近日,美国华盛顿大学Andrew B. Stergachis课题组在Molecule Cell杂志上发表了题为「RNA polymerases reshape chromatin architecture and couple transcription on individual fibers」的研究论文,研究人员在果蝇中采用了长读染色质纤维测序(Fiber-seq)技术,以单分子精度在长达 30 kb 的纤维上可视化 RNA 聚合酶(Pol)在其天然染色质环境中的行为。
研究表明,Fiber-seq 能够识别单个 Pol II、核小体和转录因子足迹,揭示了 Pol II 暂停如何驱动下游核小体的不稳定。研究人员还发现,邻近的 Pol II 基因、Pol III 基因和转录增强子之间存在直接的距离依赖性转录耦合,这种耦合受局部染色质结构的调节。
总体而言,转录起始过程会重塑周围的核小体结构,并将附近的转录机制沿着单个染色质纤维连接起来。此研究揭示了染色质结构与转录之间的复杂互动,为理解基因调控机制提供了新的视角。
原文链接:
https://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(24)00667-1
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