金域惠民版甲状腺基因检测助力临床,精准诊断多例罕见基因异常

学术   2024-10-11 19:22   广东  




今年5月,金域医学推出了惠民版甲状腺基因检测(←点击了解详情),让患者付费不超过1千元,即可得到精准的甲状腺癌结节综合检测服务。近1个月来,其助力500余名患者明确甲状腺结节的性质,帮助他们得到精准的治疗。期间,由于该检测方法的优越性能,金域医学还发现了多例罕见基因突变和基因融合,全面凸显分子检测对于鉴别甲状腺结节良恶性的重要作用。

多基因突变检测
助力甲状腺结节精准诊断


近年来,甲状腺结节发病率逐年升高并趋向年轻化。由于细针穿刺样本细胞量少、核酸提取浓度低、探针杂交捕获建库的NGS法要求样本核酸投入量要求高等原因,大部分细针穿刺样本无法满足检测要求,通过常规检测难以准确辨明结节良恶性。



已有多个权威诊疗规范、专家共识和指南明确指出,BRAF、TERT、RAS、TP53等甲状腺相关基因检测,在诊疗过程中起到了举足轻重的作用。


为助力更多患者得到精准诊疗,结合临床需求和检测难点,金域医学推出了专而精的惠民版甲状腺基因检测。该检测通过DNA+RNA共建库,将多重PCR与二代测序相结合,一次性对甲状腺结节患者的诊断和后续治疗有明确意义的29个基因的多种变异模式(覆盖到22个基因的热点突变和9个基因的融合变异)进行检测,为患者的辅助诊断、精准用药、预后分层,遗传风险评估等诊疗需求提供全面的辅助判断依据。该方法具有核酸投入量少、操作步骤简单、TAT时间缩短、高性价比等优点,大大减轻了患者负担,提高基因检测的可及性。


检测出多个罕见基因变异

为治疗提供更多方向


该检测自2024年5月项目开展后,就备受临床关注。近一个月来,便收到了500余例样本,辅助多个患者明确甲状腺结节性质,并得到合适的治疗。在检测过程中,除检测出多种基因的SNV、Indel外,金域医学还发现了多例罕见基因突变和基因融合。


40岁的患者李衡(化名),在金域医学惠民版甲状腺基因检测的帮助下,发现了BRAF V600E+CCDC6::RET融合双变异。主治医生根据这一检测结果,结合临床影像学诊断,确诊他为甲状腺乳头状癌。


BRAF V600E和RET融合都是甲状腺乳头状癌的分子标志,但二者互相排斥,极少同时出现。BRAF V600E是甲状腺癌最重要的驱动基因,同时也是乳头状甲状腺癌(PTC)特异性诊断分子标志物,突变率在PTC中达到60%。目前FDA批准RAF抑制剂达拉菲尼联合MEK1/2抑制剂曲美替尼用于治疗BRAF V600E突变的甲状腺间变型癌患者。NCCN指南推荐达拉菲尼联合曲美替尼可用于局部复发、晚期或转移的不能接受RAI疗法且无其他治疗方式的携带BRAF基因突变甲状腺癌患者[1-4]

RET/PTC融合在散发PTC中的发生率为15%~20%。检测RET/PTC融合有助于诊断筛查,具有极高特异性。在甲状腺癌中,RET基因与其他常见的伙伴基因如CCDC6和NCOA4之间可能发生重排(融合)。伴RET融合的甲状腺癌患者可能从塞尔帕替尼和普拉替尼治疗中获益[5-8]


李衡的细针穿刺液中检测出了BRAF V600E基因和 CCDC6::RET基因融合,在临床上极为罕见,医生为此设计了更加符合患者情况的治疗方案。

CCDC6::RET正向序列


CCDC6::RET反向序列

在云南省,该检测也帮助50岁的患者陈飞(化名)明确诊断。陈飞手术后FFPE样本病理诊断多灶甲状腺乳头状癌并淋巴结转移。经检测发现了罕见的ETV6::NTRK3融合,FISH验证为阳性,提示该患者可能从NTRK1/2/3抑制剂(恩曲替尼和拉罗替尼)的靶向治疗中获益,这对于该晚期患者后续治疗提供了精准靶向治疗可能[1,9]


左:患者样本HE染色,右:FISH验证为阳性


除了上述两名患者之外,金域医学惠民版甲状腺基因检测还检测出多例类似的罕见基因异常情况,如EML4::ALK融合、TPR::NTRK1融合、IRF2BP2::NTRK1融合、PAX8::PPARG融合等,证实该项目在具备高性价比的同时,具有优越的检测性能,能同时检测甲状腺肿瘤热点基因突变与基因融合,不仅适合细胞学样本,也适合核酸质量差的FFPE样本。

结合金域病理平台提供的专业细胞病理学和组织病理学检测,金域医学惠民版甲状腺基因检测具有全面、精准、性价比高等特点,真正帮助医生看好病,让患者少折腾。


为满足不同患者的需求,针对甲状腺结节筛查和甲状腺肿瘤诊疗,金域医学充分整合细胞病理、二代测序和PCR等多技术平台,可提供BRAF和RET等单基因检测、甲状腺多基因panel、儿童甲状腺癌套餐等检测项目,已服务超十万人次患者。

参考文献:

1. NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. Thyroid Carcinoma. Version 1, 2024.
2. Zaman A, Wu W, Bivona TG. Targeting Oncogenic BRAF: Past, Present, and Future. Cancers (Basel). 2019 Aug 16;11(8):1197.
3. Lassalle S, Hofman V, Ilie M, Butori C, Bozec A, Santini J, Vielh P, Hofman P. Clinical impact of the detection of BRAF mutations in thyroid pathology: potential usefulness as diagnostic, prognostic and theragnostic applications. Curr Med Chem. 2010;17(17):1839-50.
4. Subbiah V, Kreitman RJ, Wainberg ZA, Cho JY, Schellens JHM, Soria JC, Wen PY, Zielinski C, Cabanillas ME, Urbanowitz G, Mookerjee B, Wang D, Rangwala F, Keam B. Dabrafenib and Trametinib Treatment in Patients With Locally Advanced or Metastatic BRAF V600-Mutant Anaplastic Thyroid Cancer. J Clin Oncol. 2018 Jan 1;36(1):7-13.
5. Drilon A, et al. Targeting RET-driven cancers: lessons from evolving preclinical and clinical landscapes. Nat Rev Clin Oncol. 2018 Mar;15(3):151-167.
6 Drilon A, et al. Targeting RET-driven cancers: lessons from evolving preclinical and clinical landscapes. Nat Rev Clin Oncol. 2018 Mar;15(3):151-167. 2. Kato S, et al.
7. RET Aberrations in Diverse Cancers: Next-Generation Sequencing of 4,871 Patients. Clin Cancer Res. 2017 Apr 15;23(8):1988-1997. 3. Su X, et al.
8. RET/PTC Rearrangements Are Associated with Elevated Postoperative TSH Levels and Multifocal Lesions in Papillary Thyroid Cancer without Concomitant Thyroid Benign Disease. PLoS One. 2016 Nov 1;11(11):e0165596
9. Drilon A, Laetsch T W, Kummar S, et al. Efficacy of Larotrectinib in TRK Fusion-Positive Cancers in Adults and Children[J]. N Engl J Med,2018,378(8):731-739.




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