技术简介
简化基因组甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing，RRBS)，通过酶切富集基因组上的CpG岛、启动子、增强子等区域，并进行Bisulfite 测序。在经典RRBS基础上，艾斯基因在国内首家推出强化版RRBS，覆盖全基因组范围内超过6-8M CpG位点，>90%数量的CpG岛及基因启动子; 作为最高性价比的全基因组甲基化研究方法, RRBS广泛用于表观机制及临床样本队列甲基化研究: 1) 队列研究、疾病分子分型、临床样本的甲基化Biomarker筛选; 2) 复杂疾病及肿瘤发病机制等甲基化研究; 3) 模式动物发育和疾病甲基化研究; 4) 动物及鱼类遗传育种及进化发育等甲基化研究。
艾斯基因优势
样本类型
送样要求
数据信息分析
案例分析
案例一
DNA 甲基化异常用于甲状腺结节诊断
图1.邻近甲状腺组织、良性和恶性结节的DNA甲基化差异聚类
图1.DNA甲基化变化随癌前病变的进展而增加
研究结果：研究发现细菌对转录组的影响随时间增加，而大多数菌群依赖性的DNA甲基化差异在出生后早期即出现，并鉴定出126个基因位点的DNA甲基化及RNA转录与菌群相关，通过靶向甲基化测序TBS (Deep Target Bisulfite Sequencing) 和RTqPCR在另外一组独立样本(10个/组)中加以验证。
图1. 课题方案设计
图1. 早期驯化与野生欧洲鲈鱼的DNA甲基化变化
参考文献：
1、Identification of Tissue-Specific DNA Methylation Signatures for Thyroid Nodule Diagnostics. Clin Cancer Res. 2019;15;25(2):544-551 (IF= 10.199)
2、Evolution of DNA methylome from precancerous lesions to invasive lung adenocarcinomas. Nat Commun. 2021 Jan 29;12(1):687.
3、Exposure to the gut microbiota drives distinct methylome and transcriptome changes in intestinal epithelial cells during postnatal development. Genome Medicine. (2018) 10:27.
4、Epimutations in developmental genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass. Mol Biol Evol. 2019 May 30 (IF= 14.797)
