生信湾又双叒叕在知识海洋中奋力“挖宝”啦！这次为药学和植物科学领域的小伙伴们挖掘出一本超棒的期刊——Drug Design Development and Therapy（中科院二区，4.8分）。网友反馈审稿速度较快，并且编辑比较nice，关键对网络药理学也非常友好，这可提起了生信湾的兴趣！这些优势对毕业党非常友好，感兴趣的朋友快来试试这本期刊吧~ ~（感觉【期刊推荐】内容对你有用的话，还请多多关注“生信湾”公众号哦，更多内容敬请期待！）
话不多说，直接上干货！来看四川大学华西医院团队发表在这个期刊上的文章，该篇不仅仅打破常规网络药理学进行分析，还结合了代谢组学、分子对接和动物实验等方法，多角度探究地黄在抗血栓方面的作用机制，结果可靠性且完整。
PS：想做网药但缺乏灵感的宝子们，生信湾可以帮你出谋划策啊，技术上的难题可以找生信湾来解决，想复现不是难事，生信湾帮您最大程度节约成本和时间，助力您的科研路~
l题目：地黄提取物治疗血栓形成机制的整合代谢组学和网络药理学研究
l杂志：Drug Design Development and Therapy
l影响因子：IF=4.7
l发表时间：2024年10月
（注：公众号后台回复“123”获取文献全文！文献编号：20241113）
血栓严重危害健康，现有治疗药物受限，寻求安全有效的替代药物迫在眉睫。地黄作为传统中药，其抗血栓作用虽有一定研究，但具体机制及物质基础不明。本研究整合代谢组学与网络药理学，旨在揭示地黄抗血栓机制，为临床治疗提供依据，推动中药现代化研究。
1. 建立模型与分组给药：建立大鼠血栓模型，分正常、模型、阿司匹林及不同剂量地黄组，给药后诱导血栓，采集样本。
2. 药效评估：测量血栓长度、检测凝血指标及相关因子水平，评估地黄抗血栓药效。
3. 代谢组学分析：对血清样本进行处理和UPLC Q - TOF/MS分析，确定差异代谢物及相关通路。
4. 网络药理学研究：筛选化合物及靶点，构建网络，分析潜在靶点和通路。
5. 整合分析与验证：整合代谢组学和网络药理学结果，确定关键靶点和化合物，用分子对接验证相互作用。
1. 地黄提取物中成分含量测定
选择梓醇、地黄苷D、桃叶珊瑚苷和筋骨草醇为代表化合物测定含量，经HPLC分析及标准曲线计算，其含量分别为4.85±0.85mg/g、4.38±0.13mg/g、0.57±0.02mg/g和5.50±0.15mg/g，为明确地黄提取物关键物质基础提供数据支持。
2. 地黄对大鼠血栓改善作用
与模型组比，不同剂量地黄给药后大鼠血栓长度缩短，凝血功能改善，ET - 1/NO、TNF - α和IL - 6水平降低，且呈剂量依赖性，高剂量地黄（RR - H）效果显著，表明地黄有抗血栓作用。
图1：大鼠尾部血栓形成情况（图1A）、凝血功能指标（图1B - E）、血清相关因子水平（图1F - J）
3. 地黄对耳和颈动脉组织病理学损伤的改善
模型组大鼠耳和颈动脉有血栓病理特征，地黄治疗后损伤减轻。RR - L组耳组织中度充血和少量炎细胞浸润，RR - M组轻度充血，RR - H和AP组无组织病理学损伤，说明地黄可改善血栓导致的病理损伤。
图2：耳和颈动脉HE染色切片代表性图像
4. 代谢组学分析
PCA显示各处理组代谢谱有差异，OPLS - DA筛选出13种关键差异代谢物，如PC（20:2（I1Z,14Z）/14:0）、花生四烯酸等。代谢通路分析发现地黄治疗影响花生四烯酸、鞘脂和甘油磷脂代谢等通路。
图3：PCA得分图
图4、图5 ：OPLS - DA得分图
图6：差异代谢物相对含量变化（图6A - M）、代谢通路分析结果（图6O）
5. 网络药理学研究
从数据库筛选出24种合格RR化合物及362个靶点，与954个血栓相关靶点取交集得97个潜在靶点。GO和KEGG分析显示相关通路受影响，构建化合物 - 靶点 - 通路网络，发现关键化合物。
图7：潜在靶点韦恩图（图7A）、KEGG富集分析（图7B）、GO富集分析（图7C）、化合物 - 靶点 - 通路网络（图7D）
6. 代谢组学与网络药理学整合分析
构建交互网络，确定四个枢纽靶点（PLA2G2A、CYP2C9、PTGS1、ALOX5）、两个关键代谢物（PC（20:2（I1Z,14Z）/14:0）和花生四烯酸）及四个相关化合物，表明它们在地黄抗血栓中起重要作用。
图7：化合物 - 靶点 - 代谢物网络（图7F）
7. 分子对接验证
分子对接显示梓醇、阿魏酸甲酯、4 - 羟基肉桂酸甲酯与关键靶点有高亲和力，如梓醇与PLA2G2A结合能为 - 5.12kcal/mol，形成氢键，验证了关键化合物与靶点相互作用可能性。
图8：分子对接结果
综上，本研究运用代谢组学、网络药理学、分子对接以及动物实验等手段揭示了地黄提取物（RR）对血栓的有效治疗作用。中医药文化源远流长、博大精深，对各类疾病的研究有着重要的启示意义，无论是何种研究方向，在中医药领域几乎都可以“对症下药”。倘若你也想体验“代谢组学+网络药理学+干湿结合”这种高效发文的乐趣，生信湾将是你的理想之选，专业团队助力您的科研之路迈向新高度！
定制生信分析
云服务器租赁
扫码加群合集 · 推荐
注：本文为原创编译，非声张版权，侵删！
