重磅!“棕榈酰化”频频登陆Nature/STTT/Gut/NC等各大顶刊!生信挖掘抓紧提上日程!

文摘   2024-11-15 10:01   上海  


经常有宝子问生信湾,现在的热点方向虽然多,但是有发文需求的人也多,好不容易想好了一个方向,一搜已经有人发表了……该怎么办呢?
这种难题找生信湾就对了!
首先,如果有人已经发表了,发表的文章做了哪些分析呢?有没有可以进一步完善的思路呢?生信湾每天都在做着各种生信数据挖掘工作,最擅长的就是设计各种不同的分析思路,即使是同一种疾病同一个热点。所以,这方面遇到难题的小伙伴尽管来找生信湾就可以~

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言归正传,今天生信湾的主要目的是给大家推荐一个新的热点方向——棕榈酰化。
  • 什么是棕榈酰化?
棕榈酰化修饰(S-palmitoylation,或称S-acylation)是一种广泛存在于生物体内动态、可逆的翻译后修饰形式,是指长链脂肪酸(通常是指16个碳的棕榈酸)通过硫酯键共价修饰到蛋白质半胱氨酸残基上,其在调控蛋白质的转运、细胞定位和稳定性等方面发挥重要作用,并且与许多疾病的发生、发展关系密切。
  • 为什么要推荐棕榈酰化?
首先,类比乳酸化,这个方向今年高分文章频出,已发表的文章中超过10分的已有80多篇其中不乏顶刊Nature,STTT,Gut等。    
题目:ROS依赖性S-棕榈酰化激活裂解的和完整的GSDMD

题目:棕榈酰化通过调节中枢神经系统中的ZDHHC3-Cadm4轴来调节髓鞘形成

这篇文章研究的是昼夜节律紊乱如何在睡眠不足(SD)增加的肿瘤发生中被感知。通过无偏性转录组学和代谢组学分析均显示,脂肪酸氧化可以感知到SD引起的昼夜节律中断,表现为棕榈酰辅酶A (PA-CoA)持续增加。

这篇文章研究的是PI3K-AKT通路是否以及如何导致高脂肪诱导的非酒精性脂肪性肝炎(NASH)和肝细胞癌(HCC)。通过代谢物文库筛选发现棕榈酸可激活AKT。最终,作者发现了PA-ZDHHC17/24介导的棕榈酰化对AKT的一种新的微调调节,并强调了通过限制棕榈酸饮食、限制棕榈酸合成或直接靶向AKT棕榈酰化来治疗肿瘤的策略。

题目:ZDHHC20介导的YTHDF3 S-棕榈酰化稳定MYC mRNA促进胰腺癌进展

以上这些高分文章都是从棕榈酰化的角度出发进行的研究。大家想深度了解哪篇文章可以私生信湾哦~

这么多高分文献足以证明棕榈酰化的热度,但是目前生信数据挖掘相关的文章却很少。
生信湾尝试以“s-palmitoylation TCGA”为关键词只找到一篇纯生信研究(近一年的数据),TCGA换成GEO后没有检索到相关文献。
    
所以,这正是生信湾今天给大家推荐这个热点的最重要的原因。
选择一个创新性高的方向往往比埋头苦干更有价值,好思路不等人,被抢发就没地哭啦~如果你也想抓住这波热度,就抓紧联系生信湾吧!生信湾这里有专业团队1V1服务,思路设计、生信分析、生信服务器应有尽有,全方面助力每一个科研梦想! 

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