这是一则迟到的消息：
2024年9月18日，法国单细胞RNA测序初创公司Scipio bioscience对外宣布停止运营。
“有时，即使是最强大的火箭也无法到达星空。
经过七年的不懈努力，一支由实验室科学家、生物信息学家和销售专家组成的优秀团队，以及一群聪明的顾问和合作者的支持，我们不幸遇到了无法克服的挑战，必须宣布 Scipio 冒险即将结束。”
Scipio总部位于巴黎，致力于开发创新的单细胞样本制备和数据分析解决方案。其核心是专利的 RevGel技术，是一种创新的可逆水凝胶，由其总裁兼联合创始人、世界著名生物物理学家 Stuart Edelstein 教授构想而成，经过四年的研究和开发。
Scipio早期由政府资助，并获得 Seventure、M Ventures、High-Tech Gründerfonds、Financière Arbevel 和 Verve Ventures等的投资。
基于RevGel技术，Scipio开发、制造和销售单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）的实验室试剂盒Asteria和分析软件Cytonaut。
在诸多的单细胞组学技术路线中，Scipio提供了一条独特的无需仪器的路线。
RevGel-seq是一种基于可逆水凝胶技术的 scRNA-seq 制备方法，主要特点之一是使用水凝胶物理隔离标有 DNA 条形码珠子的细胞。这中间包括可逆水凝胶的液体-凝胶-液体状态的转换。由于细胞之间的物理分离和水凝胶内有限的自由移动，细胞特异性 mRNA 在细胞裂解后会与条形码珠子结合，因为它们的物理距离很近。然后回收珠子，扩增 mRNA 并送去测序。文末对于RevGel-seq的具体工作流程做了解读说明。
mRNA通过水凝胶得以保留在它原本的位置，而高性能水凝胶技术可以避免机械压力造成的细胞损伤，可以随时处理细胞，而处理后的细胞进行冻存也不会改变scRNA的制备性能，这样也可方便处理感染性样本。在整个处理过程中无需固定、涡旋或冷冻等步骤，不会造成转录组数据、基因表达等的状态。这已证明对多种样本类型都有效。得益于 Asteria 灵活的工作流程，样本可以在不同时间点移交给核心平台进行测序。
测序输出使用 Cytonaut进行评估和显示，这是一个基于云的数据分析平台，包括预处理和后处理以及交互式数据可视化。
2022年初，Scipio宣布在欧洲推出其基于 Asteria 水凝胶的单细胞 RNA 测序试剂盒，之后也未看到在其他地区继续推出Asteria。
总体而言，与主流基于液滴的单细胞技术相比，所呈现的结果确立了 RevGel-seq 的性能水平，并说明了临床相关的应用。
RevGel-seq的工作流程仍然使用了珠子，未配对的珠子往往倾向于结合更多非特异性 RNA，这会给数据增加背景噪音。同时，尽管水凝胶在物理上限制了细胞，但它仍然会有一定程度的扩散。
Asteria首款试剂盒可为 4 个样本各制备 10,000 个细胞，RevGel只能实现约 45% 捕获率，在前段时间Genetech发表的十种商业化试剂盒的基准测试中，Asteria是表现较差的试剂盒之一。
Scipio旨在让任何研究人员都可以进行单细胞研究，而无需使用复杂而昂贵的仪器，不受样本制备方法的成本限制。
但遗憾的是，最终Scipio没能持续领导这场革命...
“创业冒险可能会令人谦卑，但我们仍然坚信，我们每个人都将继续建立我们的科学理解，并提出创新，造福大众。
下次挑战见！”
《正文完，对于RevGel-seq具体实施感兴趣的可以继续往下》
这里可以稍微阐述一下RevGel-seq的样品制备工作流程。
