甲状腺癌中的表达差异和生存期的结果都没有那么好,也没有实验验证,但文章都发表了。上面的分析,有小伙伴可能不到半小时就全部复现出来了。
数年前,真是生信利好的时代!大家都轻松一下!