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文章标题：Identifying proteomic risk factors for overall, aggressive, and early onset prostate cancer using Mendelian Randomisation and tumour spatial transcriptomics
中文标题：使用孟德尔随机化和肿瘤空间转录组学确定整体、侵袭性和早发性前列腺癌的蛋白质组学风险因素
发表期刊：Ebiomedicine
发表时间：2024年6月
影响因子：9.7/Q1
前列腺癌是一种异质性疾病，对于被诊断为惰性或早期疾病的患者，生存率很高，但对于被诊断患有侵袭性或转移性癌症的患者，5 年生存率低于 50%。了解循环蛋白在前列腺癌风险中的作用可以揭示关键的生物途径并确定预防癌症的新靶点。
研究方法
我们使用顺式-pQTL 孟德尔随机化 （MR） 和共定位研究了 2002 年基因预测的循环蛋白水平与前列腺癌总体风险以及侵袭性和早发性疾病风险的相关性。经过多次校正和共定位使用两种独立的癌症 GWAS复制了 MR 支持的蛋白质结果。使用前列腺肿瘤组织中的空间转录组数据额外研究了具有前列腺特异性组织表达证据的蛋白质，以评估它们在肿瘤侵袭性中的作用。
结果分析
1. 遗传预测蛋白浓度与前列腺癌风险的关联
通过分析，我们确定了 20 种蛋白质，这些蛋白质在多次测试校正后，至少有一个结果与总体 （14 种蛋白质）、侵袭性 （7 种蛋白质） 或早发性 （8 种蛋白质） 前列腺癌相关，并且也得到了共定位分析的支持。
2. 遗传预测蛋白质水平和前列腺癌风险
在与任何前列腺癌结果相关的 20 种蛋白质中，有几种仅在一个结果中显示出强大的关联，包括 7 种似乎特定于整体前列腺癌的蛋白质 （5NTC、CREBL1、INFA14、ISLR2、MMP7、SERPINA1、TNSFRS10B），3 种似乎是侵袭性疾病特异性的 （C4A、C2、TNFRSF6B），以及 2 种似乎是早发性疾病特异性的 （SERPINA3、PYY）。
3. 在欧洲和非洲血统种群中复制稳健蛋白
MSMB、MMP7和ISLR2这三种蛋白与总体前列腺癌风险相关的蛋白质在非洲血统的男性中被复制。
4. 空间转录组学分析
良性细胞（MSMB 含量高）和格里森级第 4 组 （GG4） 细胞（其中 MSMB 在大多数细胞中非常低或不存在）之间 MSMB 表达的显着差异，与良性细胞相比，GG2 和 GG4 细胞中 CREB3L4 的表达较低。
5. 良性和 GG4 前列腺组织学之间基因表达差异
全基因组随机森林分析确定MSMB表达是区分良性细胞和GG4细胞的最重要基因。
文章小结
我们通过MR、蛋白质组学和空间转录组学等方法确定了与侵袭性和早发性疾病相关的风险蛋白子集。这些蛋白质为指导进一步的分子和流行病学研究提供了机会，旨在探索蛋白质组在肿瘤发生中发挥的特定作用，并最终可能为未来的治疗预防研究提供信息。（对文章思路感兴趣的老师，欢迎关注sun一起交流）
