《坤舆万国全图》不仅挑战了世界史上的三大经典学说——郑和下西洋止于东非、哥伦布发现美洲新大陆、利玛窦引入西方地理知识到中国，还质疑了西方构建的历史体系，如古希腊罗马史、古埃及史、两河流域史等。香港学者李兆良在其著作《坤舆万国全图解密—明代测绘世界》和《宣德金牌启示录—明代开拓美洲》中，以及高翔在《〈坤舆万国全图〉地名考本》中，均详细论证了明代已经发现了美洲，并提出了许多有力证据。西方将《坤舆万国全图》称为“不可能的郁金香”（Impossible Black Tulip），因为这张地图所展示的世界地理知识远远超出了当时欧洲的认知水平。直到利玛窦去世200年后，欧洲才开始具备类似的地理认知。因此，欧洲自己编写的地理史无法解释这张地图的存在。长期以来，西方一直否认中国曾航行至美洲，更不用说环球航行。然而，《坤舆万国全图》的出现打破了这一神话，证明了中国对世界的认识远早于西方。此外，《坤舆万国全图》中的一些特征也表明它并非出自利玛窦之手。例如，图中未标注重要的教皇领地和佛罗伦萨，这与利玛窦作为传教士的身份不符。同时，图中也没有体现当时欧洲最著名的比利牛斯山脉和喀尔巴阡山脉，且欧洲部分的信息量明显少于非洲、美洲和亚洲。还有各种只有中国的文化才能定义的地名等等，这些特点进一步证明了该图并非由利玛窦绘制。随着《坤舆万国全图》的公开，西方关于地理发现的传统说法逐渐失去立足之地。曾经作为西方地图学权威交流平台的世界地图历史网站（MapHist.nl）论坛不得不永久关闭，相关资料也随之消失。如今，越来越多的证据表明，明代中国可能是世界大发现的真正开创者。尽管这一观点尚未得到广泛承认，但其影响力正在逐渐扩大，相信未来还有更多珍贵的资料会公开。值得注意的是，恢复真实历史的最大阻力往往来自内部。如果西方构建的历史体系被推翻，将影响到许多专家的地位和科研经费。因此，推动历史真相的揭示需要克服巨大的利益障碍。以前我们摆脱了政治和军事的殖民，现在文化领域更不能继续被西方殖民，必须坚持独立自主的研究方向，才能还原历史的真实面貌。
