今天给大家带来浙大团队只用4个样本的单细胞测序+一般分析就拿下的影响因子6.9分的文章！如果您对文章思路和方法感兴趣，请为sun点点关注，生信文献汇持续分享生信文献和思路~如果您需要定制化服务，欢迎关注联系~
文章标题：scRNA-seq reveals the landscape of immune repertoire of PBMNCs in iMCD
中文标题：scRNA-seq 揭示了 iMCD 中 PBMNCs 的免疫库景观
发表期刊：Oncogene
发表时间：2024年9月
影响因子：6.9/Q1
特发性多中心 Castleman 病 （iMCD） 是一种罕见且可能致命的疾病。其特征是全身性炎症症状、全身淋巴结肿大、多克隆淋巴细胞增生和器官功能障碍，由过度活跃的炎症状态引起。确定可靶向疾病介质仍然是一个未满足的临床需求。
研究方法
我们首先采用单细胞 RNA 测序 （scRNA-seq） 来阐明 iMCD 中外周血单核细胞 （PBMNC） 的免疫库的景观，并确定其他驱动细胞因子/细胞/通路以解决 IL-6 阻断难治性病例。
结果分析
1. 鉴定 iMCD 和 NC 中的浸润细胞类型
通过分析 4 例 iMCD 患者和 3 例健康对照者，与健康对照组相比，iMCD 患者的 T-NK 细胞簇显著增加，而髓系细胞亚群显著减少。
2. iMCD 和 NC 中 B 浆细胞的炎症评分和细胞组成
iMCD 组 B 浆细胞、T-NK 细胞和髓系细胞簇的炎症评分明显高于 NC 组，说明炎性细胞因子风暴是影响 iMCD 中所有免疫细胞的普遍现象。iMCD 中抗炎细胞因子基因（如 MYC 和 TNFSF10）的表达显著降低。表明，多种机制可能是导致细胞因子风暴发展的原因。
3. iMCD 和 NC 中 NK-T 和髓系细胞的组成分析
耗竭的 T 细胞在 iMCD 中独特地升高。相比之下，iMCD 组的 Tph 和 Treg 细胞比例明显较高，而 CD4 + Tcm、初始 CD8 + T 细胞和初始 CD4 + T 细胞的亚群显著减少。
4. iMCD 中的 IL-6 信号激活
IL-6 主要由 B 细胞产生，尽管一小部分由髓系细胞和 NK/T 细胞分泌，iMCD 中 IL-6 的全身性上调主要由幼稚 B 细胞驱动。整个细胞群中 IL-6 信号传导的显着激活，包括总 B 浆细胞、T-NK 细胞和骨髓细胞簇，这表明旁分泌机制是 IL-6 信号转导在这些簇内传播的基础。
5. CXCL13/CXCR5 相互作用在 iMCD 中至关重要
与 NC 相比，iMCD 患者 T 细胞中 CXCL13 的产生显著增加，其中 Tph 和 Treg 细胞是表达 CXCL13 的主要亚群。CXCL13 的 T 细胞亚群（特别是 Tph 和 Treg 细胞）与表达 CXCR5 的 B 细胞亚群（包括初始 B 细胞和记忆 B 细胞）之间存在显着相关性，但在 NC 中则没有。表明CXCR5/CXCL13 信号通路在 iMCD 的特殊致病机制中的关键作用。
6.特定通路中的细胞间相互作用
CXCL13 + T 细胞可以通过巨噬细胞迁移抑制因子 （MIF） 信号网络和相关配体-受体对直接与 IL-6 信号激活的 B 细胞相互作用，包括 MIF- （CD74 + CD44） 和 MIF- （CD74 + CXCR4）。在 CXCL13 + T 细胞和 IL-6 信号激活的 B 细胞之间相互作用中特别活跃的 8 条通路，它们参与血管生成、细胞粘附、炎症和免疫抑制，在 iMCD 的背景下也明确活跃，包括 SELPLG、ITGB2、GALECTIN、IL-16、ICAM、CLEC、MHC-II 和 SEMA4。
文章小结
我们通过ScRNA-seq 分析显示，炎性细胞因子风暴在 iMCD 中广泛存在于所有免疫细胞中。我们的研究结果还表明，产生 CXCL13 的 Tph 和 Treg 细胞在 iMCD 的发病机制中起关键作用，突出了它们是 iMCD 的潜在治疗靶点。（不管是新手小伙伴们想入门还是大课题想结合一点生信，“单细胞测序”方向仍是你的高性价比之选！需要思路复现、设计、定制分析的小伙伴欢迎关注联系sun~）
