如题，今天介绍的文献是浙江大学医学院附属邵逸夫医院团队发表在Advacnced Science期刊上的研究：m6Am Methyltransferase PCIF1 Promotes LPP3 Mediated Phosphatidic Acid Metabolism and Renal Cell Carcinoma Progression。
关注这项研究的主要原因有：
1.研究关注了三个“科研热点”：RNA的m6Am修饰、磷脂酸代谢和线粒体分裂；
m6A是最常见的RNA甲基化修饰之一，主要发生在mRNA的3'非翻译区（3'UTR），而m6Am则是一种相对较新发现的修饰，位于mRNA的转录起始位点，紧邻7-甲基鸟苷（m7G）帽子结构。两者都是由特定的“写入者”（如PCIF1）添加到RNA上，并且可以被“擦除者”（如FTO）去除。这些修饰在调控RNA的稳定性、剪接、翻译和定位等方面发挥重要作用（国自然申请|研究“RNA修饰”的2种常见思路和4个关键要素，标书中如何体现逻辑严谨？）。
2.研究的逻辑非常清晰：m6Am甲基转移酶PCIF1在RCC组织中显著上调，并通过m6Am修饰增强磷脂磷酸酶3（LPP3）mRNA的翻译，进而调控磷脂酸代谢和线粒体分裂，促进RCC的进展。因此这样的研究是完全可以模式化的，如果大家关注这些研究，基本上可以总结出一个很“套路”化的模式：“工具分子”+“功能分子”+“表型热点”，比如在这里“工具分子”是PCIF1，“功能分子”是磷脂酸代谢酶LPP3，“表型热点”是线粒体分裂，所以10+的高分文章也有套路和模式。
3.从国自然的角度来说，这样的故事框架非常适合申请基金，特别是青年项目，当然出发点不同，既可以从m6A到6Am，也可以从磷脂酸代谢、线粒体分裂出发。
下面我们通过问题来看研究内容：
1.研究的主要疾病和研究角度是什么？
研究的主要疾病是肾细胞癌（RCC），研究角度集中在探索PCIF1介导的m6Am修饰对RCC进展的影响，特别是其通过LPP3调控磷脂酸代谢和线粒体分裂的作用机制。
2.研究如何选择PCIF1作为研究对象？
研究选择PCIF1作为研究对象是因为在RCC组织中观察到PCIF1和m6Am水平的显著上调，这表明PCIF1可能在RCC的发病机制中扮演重要角色。此外，PCIF1作为m6Am修饰的“写入者”，其功能在多种疾病中的研究还相对有限，尤其是在RCC中。
3.在确定PCIF1的下游靶基因时，通过什么方法或者策略确定LPP3的？
在确定PCIF1的下游靶基因时，研究团队采用了m6Am-Exo-Seq技术，这是一种专门用于识别m6Am修饰的RNA测序技术。通过这种方法，研究者能够鉴定出在PCIF1敲低后m6Am修饰水平发生变化的基因，从而确定LPP3作为PCIF1的关键下游靶基因。
4.在具体机制上，如何确定PCIF1对LPP3的m6Am修饰，以及如何影响LPP3的翻译？
为了确定PCIF1对LPP3的m6Am修饰，研究者使用了RNA免疫共沉淀（RIP）实验，结合抗m6Am抗体来检测LPP3 mRNA上的m6Am修饰水平。此外，通过多聚核糖体分析和新生蛋白质标记实验，研究者发现PCIF1敲低会抑制LPP3的翻译效率，而PCIF1过表达则增强了LPP3的翻译。
5.LPP3是如何调控磷脂酸代谢的？
LPP3调控磷脂酸代谢的方式是通过其磷脂磷酸酶的活性，将磷脂酸（PA）去磷酸化生成二酰甘油（DAG）。这一过程对于维持细胞内磷脂和三酰甘油的平衡合成至关重要。
6.磷脂酸代谢是如何影响线粒体分裂的？
磷脂酸PA的积累可以抑制线粒体分裂，而LPP3的活性则有助于防止PA的积累，从而促进线粒体分裂。线粒体分裂对于细胞能量代谢和质量控制非常重要。
7.线粒体分裂与RCC是什么关系？
线粒体分裂与RCC的关系在于，线粒体分裂的异常可以影响细胞的代谢状态和能量供应，促进RCC细胞的增殖和迁移，从而加速了肿瘤的进展。
