Pharmacological Research | 基于Alphafold的AI对接揭示芪桂降脂方通治疗代谢相关性脂肪肝

文摘   2025-01-27 07:30   天津  

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是一种慢性进展性疾病,主要特征为肝细胞内脂肪变性和过度脂质积累。由于NAFLD与肥胖、糖尿病及其他代谢紊乱密切相关,2020年有学者建议将其更名为代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)。最近一项Meta分析显示,全球成人MAFLD的患病率高达50.7%,预计到2030年将进一步增加。目前,MAFLD的治疗主要依赖降糖、降脂和降压药物,但仍缺乏FDA批准的特效药物。而MAFLD相关的发病率和死亡率依然很高,因此迫切需要新疗法。

研究表明,自噬功能障碍与MAFLD的发生密切相关,提高肝脏自噬水平有助于减轻脂质沉积。因此,药物通过上调自噬活性可能成为改善MAFLD的新策略。转录因子EBTFEB)是自噬-溶酶体途径的关键调控因子,能够调节自噬相关基因的表达,Beclin1LAMP1是其重要靶基因。激活TFEB不仅能促进自噬过程,还能增强细胞内物质的清除。此外,腺苷5′-单磷酸腺苷(AMP-活化蛋白激酶(AMPK-Sirtuin去乙酰化酶1SIRT1)通路被认为是增强TFEB功能的重要机制。AMPK的活化能够促进SIRT1的激活,进而增强TFEB的功能,调节自噬和溶酶体相关基因的表达。近年来,中医药在MAFLD的预防和治疗方面取得了显著进展。

近日,Pharmacological Research发表文章“AlphaFold-Based AI Docking Reveals AMPK/SIRT1-TFEB Pathway Modulation by Traditional Chinese Medicine in Metabolic- Associated Fatty Liver Disease”。该研究探讨了国医大师王院士研制的中药方剂芪桂降脂方QGJZF)对MAFLD的改善作用。通过高脂饮食诱导的斑马鱼和金黄仓鼠模型,以及棕榈酸酯(PA)和油酸(OA)诱导的HepG2细胞模型,结果表明QGJZF能够通过AMPK/SIRT1-TFEB自噬-溶酶体通路发挥作用。网络药理学分析初步确定了关键靶点,结合AlphaFold蛋白结构预测,证实AMPKQGJZF的作用机制中起着关键作用。通过高效液相色谱法和AMPK激酶活性实验,发现QGJZF能够直接激活细胞内AMPK,并且柚皮苷、(+)-儿茶素水合物和儿茶素是其关键成分。这些结果表明,AMPK/SIRT1-TFEB轴可能是MAFLD的重要治疗靶点,而QGJZF及其活性成分有望成为治疗MAFLD的有效药物。

1QGJZFHFD诱导的脂质代谢紊乱的影响

研究采用高脂饮食(HFD)诱导的斑马鱼和金黄仓鼠模型,评估芪桂降脂方(QGJZF)的降脂效果。在斑马鱼模型中,高剂量组(2000 μg/mL)和阳性对照ATO的干预显著降低了总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)水平,且QGJZF能够改善斑马鱼血流速度和眼部血管厚度。此外,QGJZFATO治疗均减少了巨噬细胞的数量,提示其抗炎作用。在金黄仓鼠模型中,经过8周的HFD饲喂,仓鼠体重和肝脏重量明显增加。而给予QGJZF后,这些变化被有效逆转。H&E染色结果显示,QGJZF处理后,肝细胞组织结构更加正常,细胞肿胀和空泡化现象减少。油红OORO)染色测试也显示QGJZF显著减少了肝脏脂滴的数量及大小。提示QGJZFHFD诱导的肝功能损伤具有一定保护作用

