一篇顶百篇!万事开头难,从基因出发展开肿瘤免疫研究,这篇顶刊是典范!

学术   健康   2024-10-14 00:07   上海  
文献精读第六篇!本次分享探究从特定基因出发,做肿瘤免疫研究的策略。
在抗肿瘤免疫的条件下,肿瘤细胞衍化出多种逃逸机制以获得生存,表达抑制性膜蛋白分子PD-L1,分泌可溶性成分外泌体PD-L1等;还可以通过各种途径将效应 T 细胞,尤其是杀伤性CTL,囚禁在肿瘤微环境之外的区域,如骨髓、肝脏和引流淋巴管。
T 细胞与代谢(糖代谢、氨基酸代谢)的关系逐渐成为研究热点。研究发现,肿瘤细胞通过分泌可溶性分子PCSK9,抑制肿瘤细胞MHC 分子抗原肽的呈递,同时抑制 T 细胞的TCR表达,从而抑制抗肿瘤免疫。但是,PCSK9在 T 细胞抗肿瘤免疫中的作用,尚待研究。
2020年11月,杜克大学医学院Chuan-Yuan Li团队在Nature期刊上发表题为Inhibition of PCSK9 potentiates immune checkpoint therapy for cancer的论文。该研究发现,抑制PCSK9可显著增强小鼠的抗肿瘤免疫,而且联合免疫检查点治疗,效果更好
尽管免疫疗法对10-30%个体的长期存活有益,但是,多数肿瘤患者对免疫治疗无响应。该研究发现,在小鼠癌细胞中敲除PCSK9基因会以依赖细胞毒性 T 细胞的方式大大减弱或阻止其在小鼠中的生长 (Loss-of-funtion)。这里实验非常严谨,敲除PSCK9后,细胞在体外增殖没有变化,在体内增殖变慢,由此判断,肿瘤细胞增殖减慢不是PSCK9基因敲除导致的,而是其他因素导致的。
Fig2.PCSK9靶点联合PD-1治疗,肿瘤生长变慢,提示肿瘤免疫是肿瘤生长缓慢的原因。
Fig3.PSCK9靶点的抗肿瘤表型来自 T 细胞。
从机理上讲,基因敲除或使用抗体消除PCSK9表达,可增加MHC-I类抗原肽在肿瘤细胞膜表面的表达,从而促进细胞毒性 T 细胞在肿瘤内的浸润。PCSK9通过与MHC-I物理结合,并促进其在溶酶体中的迁移和降解来破坏MHC-I向细胞表面的再循环,实现免疫逃逸。
该研究揭示PCSK9与MHC-I类分子直接相互作用,并参与调控MHC I类分子在溶酶体内的降解。同时,抑制PCSK9,可以有效减少MHC-I类分子在溶酶体中的降解,显著提高肿瘤细胞表面MHC-I类分子的表达和抗原递呈,从而增强机体抗肿瘤免疫应答。
阅读文献的目的,除了了解新进展,更重要的是,如何开展新研究?脂代谢的其他基因,比如LDL-R,VLDL-R,HDL-R;肝X受体Α(LXRα,NR1H3)、肝X受体B(LXRβ,NR1H2);卵磷脂-胆固醇脂酰基转移酶,LCAT;胆固醇酯转运蛋白,CETP;卵磷脂胆固醇酰基转移酶,LCAT等也值得尝试。生信技能短时间内可以习得,这是一种简单的复制。从技能掌握到发表第一篇生信论文却不是短时间内可以做到的,因为涉及科研选题、研究设计和写作投稿等更多的技能。万事开头难,最难的可能还是候选基因的选择吧

关于这篇顶刊论文的研究,靶点基因的选择非常关键,可以说是决定了后续研究的高度;小鼠模型,从体外细胞增殖的探究,到体内细胞增殖的探究,都是常规实验,其实不难;关键是表型!PCSK9敲除后,不影响肿瘤细胞的体外增殖,但引起动物模型移植肿瘤生长变慢,这就是最好的表型!从基因出发,展开肿瘤免疫表型的研究,这篇文章算是典范!值得借鉴!


芒果师兄聊生信
1.生信技能和基因编辑。2.论文发表和基金写作。3. 健康管理和医学科研资讯。4.幸福之路,读书,音乐和娱乐。
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