发表文章时，我们需要将测序原始数据上传到公共数据库。以前，我们只能上传到国外的NCBI或EBI等，现在需要上传到我们自己的国家基因组科学数据中心（NGDC）。该网站涵盖多个核心数据库资源，包括BioCode，BioProject，BioSample，BIT，GEN，GSA，GWH，GVM，MethBank和OMIX等。拿了纳税人的钱，就该这样办！![]()
网址：https://ngdc.cncb.ac.cn/
组学原始数据归档库（GSA）是组学原始数据汇交、存储、管理与共享系统，已获得国际认可。因此，我们不用担心上传数据到GSA不被期刊认可，也不用舍近求远上传到国外。首先，①准备要上传的原始数据，fastq、bam文件，网站只接受gzip和bzip2压缩格式；②获取MD5码。MD5码是用来校验递交的数据在网络传输过程中是否损坏或丢包，是由数字和英文字母组成的长度为 32 的定长字符串，一般测序公司返回的数据中会有。或者通过以下方式进行计算MD5码：Linux 用户使用 $ md5sum 命令计算；（输入md5sum 加文件名）Mac 用户使用$ md5 命令计算Windows 用户使用第三方工具进行计算，例如 winmd5free
然后，进入NGDC主页：https://ngdc.cncb.ac.cn/，登录。第一次使用需要注册。![]()
接下来，填写数据信息。GSA数据上传主要分两步：①提前申请Bioproject和Biosample登录号，一个Bioproject对应多个Biosample；②原始数据上传至GSA数据库。简单说是①创建BioProject ②上传元文件 ③上传测序数据，创建GSA。填写*的必填部分即可。![]()
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元文件上传
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上传测序数据，创建GSA
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FTP 客户端方式上传数据
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这些操作当中，元文件整理涉及很多细节，这个就在具体上传中逐步解决吧！
https://mp.weixin.qq.com/s/e3CDGIgQXleVf6mgxr_qWA
https://www.jianshu.com/p/555e42062233