 1 QGJZF改善HFD斑马鱼和金黄仓鼠的脂质积累

2、网络药理学分析和AlphaFold预测QGJZF治疗MAFLD的潜在靶点和结构

研究者SymMap平台上检索方中中药,发现2863个相关靶标,GeneCards显示其中613个与MAFLD相关的目标。通过生物信息学分析,确定了QGJZFMAFLD199个共同靶点,构建的共同目标网络中显著的枢纽靶点为PRKAA2AMPK)和SIRT1。利用AlphaFold3预测,其结构准确性得分高,PRKAA2的排序得分为0.97SIRT10.93,表明预测结果可靠,为后续实验提供了理论支持。

 2 网络药理学分析和AlphaFold预测QGJZF治疗MAFLD的潜在靶点和结构

3QGJZF通过激活AMPK/SIRT1-TFEB通路改善MAFLD金黄仓鼠的脂质积累

透射电镜(TEM)研究显示,QGJZF能显著减少金黄仓鼠的肝细胞中脂滴数量,同时显著增加自噬体和自噬溶酶体数量,且脂滴自噬溶酶体数量之间存在显著负相关。自噬相关蛋白LAMP1ATG3LC3-II在模型组中均下调,而QGJZF处理后肝脏的p62自噬标志物Beclin1水平上调。此外,QGJZF促进TFEB核内表达,增加AMPK的磷酸化,逆转HFD诱导的SIRT1下调。免疫组化结果显示,QGJZF提高p-AMPKSIRT1的表达,表明其通过激活AMPK/SIRT1-TFEB通路改善MAFLD相关的脂质积累。

 

 3 QGJZF促进HFD金黄仓鼠中自噬溶酶体的表达,上调AMPK/SIRT/TFEB的表达

4QGJZF对体外细胞脂质积累和自溶酶体形成的影响

为研究QGJZF对体外脂肪堆积的影响,通过使用油酸(OA)和棕榈酸(PA)处理HepG2细胞,并评估QGJZF的降脂作用。结果表明,QGJZF有效减少了TCTG的水平,并显著降低ASTALT水平,显示出对OA/PA损伤的保护作用,且效果优于阳性对照药物ATOORO染色和透射电镜分析发现,QGJZF显著减少了细胞内的脂滴数,并增加了自噬体和自噬溶酶体的数量,从而增强其自噬功能。Western blot结果显示QGJZF激活了AMPK/SIRT1-TFEB通路。

研究者进一步探讨了QGJZF是否通过TFEB介导其降脂作用。在OA/PA诱导的HepG2细胞中,QGJZF上调TFEB的作用被TFEB siRNA逆转。QGJZF处理后,细胞内脂滴数量减少,而溶酶体和脂滴的共定位增加,表明其通过溶酶体途径减少脂滴。转染TFEB siRNA后,QGJZF降低脂质积累的作用显著减弱,同时,QGJZF上调自噬相关蛋白Beclin1ATG3LC3-IILAMP1的表达受抑制。

此外,使用AMPK抑制剂化合物CCC)后,QGJZF诱导的自噬通量增加被显著抑制,显示降脂效果的减少。

 4 QGJZF通过AMPK诱导激活自噬溶酶体

5QGJZF及其主要活性成分通过激活AMPK改善脂质沉积

尽管QGJZF能激活AMPK并减少脂质沉积,但具体机制尚不清楚。研究者采用了高效液相色谱法测量HepG2细胞中ATPADPAMP的水平,并计算它们的比值。与对照组相比,QGJZF处理组的AMP/ATPADP/ATP比率无显著变化,表明QGJZF可能直接结合激活AMPK。进一步试验显示,QGJZF剂量依赖性地增加AMPK激酶活性。通过LC-MS和分子对接分析,筛选出芦丁、柚皮苷、香蜂草苷、(+)-水合儿茶素和儿茶素为潜在的AMPK激活剂。其中,柚皮苷、(+)-水合儿茶素和儿茶素显著增强AMPK活性,并能有效降低细胞内TCTG水平,从而改善脂质沉积。

 5 QGJZF及其主要活性成分通过直接结合AMPK改善脂质沉积

本文作者:HWY

责任编辑:LQY

全文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1043661825000428

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