复发是急性髓性白血病(AML)临床治疗的主要挑战之一。尽管微小残留病(MRD)监测在疾病的定量评估中起着至关重要的作用,但分子MRD分析主要局限于诊断为基因融合和NPM1突变的患者。
2024 年 11 月 14 日,首都医科大学吴若嘉、北京医院刘辉及北京大学戴鹏共同通讯在 Nature Communications (IF=14.7)在线发表题为 “Longitudinal ultra-sensitive mutation burden sequencing for precise minimal residual disease assessment in AML” 的研究论文。该研究报告了一种纵向超敏感突变负担(UMB)监测策略,用于准确的AML患者MRD分析,无论遗传异常类型如何。
使用定量阻断剂置换扩增( QBDA )测序组,检测限低于0.01 %的变异等位基因频率( VAF ),在20例患者完全缓解( CR )期间≥2个样本的累积复发率分析中观察到风险比为14.8 ( p < < 0.001)。预测CR时间点( 2( N = 20) ) 30周内复发的ROC曲线下面积( AUC )为0.98。此外,作者证明了定量VAF低于0.01 %对于准确预测复发至关重要。
急性髓系白血病(AML)是一种恶性造血干细胞疾病,其特征是骨髓和外周血中未成熟髓系前体(成髓细胞)的积累。虽然新型化疗药物和靶向治疗的发展使大多数AML患者实现了细胞形态完全缓解(CR),但大约50%的患者最终会复发。同种异体造血干细胞移植(HSCT)在缓解期具有潜在的治疗效果,但其高昂的成本和非复发死亡率和发病率抵消了其有益的效果。因此,在选择同种异体造血干细胞移植和非移植策略时,除了评估移植相关因素外,准确识别复发高风险患者是风险适应缓解后治疗选择方法的基石。AML患者的这种分层取决于诊断时的初始疾病风险评估和缓解期间最小残留疾病(MRD)的检测。由于越来越多的证据表明,在诊断时识别的细胞遗传学和分子预后标志物可能不足以估计临床结果,因此非常需要在CR期间进行敏感和精确的MRD分子检测。基于多色流式细胞术(MFC)免疫表型的MRD检测信息丰富,检测限约在0.1%至0.01%之间。然而,20%-70%的患者复发,MFC结果低或阴性,表明临床敏感性有限。基于RT-PCR、下一代测序(NGS)和液滴数字PCR (ddPCR)定量检测白血病特异性基因畸变预测疾病复发的方法已经被探索,实现了白血病融合基因(如RUNX1-RUNX1T1、CBFβ-MYH11、PML-RARα)和NPM1 founder突变患者的分子MRD检测。该方法的适用性仅限于约40%被诊断为可靶向异常的AML患者。其他遗传变异包括KIT、IDH1/2、FLT3-ITD、GATA2和JAK2的意义仍有待进一步证实。即使对于突变或基因融合的患者,新生遗传畸变也可能作为复发的另一种原因发生,这可能导致MRD呼叫假阴性。开发高灵敏度和特异性的MRD检测方法来预测适用于普通AML患者的临床结果,无论其遗传原因如何,这是一项具有挑战性和高度期望的工作。具有不同突变特征的 AML 病例的 MRD 评估(图源自Nature Communications)在这里,作者报告了一种MRD评估策略,通过纵向监测AML患者中常见突变的基因组区域的超敏感突变负担(UMB)变化。突变负担分析是基于这样的假设,即在同一患者中,癌细胞,无论其遗传变异如何,在基因组中比正常细胞更频繁地发生突变。作者最近开发的一种检测限(LoD)低于0.01%变异等位基因频率(VAF)的超灵敏突变定量方法QBDA (Quantitative Blocker Displacement Amplification)被用于在复发早期检测残留疾病。UMB监测策略允许在累积复发发生率(CIR)分析中早期预测复发。在至少有2个CR样本时间点(N = 20)的患者中观察到的风险比(HR)为14.8 (p < 0.001)。对于所有至少有1个CR样本时间点的患者(N = 23), HR为11.6 (p < 0.001)。预测CR时间点2后30周内复发时,受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)为0.98 (N = 20)。此外,作者还证明了UMB策略适用于诊断时具有各种遗传异常类型、各种治疗方法或不同欧洲白血病网(ELN)风险群体的AML患者。
参考消息:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-54254-6—END—
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