艾滋病的起源、进化史和宿主选择压力的进化情况是一个复杂且引人关注的话题。
艾滋病病毒（HIV）的祖先被认为是猿猴免疫缺陷病毒（SIV），出现时间不晚于1400万年前。SIV在猴类中的传播十分广泛，并且最终演化出了两大分支，即现今所称的艾滋病1型（HIV-1）和艾滋病2型（HIV-2）。
HIV-1型主要来源于非洲黑猩猩（SIVcpz），而HIV-2型则来源于西非白眉猴（SIVsm）。
HIV-1型可以进一步分为M、N、O和P四组，这些病毒由不同毒株独立进化而来。其中M型是HIV-1型的第一大超级分支，又分为12个主要分支，命名上从M-a，M-b，M-c，M-d，M-e(ae)，M-f，M-g，M-h，M-j，M-k，到M-1。
HIV-1型M组病毒是全球流行的主要类型，占全球感染病例的90%以上。M组下又分为12个主要分支，存在成千上百个更小的分支类型。
一种理论认为，SIV从猿猴传播到人类可能是由于猎人在捕杀黑猩猩时接触到其血液，导致病毒传播给人类。此外，1920年代刚果推广注射医疗，欠缺消毒的针头可能加剧了HIV的传播。
幸运的是
人类6号染色体上的rs9264942位点，当表达形态为CC和CT时，能有效降低HIV载毒量，延缓发病时间。
CCR5基因的突变，如CCR5-Δ32和CCR5-893（−）突变，对部分类型HIV具有免疫作用。这些突变最早发生在欧洲人身上，因此欧美白人携带这种有利突变的数量较多。AIDS研究 | 她是全球第8例艾滋病治愈患者
地域和人群分布
CCR5-△32突变基因在不同地区和人群中的分布情况不同，这可能与HIV感染率和治疗响应有关。
HIV病毒在宿主体内的进化受到宿主环境的影响，不同的宿主环境驱动HIV-1进入表型和其他信息变异的进化选择。
HIV是一种变异性很强的病毒，各基因的变异程度不同，env基因变异率最高。HIV发生变异的主要原因包括反转录酶无校正功能导致的随机变异、病毒在体内高频率复制、宿主的免疫选择压力、病毒DNA与宿主DNA之间的基因重组等。
参考文献：
m.sohu.com/a/54178762_354970/?pvid=000115_3w_a
zhuanlan.zhihu.com/p/681380251
