Mol Cell|革新认知:探讨RNA聚合酶重塑染色质结构

文摘   2024-08-28 22:34   美国  


RNA 聚合酶(Pol)必须在复杂的染色质环境中启动和暂停,染色质纤维周围的核小体和其他转录机制形成了一个既适合竞争又适合协调的空间排列。然而,由于传统结构和测序方法的局限性,这些关系的具体细节仍然知之甚少。

近日,美国华盛顿大学Andrew B. Stergachis课题组在Molecule Cell杂志上发表了题为「RNA polymerases reshape chromatin architecture and couple transcription on individual fibers」的研究论文,研究人员在果蝇中采用了长读染色质纤维测序(Fiber-seq)技术,以单分子精度在长达 30 kb 的纤维上可视化 RNA 聚合酶(Pol)在其天然染色质环境中的行为。

研究表明,Fiber-seq 能够识别单个 Pol II、核小体和转录因子足迹,揭示了 Pol II 暂停如何驱动下游核小体的不稳定。研究人员还发现,邻近的 Pol II 基因、Pol III 基因和转录增强子之间存在直接的距离依赖性转录耦合,这种耦合受局部染色质结构的调节。

总体而言,转录起始过程会重塑周围的核小体结构,并将附近的转录机制沿着单个染色质纤维连接起来。此研究揭示了染色质结构与转录之间的复杂互动,为理解基因调控机制提供了新的视角



原文链接:

https://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(24)00667-1



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