全基因组甲基化测序通常有WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing）和EM-seq（Enzymatic Methyl-seq），分别通过重亚硫酸盐和酶处理结合高通量NGS测序，对有参考基因组进行全基因组的单碱基分辨率的检测方案，广泛用于人、动植物、鱼类及其他低等物种的全基因甲基化研究。艾斯基因建立双转化平台和双质控体系，提供全类型样本甲基化解决方案：包括细胞、全血、新鲜冷冻组织、病理切片FFPE、血浆cfDNA及其它复杂及微量临床样本等。
技术特点
单碱基分辨率，金标准方案；
全基因组范围检测；
无偏向检测、创新性研究；
超低样本起始量，低至500ng建库；
适合所有临床样本，全部有参物种，全部样本类型；
数据质控
重亚硫酸盐转换率＞99%（双质控）；
pUC19过转化率＜5%（双质控）；
更高的比对率：平衡BS文库测序，Q30>80%，比对率 >70% (人和模式动物)。
应用领域
01
甲基化谱研究（临床样本）
文章标题：人类疱疹病毒和感染后前体病变胃组织的基因组结构
发表期刊：Genome Medicine (IF=12.3)
技术平台：WGBS、RRBS、WES
样本类型：25例EBV阳性胃癌患者（EBVaGCs）的唾液、胃粘膜、癌前病变和肿瘤组织
研究结果：通过全基因组甲基化测序，发现正常胃黏膜组织和轻度不典型增生（LD）的甲基化谱较为相似，但两者与EBVaGCs有显著差异。相对于正常组织/LD，EBVaGCs中存在6316个差异甲基化区域（DMRs)，其中99.8%处于高甲基化状态。在所有高甲基化区域里，66.44%与启动子区域重叠。EBVaGCs中Ras GTPase激活蛋白（RasGAP）家族的RASA3、RASA4、RASAL3基因启动子区域均为高甲基化状态，提示这些基因表达沉默可能会促进Ras的激活从而激活下游PI3K-Akt通路，以进一步驱动肿瘤的发展。
图1研究流程设计
02
疾病机制研究（小鼠样本）
（艾斯合作文章）
图2 DNA去甲基化酶TET2通过mRNA氧化抑制尿素循环
03
植物机制研究（植物样本）
（艾斯合作文章）
图3 核桃和核桃楸的亚基因组信息
04
非常规物种机制研究（蟑螂）
（艾斯合作文章）
选择艾斯基因
🌟专业优势
艾斯基因已经成功完成对临床样本，大小鼠，猪，大豆，食蟹猴，牛，拟南芥，水稻，桃，白菜等近百个物种进行全基因组甲基化测序分析，是国内最大的表观组学甲基化服务商。
🌟项目经验丰富
每年服务100+海外和国内企业及200+高校和医院等客户，拥有50000+例甲基化服务项目，拥有30天极速交付高效周期。
🌟高分文章支撑
专注表观组学15年，助力客户在Nature Communications、Genome Biology、Cell Research等国际期刊上累计发表50余篇论文。
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艾斯基因有专业的技术与生信分析团队，项目配备一对一专项解答，确保项目圆满结题。
🌟可选干冰邮寄或上门取样服务
在北京 、上海 、广州 、深圳均可上门取样。其余地区提供免费的干冰寄样服务。
送样要求
关于艾斯基因
创建于2016年，隶属于国家高新技术企业和创新型中小企业。核心团队是国内最早一批表观多组学科研技术开拓者之一，在Nature、Cell 等顶级期刊发表论文数十篇。公司全力打造赋能基础科研、精准医学及人群队列研究的 “创新多组学1+N” 技术服务体系，服务于每一个合作项目。每年为 70+海外和国内企业客户、200+ 高校和医院等客户提供 50000+ 例样本的技术服务。
参考文献
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