今天为大家带来是遗传流行病学领域的前沿研究设计,全基因组跨性状分析,它不仅能够帮助我们探索未知,更能够为我们的科研工作带来新的突破。如果您对文章思路和方法感兴趣,请为sun点点关注,生信文献汇持续分享生信文献和思路~如果您需要定制化服务,欢迎关注联系~
文章标题:Dissecting the shared genetic architecture between anti-Müllerian hormone and age at menopause based on genome-wide association study
中文标题:基于全基因组关联研究剖析抗苗勒管激素与更年期年龄之间的共同遗传结构
发表期刊:American Journal of Obstetrics And Gynecology
发表时间:2024年7月
影响因子:8.7/Q1
虽然抗苗勒管激素与绝经年龄之间的表型关联已得到广泛研究,但抗苗勒管激素在预测绝经年龄方面的作用目前存在争议,并且这两个特征背后的遗传结构或因果关系尚不清楚。
研究方法
我们使用关于欧洲人抗苗勒管激素 (N=7049) 和更年期年龄 (N=201,323) 的全基因组关联研究的汇总统计数据,通过连锁不平衡评分回归研究抗苗勒管激素与更年期年龄之间的全球遗传结构。采用多效性分析来识别具有多效性效应的基因座和基因。通过 2 样本孟德尔随机化检查抗苗勒管激素与绝经年龄之间的关系,并使用共定位和代谢物介导的分析进一步探索潜在的介质。
结果分析
1. AMH 与更年期年龄之间的共享位点
共定位分析显示,在 42 个多效性基因座中,有 10 个(rs10734411、rs61913600、rs2277339、rs75770066、rs28416520、rs9796、rs11668344、rs403727、rs6011452 和 rs62237617)可能在 AMH 和绝经年龄之间共享。
2. 多效性基因富集分析
GO 富集分析显示,具有多种作用的 245 个基因显著集中在 DNA 复制中 (P=4.28×10−5)、错配修复 (P=1.00×10−4)和双股断裂修复 (P=3.90×10−4).KEGG 富集分析显示与缺氧诱导因子-1 信号通路 (P=.01) 、错配修复 (P=.013) 和 DNA 复制 (P=.032) 相关的基因显著富集。
3. 鉴定共享功能基因
采用 SMR 和 HEIDI 分析,鉴定出 9 个可能共享的致病风险基因 (APOLD1、AC074117.10、ADORA2B、SNX17、MSH6、ZNF98、NRBP1、GAB2 和 KRTCAP3)。7 个富集组织(血液、脑、心脏、肝脏、肌肉、胰腺和肾脏)中大多数表现出 ADORA2B、SNX17 和 ZNF98 的存在。
4. AMH 与更年期年龄之间的因果关系
正向MR 分析揭示了AMH 对绝经年龄无显著影响(B)。反向 MR 分析,揭示了绝经年龄可能对AMH有因果效应(A)。
5. 代谢物共定位和介导分析
10 个基因组区域中检测到几种代谢物与 AMH 或更年期年龄之间存在相关性。绝经年龄越年轻,脂质代谢越不稳定,伴随着 VLDL 的增加。更年期年龄越大,脂质代谢越稳定。更年期年龄对 VLDL 有因果影响,但反之则不然。VLDL 对 AMH 有因果效应,但反之则不然。因此,VLDL 可能介导更年期年龄与 AMH 之间的关系是合理的。
文章小结
我们的研究揭示了AMH和更年期年龄之间存在共享的遗传基础,为提高生殖结果的实验研究和个体疗法提供了基础。我们的研究结果有助于扩大对 AMH 和更年期年龄通常涉及的遗传途径的理解,并突出了它们复杂的内在相关性。(对文章思路感兴趣的老师,欢迎关注sun一起交流)