最新!沈阳农业大学乌日娜教授团队开发了筛选鲜味肽的模型“Umami-gcForest”

学术   2024-11-03 07:53   湖北  

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Umami-gcForest:基于深度森林构建鲜味肽预测模型

导  读

2024年11月1日,沈阳农业大学乌日娜教授团队在国际食品Top期刊《Food Chemistry》(Q1,IF: 8.5)发表题为“Umami-gcForest: Construction of a predictive model for umami peptides based on deep forest”的研究性论文。



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成果介绍

  • 最近,鲜味肽因其能够增强鲜味、降低盐分含量并提供营养而备受关注。然而,采用传统的湿实验室方法来鉴定它们费时、费力且成本高昂。


  • 因此,该研究团队利用深度森林算法开发了 Umami-gcForest 模型。它使用 ProtBERT、氨基酸组成、组成-转换-分布和伪氨基酸组成构建氨基酸特征矩阵,并应用互信息进行特征选择,以优化维度。与其他机器学习基线模型、味肽预测模型和复合模型相比,Umami-gcForest 在不同测试集上的验证结果表明它具有出色的预测准确性。


  • 利用 SHapley Additive exPlanations 计算特征贡献,该研究团队发现 Umami-gcForest 的关键特征是疏水性的、带电的和极性的。在此基础上,该研究团队开发了一个在线平台,以方便用户应用。总之,Umami-gcForest 是一种功能强大的工具,为高效、准确地筛选鲜味肽奠定了坚实的基础。


图文赏析

原文链接

https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2024.141826

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