纯干货！中医药研究热度爆棚，网络药理学太卷咋整？【网药发文指北】来袭，带你杀出重围！

文摘 2024-11-18 10:00 上海

持续关注【生信湾】的粉丝朋友有没有发现，生信湾最近分享了好几篇中医药、网药相关文章？没有看到的赶紧往前翻翻，都是一水儿的新思路！这么高频率的推荐，主要原因还是中医药研究太火爆了，有了国家大力扶持，研究热度爆棚，发文量暴增，同时也带来一个大家都不愿意面对的问题——内卷！

面对网药内卷，咋整？

要创新！要突破！因为网药已经火了很多年了，经久不衰，但大家去翻一翻最新的网药文章，不可能跟网药刚火的时候做的质量和工作量一样。所以说，如果你还只会用老套路，那大概率是被拍在沙滩上。只有不断创新才能持续发文，才能发高分！

好，下面到了关键问题：怎么创新？（Ps：网药老套路难发，新思路难设计，咋办？别担心，生信湾来解救你，个性化思路设计不在话下！有了新思路但自己实现不了？还是联系大风哥，定制化分析适合你，专业生信团队十年经验，竭力为您服务~）

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看生信湾总结的【网药发文指北】！

1. 小白先学基础版（大神可直接跳到下面创新升级版）

1）网络药理学常规分析模板

2）网络药理学常用数据库

2. 创新升级版

1）创新突破之法（精华，必看！！！）

p选题创新：疾病选择（可选多种相关疾病、避开非肿瘤主要地盘，与肿瘤预后分析相结合），药物选择（研究较少的植物药/复方/民族药、药食同源类、代谢物），注意选题创新是上上之策，性价比最高！

p思路创新：与多组学联合，与流行病学/临床数据库分析联合，与孟德尔随机化联合，与机器学习、单细胞分析等提分神器联合；

p验证实验：表达、功能、机制实验，非肿瘤疾病验证通常要用到动物模型，研究药物对疾病的治疗作用。

2）网药友好期刊推荐

有句话说，写的好不如投的好，这句话突出了投稿选刊的重要性，也确有道理。找到合适的期刊会对文章的分数有很大的加成作用，下面就推荐几个网药比较友好的期刊

网药思路变化多，到底该选哪一个？不知怎么选就来找生信湾！可评估思路、可个性化思路设计、可定制生信分析，硕博团队，你需要的我都有，生信湾随时等待你的召唤~

下面还是用文章实例来展示下上面提到的创新之法的实操：

1. IF=11.4分，肿瘤方向，网药+机器学习+体内外实验（探索机制）

题目：红景天苷通过SCD1介导的脂肪生成和NCOA4介导的铁蛋白吞噬增加三阴性乳腺癌对铁死亡的敏感性

研究思路：首先通过网络药理学、生信分析和机器学习算法来筛选靶点，然后利用体外细胞实验和体内动物实验证明Sal的抗TNBC作用。接下来，研究Sal通过诱导铁死亡来抑制TNBC的机制。

2. IF=8.5，药食同源方向，网药+代谢组学+分子对接

题目：代谢组学和网络药理学揭示蓖麻蜜抗化脓性链球菌的机制

研究思路：本研究首先对比多种蜂蜜对链球菌的抗菌能力，选中锥属蜜深入研究。通过代谢组学分析其抗菌代谢物，结合网络药理学预测靶点，再经分子对接验证，最终揭示其通过影响特定代谢途径和酶活性抑制细菌的机制。

3. IF=6.7，多疾病方向，网药+分子对接（纯生信）

题目：小檗碱抑制炎症的分子机制及网络药理学分析

研究思路：该研究使用相关关键词从Web of Science、PubMed、谷歌学术和Scopus检索截至2023年7月关于小檗碱抗炎药理作用和机制的最新研究。采用网络药理学和生物信息学分析来预测黄连素对潜在疾病的治疗作用和机制。具体来讲，首先是从OMIM、DisGeNET和GeneCards数据库筛选目的疾病相关的靶标，再将得到的靶标整合到STRING平台中，建立蛋白质-蛋白质相互作用，使用Metascape平台进行功能富集分析，筛选具有高度值的核心靶标。从而为进一步研究小檗碱治疗炎症性疾病的机制奠定了基础。（详细解读请点链接查看：慕了！中医药不用做实验，照样发一区！网络药理学＋分子对接，多疾病模型齐上阵，纯生信发文的思路你GET了嘛！）

