“生信湾，救急！导师给我布置了中药XXX的课题，我现在脑袋空空，完全不知道从哪儿下手，这可如何是好啊！”
“组会的时候老师强调，做研究得在经典套路里玩出新花样，才能算创新。可这‘新’到底该咋整啊？感觉比登天还难！”
“我总觉得做中医药课题发文章太难了，虽说前景不错，但那些高分SCI期刊怎么努力都够不着，仿佛有一道无形的屏障，到底该咋突破啊？”
如果你们也有类似的困扰，那么听好了哦！与其把时间浪费在毫无头绪的摸索中，不如静下心来，赶紧找个小板凳坐好，认真钻研生信湾今天要分享的这篇中医药网络药理学+多组学分析的文章吧。一旦把这篇文章研究透彻了，就算是硕士小白师弟都能顺利发表文章！话不多说，现在就让生信湾带大家一起去探寻这篇文章的创新之处吧！
1. 多技术联合创新：整合网络药理学、蛋白质组学和代谢组学，全面探究中药当归芍药散（DSS）对阿尔茨海默病（AD）的作用机制，突破单一技术局限，为中医药研究提供新范式，全面解析药物作用分子机制。
2. 核心成分筛选创新：构建药物-靶点网络并结合吸收、分布等特性筛选核心成分，精准定位关键因素，提升研究准确性，助力深入理解中药起效成分及潜在治疗靶点。
3. 机制研究创新：从能量代谢角度揭示中药治疗阿尔茨海默病机制，聚焦新致病因素，为疾病治疗提供新思路，拓展了对该疾病发病机制及中药干预机制的认知。
PS：如果你一边想复现作者的好思路，但一边又拿不稳设计的话，不妨动手联系生信湾为你持续改进，坐等中~
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l题目：通过整合蛋白质组学和代谢组学方法揭示当归芍药散对 APP/PS1 小鼠阿尔茨海默病的分子机制
l杂志：Alzheimer's Research Therapy
l影响因子：IF=7.9
l发表时间：2024年11月
（注：公众号后台回复“123”获取文献全文！文献编号：20241121-2）
研究背景
阿尔茨海默病（AD）是常见的神经退行性疾病，目前缺乏有效治疗手段。大脑能量代谢（EM）等潜在致病因素受关注。传统中药当归芍药散（DSS）对AD有作用，但机制不明。本研究旨在揭示DSS对AD的作用机制，为治疗提供新见解。
研究思路
本研究先整合AD疾病基因与DSS药物-靶点网络，筛选核心成分，接着通过动物实验验证DSS药效，再用蛋白质组学和代谢组学探索其作用机制，最后对能量代谢相关机制进行验证，从而揭示DSS治疗AD的分子机制及通路调控作用。
主要结果
1. DSS改善APP/PS1小鼠认知功能
Y迷宫和莫里斯水迷宫测试表明，DSS可提高APP/PS1小鼠的交替率、降低逃避潜伏期、增加目标穿越次数和停留时间，表明其能改善认知功能。与模型组相比，DSS组小鼠认知能力显著提升，且部分剂量效果优于阳性对照药多奈哌齐。
图1 Y迷宫和莫里斯水迷宫测试中不同组小鼠的相关数据
2. D - T网络分析与DSS核心成分筛选
构建的D - T网络含6514个药物 - 靶点相互作用，涉及1118种草药成分和218个AD基因。网络分析确定了253种核心成分，如辣椒素、芹菜素等，其可能通过与AD相关基因相互作用发挥治疗作用，且多与脂质和脂质样分子等类别相关。
图2 D - T网络及核心成分筛选
3. 4D - FastDIA定量蛋白质组学分析
选择高剂量DSS组进行蛋白质组学分析，数据稳定可靠。共鉴定出111个差异表达蛋白（DEPs），其中90个上调，22个下调。部分DEPs参与线粒体ATP合成等生物过程，表明DSS可能通过调节能量代谢缓解AD。
图3 蛋白质组学分析结果
4. 靶向能量代谢谱分析
PCA和OPLS - DA分析显示，模型组与对照组代谢物有显著差异，DSS治疗可调节代谢水平。共鉴定出47种能量代谢物，筛选出8种与DSS治疗相关的显著代谢物生物标志物，如3 - 苯乳酸等，其水平变化与DSS治疗有关。
图4血清代谢谱分析结果
5. DSS调节GSK3β/PGC1α信号通路
qPCR和WB分析表明，DSS可下调APP/PS1小鼠GSK3β的mRNA表达，上调PGC1α的mRNA和蛋白表达，调节GSK3β/PGC1α信号通路，该通路与大脑能量代谢相关，提示DSS可能通过此通路促进能量代谢发挥抗AD作用。
图5 GSK3β和PGC1α在皮质和海马区的mRNA和蛋白表达水平变化数据
文章小结
这篇文献内容超丰富！把网络药理学、转录组学、蛋白组学和分子生物学全用上，探究传统中药当归芍药散（DSS）对阿尔茨海默病（AD）的作用机制。逻辑严谨，层层深入，网络药理学与多组学完美结合，轻松成就7分+佳作！当下国家大力扶持中医药研究，这可是天赐良机！中医药方向的朋友们，利用生信加快实验研究，早发文早受益；还能进一步拓展为国自然课题，事半功倍！想复现思路就赶紧找生信湾呀！
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