自德运康瑞发布DynaSpatial HD空间转录组产品以来，这项技术凭借达到单细胞的空间分辨率、卓越的基因检测性能以及全面的产品方案，在小鼠卵巢、脑等器官组织和人多种肿瘤样本得到了测试验证和应用。高分辨率不仅提升了对细胞微环境的解析能力，还使得研究者能够更精确地捕捉细胞间的复杂信号通路和空间异质性。
此次产品升级，芯片尺寸从3mm提升到了6mm，这一改变至关重要，增大的芯片尺寸意味着可以同时捕获更大范围的样本，提供更为全面的组织空间信息。这种提升使得HD方案能够在更大尺度上展示细胞异质性和微环境复杂性，赋予研究者更大的灵活性和洞察力，使他们能够深入探究复杂生物系统中的精细结构和动态过程。DynaSpatial HD为科学研究开启了新的可能，为研究细胞微环境、细胞间信号通路以及空间异质性提供了全新的解决方案。![]()
DynaSpatial HD 6mm尺寸捕获芯片1) HD芯片 spot 直径 15 um，中心间距30um
2) 捕获区域面积：6mm x 6mm
3) 捕获区域spot数量：36864
4) 推荐测序量120~200G，根据组织类型和组织覆盖比例而定![]()
DynaSpatial HD捕获芯片示意图
建库方案：采用DynaSpatial探针法建库方案；测序：illumina Nova平台测序, 测序量33G；
测试结果：原始数据通过自主开发DynamicST软件进行序列比对和数据拆分，生成spot-基因表达矩阵。测试结果显示小鼠胚胎组织覆盖21181个有效spots，在68.65%的测序饱和度下，基因中位值1254 genes，捕获基因总数达到16576个，数据表现优异。加测后基因中位值预计会提升到2000以上，更多指标请见下方summary report。 空间分群聚类与特征基因分布：
基于DynaSpatial探针法检测得到的基因表达矩阵进行T-SNE无监督聚类，spots分成17个不同的clusters，并进行可视化展示。如图2所示，从分群结果来看，聚类结果能够更加细腻高清地展现了小鼠胚胎组织中各个组织结构和分子表达特征，能够为组织胚胎发育研究提供单细胞分辨率的空间分子图谱。 通过分析空间转录组数据，我们能够深入研究分子和细胞的空间分布特性，并识别出不同clusters或组织区域的特异性基因表达模式（见图3）。例如，Krt5作为胚胎表皮细胞的标志基因，主要在外围区域的spots中表达；Cryba2基因主要在眼睛区域表达，对晶状体的发育具有关键作用；Pax6基因则主要分布在脑部和眼部区域，在神经组织和眼睛发育中扮演着核心角色；Hoxa11基因主要在胚胎的肢体区域表达，在小鼠肢体发育过程中发挥着至关重要的作用；Col2a1在软骨形成和发育中起关键作用，尤其是在胚胎发育过程中。这些发现再次验证了DynaSpatial HD在空间基因检测方面的准确性，展现了其对识别和解析组织内复杂生物学过程的强大能力。 图3 不同组织区域特征表达Marker genes小鼠脑实测数据展示
样本：小鼠脑新鲜冰冻样本(客户样本)；
建库方案：采用DynaSpatial探针法建库方案；
测序：illumina Nova平台测序, 测序量140G；测试结果：原始数据通过自主开发DynamicST软件进行序列比对和数据拆分，生成spot-基因表达矩阵。测试结果显示小鼠胚胎组织覆盖35259个有效spots，在83.02%的测序饱和度下，基因中位值2288 genes，捕获基因总数达到17128个，数据表现优异。空间分群聚类与特征基因分布：
DynaSpatial HD 可达到近似单细胞分辨率，切片形态与UMI分布结果完美结合，可实现对疾病的深度探索。以小鼠脑组织为例，从分群结果来看，聚类结果基本能够有效区分不同的组织区域，从而实现对组织结构的空间精细化解析（见图5）。
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图5 小鼠脑UMI数量分布和降维聚类结果DynaSpatial捕获芯片规格
DynaSpatial目前已推出常规透化捕获方案和基于探针法捕获解决方案，值得注意的是本次推出了HD 6mm尺寸芯片兼容这两种捕获建库方案，广泛适用于不同样本类型（FF/FFPE/Fixed Frozen），为了不同研究领域样本类型需求可以匹配最佳的面积及分辨率，我们仍然保留HD 3mm尺寸芯片选择。因此，至今DynaSpatial捕获芯片常规分辨率（spot 50 μm）可以提供7.5mm×7.5mm 和10mm×10mm尺寸选择，HD高分辨率（spot 15 μm）可提供3mm×3mm和6mm×6mm尺寸选择。 如果您对DynaSpatial产品方案或者技术服务感兴趣，联系方式如下：
联系方式：18754283392 (微信同号)
或者发邮件到：support@dynamic-biosystems.com关于德运康瑞
德运康瑞致力于空间组学技术的国产创新，在空间组学领域及其临床转化上处于行业领军地位。公司拥有领域内全球技术发明人级别的资深科学家，在国内率先推出具有亚细胞分辨率的空间原位测序(ISS)技术，并与多家顶尖医院临床转化合作，有望成为革命性的临床病理工具。公司自研DynaSpatial空间转录组系列商业化产品，用高密度创新修饰技术，助力科学家发现更多的空间低表达基因。公司致力于推动空间组学技术应用在生命科学和临床医学，为人类健康事业贡献中国智慧。公司2020年成立以来，先后获得顶尖投资机构超过2亿元的多轮投资，公司技术多次获得学术顶刊（如Cell, Nature Biotechnology, Nature Neuroscience, Immunity等）发表和认可。同时，公司近来先后获评“苏州市独角兽培育企业”、“江苏潜在独角兽企业”、“国家级高新技术企业”。
