1971年8月下旬，陈伯达上庐山会议后，再也没“下来”的一年后。毛主席巡视南方，将南方重要的省市领导都找去谈话。谈话内容对外绝对保密，除当事人外，没人知道。但从事件的后续发展，从知情人士的“不经意间”泄露，应该是关于林帅思想的。
9月3日，毛主席专列抵达杭州，中办厅的汪东兴、张耀祠，把浙江省革委主任南平、第一副主任陈励耘、南京军区副司令兼浙江省军区司令熊应堂喊上专列。毛主席当众批评了陈励耘：“你在庐山犯了错误！吴法宪将你和王维国串联在一起！”陈励耘耷拉着脑袋，承认了错误。
到9月10日下午，毛主席突然离开杭州，陈励耘没收到任何消息，直到列车开动才知道；陈励耘预感到一些说不清、道不明的大事即将发生。9月19日晚，陈励耘结束了一天的工作，跟妻子、小女儿一块住了一晚。次日，陈励耘刚到工作地，南平的电话就打来，说接到上海王洪文的电话，中央有个重要文件到上海，不发省里，叫他跟自己去看。
陈励耘不疑有他，问：“什么时候走？要带什么吗？”南平回：“下午三点走。什么都不必带，看完文件就回来。”去上海的路上，陈励耘乘坐的“伏尔加”行驶不慎，翻车到了田里。幸好附近有在劳动的社员，这才合力将车子拉了上来。
陈励耘一行到上海时，已是晚上8点，车在锦江饭店门口停下，王洪文的秘书出来迎接。王秘热情地跟南平握了手，但陈励耘伸手过去时，王秘却装作没看见，十分干脆地把手缩了回去。陈励耘不由一愣，一股不祥的预感涌上心头。没等陈励耘想明白，王秘就说跟来的秘书和警卫，全部到另一个地方休息。
王秘领着陈励耘一行进屋。上海市革委主任王秀珍跟南平、王秀珍都握了手，陈励耘的心才从嗓子眼落下去了一些。进入礼堂后，王洪文也没有寒暄，直接说中央文件的事，他把文件递给陈励耘，看着南平说：“你就不用看了吧。”
陈励耘屏住呼吸，看起了这份里外都透露出不寻常气息的文件。这份文件是对“九一三”事件的记录，当时只在中央小范围内传播，陈励耘应该是最早一批知道“九一三”的地方领导。陈励耘看完，全身血液像是凝固了一般，双手略微颤抖，不敢相信自己看到的这些东西。
王洪文用一种异样的眼光死死盯着陈励耘，用嘲讽的口吻问：“看完了吗？”陈励耘答：“看完了。”王洪文接着清了清嗓子：“现正式宣布。根据毛主席最高指示，逮捕你！”陈励耘闻言，头上像是被大锤砸了一下一样。陈励耘还没弄明白这是什么意思，旁边就跳出两个人，将他控制住。
王洪文说：“陈励耘同志，这是毛主席的指示，我王洪文是没有权力逮捕你的。”陈励耘没有吭声，只是苦笑了一下。三个月后，陈励耘被免职和开除党籍。在陈励耘频繁受审时期，许世友找到了他，一见面就板着个脸，厉声问道：“老陈，你为什么要谋害毛主席！”
许世友是陈励耘的老上级，刚正不阿、嫉恶如仇，对毛主席的感情更是无比深厚。见到许世友，陈励耘犹如见到救星，他把自己的委屈和苦衷说了出来，求他为自己开脱。但这件事就连不相干的周总理来帮忙都不行，何况作为他老上级的许世友？
听到陈励耘的“坦白”，许世友脸色一沉：“《封神榜》六十回，说书人回回有个交代，你不交代是不行的。”许世友没有给予任何承诺，但从“文革”结束后，军事法庭对陈励耘免予起诉的结果看，许世友应该是扶了老下属一把的（当然有考虑到他实际参与程度的情况）。
不过，陈励耘也是受到了应有的惩罚，坐了十年的牢。
