在pubmed的花园中挖呀挖呀挖。。。哎呀呀,不小心挖到一本毕业神刊~
宝子们,生信湾这回可是捡到宝了,本来只是随便逛逛,给大家找找网药方面的新文章,结果发现了一本宝藏期刊——International Journal of Biological Macromolecules。这是一本研究天然大分子化学和生物方面的国际期刊,目前属于中科院1区Top期刊,最新IF=7.7,年发文5471篇,审稿速度也比较快(官方给出:从提交到接收82天)→PS:但其实生信湾发现:好多文章是一个多月接收,就比如今天要分享的这篇(43天接收),以及明天将要分享的一篇(31天接收,一起期待下~)。非OA模式下无需版面费,最重要的是该期刊生信友好,只要文章提出生物大分子就可以投,感兴趣的小伙伴可以收藏一下哈~
今天要分享的这篇文章是你们感兴趣的网药方向,作者深入研究了山莨菪碱在应对LPS诱导的心肌和内皮损伤方面的潜在作用。运用网络药理学、分子对接、多种细胞实验及体内实验方法,全面剖析了山莨菪碱如何通过调节相关细胞的功能、影响外泌体介导的信号传递来减轻心肌损伤。文章干湿结合,是一个非常不错的设计,一起来学习吧!
PS:网药分析学不会入门难?有了ideal却卡在分析上?快来联系生信湾吧,尽量让你的科研少走点弯路~
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l题目:内皮来源的外泌体:一种用莨菪碱治疗 LPS 诱导的心肌损伤的新型治疗策略
l杂志:International Journal of Biological Macromolecules
l影响因子:IF=7.7
l发表时间:2024年11月
(注:公众号后台回复“123”获取文献全文!文献编号:20241126)
研究背景
本研究先培养细胞并检测不同处理对细胞的影响,接着通过多种实验方法评估山莨菪碱的作用,包括对炎症、氧化应激、线粒体损伤等方面,最后进行体内实验验证其对小鼠心肌损伤的保护作用
研究思路
研究先培养A16细胞和HUVECs,用LPS和山莨菪碱处理,通过多种实验测定细胞活力、炎症因子等指标,利用网络药理学和分子对接分析潜在靶点和通路,再进行共培养实验及体内外实验,最后综合分析得出结论。
主要结果
1、山莨菪碱对LPS处理的细胞影响
LPS抑制A16细胞和HUVECs活力,后续用80μg/mL LPS实验。山莨菪碱(654 - 1/ - 2)除160μg/mL外对细胞活力影响不大,其能逆转LPS对A16细胞炎症、线粒体损伤,对HUVECs炎症、氧化损伤、糖萼脱落的影响,还抑制细胞凋亡。
图1 细胞活力、炎症因子、线粒体相关指标、凋亡等实验数据
2、山莨菪碱治疗相关潜在靶点与通路分析
通过网络药理学分析确定28个山莨菪碱治疗感染性心肌和内皮损伤的潜在靶点,构建PPI网络并可视化。GO和KEGG富集分析分别明确相关调节因子定位与关键通路。分子对接显示山莨菪碱与靶蛋白结合能低且亲和力强。
图2 Venn图、PPI网络、GO和KEGG富集分析及分子对接结果
3、山莨菪碱在共培养体系中对A16细胞的保护作用
LPS - ECs抑制A16细胞增殖、诱导炎症、心肌和线粒体损伤及凋亡,654 - 1/ - 2处理的ECs可逆转这些不良影响,恢复相关指标,调节基因表达。共培养24h,12h和24h对增殖影响无显著差异。
图3 共培养实验中各项指标变化及相关基因表达情况
4、山莨菪碱对小鼠ECs - exo致心肌损伤的保护作用
DiI标记的ECs - exo主要分布于小鼠胸腹区。LPS - ECs exo改变小鼠心脏功能、损伤心肌组织、升高炎症和损伤标志物水平,654 - 1/ - 2处理的ECs - exo可逆转这些变化,保护心肌,正常ECs - exo影响不显著。
图4 ECs - exo在小鼠体内分布及对心脏功能、心肌组织和相关标志物影响的结果
文章小结
这篇文章采用了网络药理学、分子对接、体内外实验相结合的方法,深入探究了山莨菪碱的作用机制,为治疗心肌损伤提供了新的思路和潜在靶点。实验设计严谨,数据丰富详实,研究兼具创新性与临床意义,值得我们深入学习。中医药如今也得到了国家的大力扶持,小伙伴们一定要把握住哦,需要方案设计或者生信分析的记得滴滴生信湾哦~
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