4. IF=6.7，药食同源方向，网药反向筛选+分子对接+体内外实验验证

题目：抗焦虑和抗抑郁药物-食品类似物的网络药理学筛选和体内外评价

研究思路：首先从Drugbank、TTD、GeneCards数据库中获取焦虑和抑郁相关靶点，利用PPI网络确定核心靶点，在TCMSP数据库中查询核心靶蛋白以检索相关活性成分，然后在 HERB 和 TCMSP 数据库中进一步探索这些活性成分以确定相关的草药，构建“焦虑和抑郁靶标-活性成分-草药”网络。基于以上网络药理学结果和分子对接，确定具有抗焦虑和抗抑郁潜力的前十种草药。进一步筛选具有细胞保护作用和无毒特性的草药以配制草药混合物。随后，在小鼠中建立了 PC12 细胞损伤模型和慢性不可预测的轻度应激（CUMS）模型，以评估草药制剂的效果。

5. IF=4.7，药食同源方向，网药+分子对接+分子动力学模拟（纯生信）

题目：茶叶中儿茶素抗高血压的潜在机制:网络药理学、分子对接和分子动力学模拟的整合

研究思路：该研究首先通过SEA搜索服务器和SwissTargetPrediction数据库收集8种儿茶素组分的靶点，然后从DisGeNET、OMIM和GeneCards数据库中收集高血压相关靶点，与儿茶素靶点取交集，获得儿茶素治疗高血压的潜在靶点，建立茶—儿茶素—靶点—高血压网络，利用PPI网络筛选关键靶标。此外，还利用KEGG和GO数据库进行了富集分析，通过分子对接模拟进一步评估儿茶素组分和关键靶标的结合作用。最后，对有结合作用的四种蛋白质-配体复合物进行了分子动力学(MD)模拟，进一步探索蛋白质-配体相互作用的稳定性。（详细解读请点链接查看：网络药理学纯生信，17天接受，你敢信？毕业神刊审稿飞快啊！网药+分子对接+分子动力学模拟拿下2区，中医药领域毕业发文用它绝了）

写在最后

网药创新思路还是很多的，发高分也并非难事。想要在中医药领域追求创新思路的朋友，建议紧跟生信湾脚步，生信热点日更不停！想做个性化生信分析？欢迎随时联系生信湾！专业团队为你保驾护航，1V1定制创新思路！

合集 · 推荐

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持续分享最新生信热点思路，提供专业生信分析服务：思路设计、生信分析、文献复现、数据库搭建等。助力您的科研之路!欢迎朋友们沟通交流与合作~

