导致特定基因型癌症的生理和环境因素在很大程度上尚不明确。即使在健康组织中出现致癌突变,生理、免疫和表观遗传变化的共同作用最终也可能引发肿瘤发生。肥胖是多种癌症的风险因素,且研究显示,降低肥胖的医疗干预措施有助于降低癌症风险。肥胖通常伴随全身免疫监视、代谢和炎症的改变,这些变化或许塑造了癌症特定驱动突变的选择压力,将肿瘤内在基因型的演变与整体健康状况紧密关联。
在人群中探究体重指数(BMI,肥胖的定量指标)与特定肿瘤基因型之间的关系,需要结合大规模临床和基因组数据。然而,至今在大规模癌症基因组数据集中,这方面的数据仍相对缺乏。
近日,美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心Ed Reznik课题组在Nature Genetics杂志上发表了题为Obesity-dependent selection of driver mutations in cancer的研究论文,研究人员系统地提取了34,274名通过纪念斯隆凯特琳癌症中心MSK-IMPACT临床测序平台进行分析的患者的BMI及人口统计信息,并通过建模341个癌症相关基因的突变率,评估BMI与肿瘤基因型之间的统计关联。仅分析经食品和药物管理局认可的数据库注释的致癌突变,我们在三种癌症类型中识别出六个基因,这些基因在特定癌症类型中与BMI显著相关(q < 0.05)。
在肺腺癌中,KRAS、SETD2和PPP2R1A基因在肥胖患者中表现出更高的突变频率,而EGFR在同组患者中突变频率较低,尽管具有SETD2和PPP2R1A突变的患者数量有限。此外,我们发现BAP1在原发灶不明的癌症中与BMI呈正相关,POLE则在子宫内膜样癌中与BMI呈负相关。同样在子宫内膜样癌患者中,POLE突变与低BMI相关。而在基因-癌症类型水平上,静默突变(假设在中性选择下)与BMI之间无显著关联,且拷贝数变异与BMI之间也未见显著关联。
原文链接:
https://doi.org/10.1038/s41588-024-01969-3
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