网药有新道，毒理来报道！
关注生信湾的朋友中有很多是做中医药网络药理学研究的，生信湾也分享了很多类似思路，但随着网药的普及，其在该领域的应用也随之“泛滥”，难免缺乏“新鲜感”，根据生信湾的经验，没有分子对接，以及体内外实验验证，很难发表，或者很难出高分。今天生信湾就给大家推荐一个新赛道---网络毒理学！（PS：再强调一下哈，网药纯生信还能发，只是纯生信比较少了，看到这种文章生信湾都得给作者竖大拇指，不论是靠创新思路还是靠投稿选刊，能发出来都很厉害！）
其实，“网络毒理学”作为一门新兴的学科，是网络药理学的一个分支，主要应用于预测和评估药物的毒性成分，在中药领域中，尤其是在中药毒性成分预测（包括但不限于肝毒性、肾毒性、心脏毒性和急性毒性）发挥着重要作用。
下面，生信湾给大家给大家分享一篇发表在《Science of the Total Environment》上的文章，0实验纯分析，45天就接收了，几乎和网络药理学相同的套路，一起来看看吧！
PS：想复现这个思路但不知道如何入手？想个性化设计生信创新思路？快来联系生信湾吧！生信湾这里有无数高分文章套路可复现！
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l题目：利用网络毒理学和分子对接策略高效分析环境污染物的毒性和机理——以乙酰柠檬酸三丁酯为例
l杂志：Science of The Total Environment
l影响因子：IF=8.2
l发表时间：2023年12月
（注：公众号后台回复“123”获取文献全文！文献编号：20241030）
工业化学品增多产生大量环境污染物，传统毒理学方法难以全面评估其健康风险。网络毒理学和分子对接策略可高效探究环境污染物毒性及机制。以乙酰柠檬酸三丁酯（ATBC）为例，研究其潜在毒性及分子机制，为相关疾病防治提供依据。
首先利用软件工具进行ATBC毒性初步网络分析，收集其潜在靶点并筛选出与脑毒性相关的靶点网络。接着构建蛋白相互作用网络并筛选核心靶点，对目标蛋白进行基因功能和通路富集分析，最后进行分子对接分析。
1. ATBC毒性初步网络评估
通过整合软件工具输出，得到ATBC毒性概况。毒性模型显示活性毒性终点与致癌性相关，其膜转运体与血脑屏障有关。这为深入研究ATBC对人体的毒性作用奠定了基础，且与以往文献报道相符。
2. ATBC诱导脑毒性靶点的识别
从ChEMBL和STITCH数据库筛选出256个ATBC靶点，从GeneCards和OMIM数据库确定8841个与脑损伤高度相关的靶点。经过整合去重，得到213个潜在的ATBC诱导脑毒性靶点。
3. 潜在靶点的相互作用网络及核心基因获取
利用STRING数据库构建蛋白质 - 蛋白质相互作用网络（PPI），有212个节点和569条边，平均节点度值为5.37。通过Cytoscape软件分析拓扑性质，识别出23个核心靶点，如AKT1、CASP3、HSP90AA1等。
4. 目标蛋白的功能分析和通路富集分析
对213个潜在靶点进行GO和KEGG分析，GO分析得出814个显著条目，涵盖生物过程、细胞成分和分子功能。KEGG分析富集140条信号通路，神经活性配体 - 受体相互作用等通路突出。对23个核心靶点分析，富集287条通路，与癌症等相关。
5. ATBC与核心目标蛋白的分子对接
对ATBC和五个核心目标基因（AKT1、CASP3、HSP90AA1、ESR1、MMP9）进行分子对接分析，结果显示结合能低，表明化合物与目标之间有强亲和力，意味着它们在ATBC诱导的脑毒性机制中有重要作用。
怎么样，是不是看着很眼熟？用的还是“网络药理学”的工具和方法，但是却又走的“网药毒理学”路子，成功实现0实验45天发8+分的壮举。换个赛道，一下子轻松了。不是每个创新都要开天辟地，丝滑的转个身，也能达到预期。如果你也想简单发高分，网络毒理学绝对值得拥有~想复现思路或者个性化设计思路欢迎联系生信湾，期待你的好友申请～
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