太顶了!双样本孟德尔随机化+蛋白质组学探究痔疮药物靶点,拿下一区top(IF=23.0)

文摘   科学   2024-10-29 20:05   浙江  

引言

现如今,在孟德尔随机化发文如此“卷”的情况下,想要发高分就必须花样翻新!

这不,今天分享的这篇文章,研究团队就联合双向双样本MR+共定位分析+单细胞RNA测序分析等多种方法,全面研究了血浆蛋白与痔疮的因果关系,并探索治疗痔疮的药物靶点,轻松拿下SCI一区(IF=23.0)!

接下来就让我们简单看一下今天这篇文章。

常言道“十男九痔、十女十痔”,提起痔疮(HEM),这大概是很多人心中的“难言之隐”!

痔疮作为一种常见的肛门直肠疾病,尽管其普遍性很高,但受限于研究不足及涉及敏感隐私问题,至今我们对其病理学基础及分子机制仍缺乏深入的了解。因此,鉴定具有潜在治疗作用的蛋白质并进行深入研究,显得尤为迫切和重要。

2024年10月7日,中国学者在顶级期刊《Gut(医学一区top,IF=23.0)发表了一篇题为:“Drug targets for haemorrhoidal disease: proteome-wide Mendelian randomisation and colocalisation analyses”的研究论文,旨在使用双向双样本孟德尔随机化(MR)方法,评估4907种血浆蛋白与痔疮的因果关联,并研究可能在血浆蛋白与痔疮关联中起中介作用的危险因素。

研究结果表明血浆蛋白ERLEC1的高表达水平是痔疮的一个危险因素,能够增加得痔疮的风险。同时,憩室病在ERLEC1与痔疮的关联中起到了中介作用。

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研究团队整合了全基因组关联研究(GWAS)数据库血浆蛋白质组据,分别从中获取了痔疮相关数据和4907种血浆蛋白。团队通过双向双样本MR探究血浆蛋白与痔疮的因果关系,并用共定位分析确认二者是否存在共同的致病变异。

同时,研究团队利用单细胞RNA测序分析技术探究痔疮组织和正常标本的基因在不同类型细胞中的表达情况。此外,团队还采用双向MR方法,探讨了临床上与痔疮相关的5个危险因(甲状腺功能减退症/粘液性水肿、背痛、疝、强直性脊柱炎、憩室病)是否介导了血浆蛋白对痔疮的作用。

血浆蛋白与痔疮的因果关系探究及验证

双向双样本MR分析的结果表明,在4907种血浆蛋白中,有五个潜在的致病蛋白(Bonferroni 校正阈值为 p<1.01e-05)其中三个蛋白与痔疮风险呈负相关,两个蛋白与痔疮风险呈正相关。

图1 血浆蛋白水平对痔疮的影响

共定位分析结果显示,两种血浆蛋白(ERLEC1和ASPN痔疮(H4>0.9)之间存在共同的致病变异。

图2 ERLEC1和ASPN的共定位结果


同时,为了加强结果的稳健性和可信度,团队对ERLEC1和ASPN这两个血浆蛋白进行了验证。结果发现,ERLEC1(rs542580)的结果得到了验证,而ASPN(rs10992273)并没有与所有次要性状相关。这意味着,ERLEC1和痔疮之间的因果关系依旧稳健。

ERLEC1在不同组织的表达情况

基因表达分析结果显示,在排除性别和BMI的影响之后,ERLEC1表达有差异,而ASPN没有差异。这进一步表明ERLEC1的高表达水平是痔疮的危险因素,能够增加痔疮风险。

图3 ERLEC1在组织中的表达情况

同时,研究团队还利用GTEx V.8数据库研究了ERLEC1在各组织中的表达情况,结果显示,与全血相比,ERLEC1在小肠和结肠等多种组织中表达水平均较高。

图4 GTEx多组织的表达数据分析结果

此外,研究团队进一步进行单细胞RNA测序分析,结果显示,ERLEC1在瞬时扩增细胞中表达水平高。

图5 单细胞RNA测序分析结果

危险因素在ERLEC1与痔疮关联的中介作用

研究团队对五个危险因素进行研究,结果表明,憩室病(DIV)的遗传风险增高痔疮风险升高相关,但没有足够的证据表明痔疮与其他四种疾病有因果关系。

图6 五种危险因素和痔疮之间的因果效应。

此外,团队利用双向MR分析确定与痔疮危险因素相关的蛋白,结果发现ERLEC1与憩室病的高风险相关。

图7 两种蛋白质(ERLEC1和ASPN)与五种危险因素的双向MR结果

因此,研究团队认为憩室病在ERLEC1与痔疮的关联之间起到了中介作用。

图8 中介关系示意图

综上所述,研究团队认为ERLEC1有望成为治疗痔疮的药物靶点。因此,需要更大规模的和更深入的研究来验证结果并研究其潜在机制。

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