单细胞分析Q&A:影响捕获细胞数目的因素有哪些?

文摘   2024-09-29 12:01   四川  



01

影响捕获细胞数目的因素有哪些?

主要影响细胞捕获数目多少的是样本处理成单细胞悬液的过程——细胞浓度与活性。样本物种类型及组织特点多样,如骨组织,灌洗液,成熟心肌组织或植物原生质体等,需要较为特殊的处理方式,以保障细胞活性;外周血单核细胞分离时需要注意避免其他细胞的污染等。



02

拟时分析有什么要求?

拟时分析默认使用Monocle2软件,单样本与多样本均可进行拟时分析,需要客户提供在哪个/些样本上,哪种“分组”(可以是分群方式,样本,时间段,组间等)的基础上进行拟时分析。



03

单细胞RNA测序与传统和超低输

入的RNA测序有什么区别?

标准RNA测序可以检测所有细胞平均转录状态,传统RNA测序的不足是单个细胞和细胞亚群的分辨率丢失。单细胞RNA测序使研究人员不仅能够识别细胞亚群,而且能够在异质样本中的单细胞水平上对其进行全面分析。与标准RNA测序类似,超低输入RNA测序提供整个细胞群体的批量表达分析;但是其通量非常有限,低至10pg或几个细胞。单细胞RNA测序需要至少50000个细胞(建议100万个)作为输入。



04

单细胞RNA测序样品处理流程是

什么?

首先对样品进行活细胞计数以及存活率测量,为了确保最高质量的数据,必须尽快在10x Genomics Chromium系统上处理细胞。



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