mNGS的对手,是tNGS吗?

文摘   财经   2024-09-09 16:16   广东  





偏听则暗、兼听则明‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍

——前言‍‍‍‍‍‍






上周在聊那篇关于感染NGS的柳叶刀子刊时,我们调侃的说了一句话‍‍‍‍

好像只有mNGS玩家受伤的世界达成了😂

有趣的胖子本尊,公众号:有趣的胖子万里挑一tNGS的路线之争:多重扩增or探针捕获?柳叶刀子刊给出“答案”

单就我们得出结论的显性证据来看,不管是“价格偏贵”、“无法单一流程实现DR共检”还是“漏检肺孢子菌”,确实都对mNGS颇为不利。

但,这是全部的事实吗?

如果真的全面落后,那mNGS为什么没有被市场完全淘汰掉?‍‍‍‍‍‍‍

那篇文章里面,是否还有一些“暗面”的证据是被我们忽略了‍‍‍

比如三个问题:

  • 谁能体现病原真实占比?‍‍‍

  • 谁有近源物种的区分能力?‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍

  • 谁具备少见病原的检测能力?

微岩医学是这篇子刊中未署名的“第三者”,作为“被迫”参赛的选手,它的mNGS被放在了聚光灯下

如果补上mNGS的视角,会是什么样的?

微岩医学的郑亚风博士和王娜博士,有话要说:

PS:本文来自读者投稿,除最后一段外不一定代表我的观点(哈哈,甚至有点被打脸),但我非常欢迎这样的交流,每个人都有自己的bias,偏听则暗,兼听则明‍‍‍‍

01

两种tNGS和mNGS的比较

以下是来自郑博士和王博士的解读,已获得授权,内容未改。

但我先挑出最核心的三个问题

1. 谁能更好的体现病原真实占比并区分近源物种?

2. 谁能具备少见病原的检测能力?

3. 谁在重点病原的检测能力最强?

我个人觉得,看完这三个问题,已经可以去留言区交流了。

汇总的结论在这:

下载的链接如下:

给郑博士和王博士点赞,给我们理解这篇SCI提供了一个新的视角。

以下内容就不代表二位的观点了

02‍‍

回归“场景”

这是最好的解读吗?我持保留态度。

解读也许客观的展现了mNGS的一些优势面,但并不足够。

还是上次那句话

“尺有所短,寸有所长”,不同的临床场景需要不同的产品特性。

有趣的胖子本尊,公众号:有趣的胖子万里挑一tNGS的路线之争:多重扩增or探针捕获?柳叶刀子刊给出“答案”

mNGS被tNGS偷家也许有产品性能上的原因,但更大的可能是定位:

“对于绝大多数mNGS预设的临床场景,一个更快、更便宜、能实现95%替代的tNGS,足够了”

因此,相比于去“证明”我比tNGS某些方面更强,mNGS更需要被回答的问题是:

mNGS列举的这些优势在临床应用中存在的价值有吗?有多大?有多少?

但其实还可以再多问一句:

抛开“从哪里跌倒就从哪里爬起来的”的执念,mNGS的对手,真的是tNGS吗?

时至今日,tNGS和mNGS依然未能“插手”最大的门诊检测市场,核心就在TAT上。

今天华大cyclone的发布会反而让mNGS有了率先突破的可能性:

“非靶向”2.5小时的TAT,有望将mNGS的“样本→报告”的时间压缩到4小时以内。

而“靶向”5.5小时的TAT,则依然将tNGS的“样本→报告”时间卡在了7-8小时。

而门诊检测的“敲门砖”,是当天出报告。

在纳米孔的助力下,mNGS有望比tNGS更早一步迈入门诊检测的大门。

把目光放在与多重PCR的门诊缠斗而非与tNGS的历史恩怨,也许才是mNGS玩家们的真正机会。

今天发布会的最后一个环节,mNGS五虎除了予果之外悉数到场上台。

也许真如段子调侃的那样:

仔细一听是纳米孔的声音

“你们趁现在多吃点吧!未来是属于我的!”

有趣的胖子本尊,公众号:有趣的胖子万里挑一感染诊断,组了个江湖饭局

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这周估计好玩的话题很多‍‍‍‍
但坏消息是‍‍‍‍‍‍‍‍‍
这周上六天班

有趣的胖子万里挑一
写写肿瘤NGS行内人、行内事,主要还是瞎比比
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