IF 7.7！这才是当下的毕业神刊！43天接收：天然产物+网络药理学+分子对接，干湿搭配好上分！

又被孟德尔随机化硬控！1图1表发到8.7分？双样本MR分析又上Q1区，恭喜恭喜！

科研“捡漏”思路来了！公共数据库的单细胞+bulk转录组分析，0实验就发到6分+！这性价比绝绝子~

40天接收！我猜这是你需要的0实验“双疾病转变”思路：细胞凋亡+GEO数据库+WGCNA+免疫浸润，还有机器学习助阵，绝了！

临床数据挖掘的“天选期刊”！中科院一区6.3分，还在涨分！小众冷门“新贵”期刊，无需版面费，快来捡漏！

7.9/Q1，中医药发顶刊，争气！多组学整合这么能打！网络药理学+蛋白组学+代谢组学，这操作太秀了！

纯生信审稿人要求补验证实验，咋办？用孟德尔随机化就对了！0实验验证生物标志物，照样发TOP刊！

孟德尔随机化也有自己的“搭子”了！45万大规模GWAS+多组学分析，学会这个思路，2图2表就能发14+分JAMA子刊！

药学沾边就收的“神刊”佳作！2个月接收的“网络药理学+单细胞分析”思路，学到就是赚到！

中医药人又幸福了！安徽中医药大学这篇文章做的是“网络药理学与多组学整合分析”，干湿结合值得学习~

纯干货！中医药研究热度爆棚，网络药理学太卷咋整？【网药发文指北】来袭，带你杀出重围！

“生信大佬” 张泽民院士，北大出品，顶刊不断，2024新篇又至！生信利器获两千多引用，小白上手简单，易操作，直接秒变大佬！

不得了！本科生发表Cell正刊！这位“天选之子”到底啥来头？3D时空建模，精度再次up up up！

一波未平，一波又起！这本中科院一区TOP期刊刚被On hold，如今又被剥夺影响因子！

啥？微信越玩脑子越灵光！同济大学CHARLS研究：中老年人经常使用微信，有助于提高认知能力，快喊上你的爸妈“赶时髦”~

重磅！“棕榈酰化”频频登陆Nature/STTT/Gut/NC等各大顶刊！生信挖掘抓紧提上日程！

Nature“嫡水刊”！年发文量2万+，刚升中科院二区值得投！广西医科大学10种机器学习的纯生信，临床医生没时间也能狂发10篇！

中医药几乎不退稿的“梦中情刊”！川大华西团队打破常规，网络药理学+血清代谢组学，干湿结合好思路，国家扶持发发发！

对所有的“膳食纤维”说hey hey！首都医科大学挖掘NHANES：膳食纤维总摄入量与抑郁风险呈负相关

国产药学神刊！影响因子一路高涨~无版面费，国人占比9成，这篇“网络药理学”帮你提提神！

就这么水灵灵地发了一篇6分+！GEO数据库+WGCNA+机器学习+诊断模型+共识聚类，这性价比直击心巴！

NC出品，必属精品！又被孟德尔随机化硬控了！精细化选题+大样本量加持，让你的文章逆天改命，0实验狠狠爱住！

中医药人的狂欢！45天接收，网络药理学为何发文如此之快？简单实验助攻拿下一区Top，国家扶持如有神助！

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拳拳到肉！4张图的孟德尔随机化，拿捏Nature子刊！英国牛津大学等：蛋白质组学+MR+共定位分析，这套组合拳太猛了！

不装了，摊牌了！孟德尔随机化在“嘎嘎乱杀”！中南大学湘雅医院李卓团队凭借双样本MR分析和全基因组关联分析拿下6分+文章

“泼天富贵”终于让“中医药”接住了！西南交大/川大华西：中药复方+网络药理学+分子对接+少量实验，拿下国自然指日可待！

不到一个月就接受的单细胞测序长啥样？浙大团队10个样本直接锁定NC！生信第一梯队国果然非单细胞莫属！

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IF14.3，恭喜南科大陈军团队斩获一区TOP刊！GBD数据库+BAPC模型可太好用了，思路复刻无压力，快冲！

IF=12.5山东中医药大学“本科生一作”2个月发文，选择“孟德尔随机化”可太明智了，小白进阶良方—发文要学会取巧！

“泼天的富贵”终于让“中医药”接住了！南京中医药大学硕士生拿下一区Top：代谢组学+分子对接+动力学模拟，套路可放心尝试！

孟德尔随机化选题新才是王道，这篇看完你能发十篇，福建医科大陈志媛团队顶刊新作，MR+双疾病分析，快冲！

厉害了，网络毒理学！联手机器学习斩获Q1区6分+，西交大3201医院团队眼光独到，抓住发文新风口，不卷也能赢！

顶级“水刊” Nat Commun，不要只沉迷于单细胞等老热点了，机器学习结合转录组，肿瘤微环境这个思路很不错！

堪称“中医药”的天花板！清华团队：网络药理学+分子对接+少量实验，中药经方再现，即刻复现的SCI思路！

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IF=15.8！“乳酸化修饰”再攀高峰！南方医科大的这篇“单细胞+组蛋白乳酸化+糖酵解”研究新思路，都踩在点子上了！

狂喜！发文捷径有了！三个月速度接收1区7+，广东医科大学等团队：公共数据库+多组学测序+干湿结合，这波是上分干货，必须得接住！

顶流“乳酸化修饰”一出手，9分+文章即刻拥有！只需单细胞+空间转录组分析+一丢丢实验，又被盛京医院团队的1区Top文惊艳到了

网药新赛道开启，网络毒理学“王炸”登场！同样的配方，纯生信发表8+分，45天飞速接收，一篇顶十篇，快来！

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南方医科大IF27.7“巨噬细胞+成纤维细胞”，不懂细胞互作验证？只看这一篇就够了，十投九中的国自然思路，学会直接升咖起飞！

网药也可以0实验“躺赢”！40天快速接收，大连医科大学：网络药理学+机器学习+分子对接+分子动力学模拟，你上你也行！

0实验17天接受的“网络药理学”文章深度拆解！用对这个方法，临床医生3个月就发一篇SCI！

25天接受的0实验“网络药理学”长啥样？四川大学华西医院：网药+机器学习+分子对接，用它快准狠！

惊爆，IF=40.8！深度学习又“炸出圈”啦！北大沈琳团队创新突破，引领AI医疗发文新潮流！这思路一学就会~

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