![]()
全基因组甲基化测序WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing）通过重亚硫酸盐处理结合高通量NGS测序，对有参考基因组进行全基因组的单碱基分辨率的检测方案，广泛用于人、动植物、鱼类及其它低等物种的全基因甲基化研究。艾斯基因基于单链DNA建库技术构建的WGBS文库，实现超低起始量样本建库，更好的数据产出、更高质量的数据以及更准确的甲基化信息。为广大科研工作者提供更优质的甲基化数据，同时提供全类型样本甲基化解决方案：包括细胞、全血、新鲜冷冻组织、病理切片FFPE、血浆cfDNA及其它复杂及微量临床样本等。
解决低质量DNA甲基化建库难题神器 ：DNA单链建库
DNA单链建库技术，更低起始量，更优质的数据；
单碱基分辨率，金标准方案；
全基因组范围检测；
无偏向检测、创新性研究；
适合所有临床样本，全部有参物种，全部样本类型。
文章标题：人类疱疹病毒和感染后前体病变胃组织的基因组结构
发表期刊：Genome Medicine (IF=12.3)
技术平台：WGBS、RRBS、WES
样本类型：25例EBV阳性胃癌患者（EBVaGCs）的唾液、胃粘膜、癌前病变和肿瘤组织
研究结果：通过全基因组甲基化测序，发现正常胃黏膜组织和轻度不典型增生（LD）的甲基化谱较为相似，但两者与EBVaGCs有显著差异。相对于正常组织/LD，EBVaGCs中存在6316个差异甲基化区域（DMRs)，其中99.8%处于高甲基化状态。在所有高甲基化区域里，66.44%与启动子区域重叠。EBVaGCs中Ras GTPase激活蛋白（RasGAP）家族的RASA3、RASA4、RASAL3基因启动子区域均为高甲基化状态，提示这些基因表达沉默可能会促进Ras的激活从而激活下游PI3K-Akt通路，以进一步驱动肿瘤的发展。
![]()
图1研究流程设计
![]()
（艾斯合作文章）
文章标题：TET2通过尿素循环抑制mTORC1信号传导并具有治疗潜力发表期刊：Cell Discovery（IF = 13.0)研究结果：WGBS分析显示TET2敲除细胞中许多基因的甲基化水平在多个生物途径中异常调控，体外实验及mRNA结合位点的映射进一步验证了TET2通过mRNA氧化影响尿素循环酶表达的机制。这些发现为理解TET2在细胞代谢调控中的作用提供了新的见解。![]()
图2 DNA去甲基化酶TET2通过mRNA氧化抑制尿素循环
![]()
（艾斯合作文章）
文章标题：DNA甲基化在核桃与核桃楸亚基因组表达优势中的作用发表期刊：Plant Physiology (IF=8.6)研究结果：将两个物种的基因组划分为显性亚基因组（DS）和随从亚基因组（SS）。将同源基因表达水平、DNA甲基化修饰水平、基因附近四大类型转座子密度、基因所对应前体mRNA发生的可变剪接事件进行联合分析，发现DNA甲基化修饰可能通过修饰LTR/TIR/non-TIR这三种类型的转座子、提高对应前体mRNA的可变剪接效率，从而导致同源基因对的偏向表达。该研究结果有助于了解多年生木本植物亚基因组表达优势的表观遗传学基础及环境适应性的分子基础。![]()
图3 核桃和核桃楸的亚基因组信息
非常规物种机制研究（蟑螂）
![]()
（艾斯合作文章）
文章标题：5mC修饰通过防止延长ftz-f1表达来协调绒毛膜的发生和受精发表期刊：Nature communications (IF=16.6)技术平台：WGBS、RNA-seq、NGS-BSP等样本类型：德国小蠊雌性成虫的六个组织部位（头、腿、中肠、卵巢、胸腔和被膜）、第一生殖期(8天)的卵巢、dsCK和dsDnmt1处理后的卵巢组织研究结果：Dnmt1的敲除降低了卵巢中5mC的水平，上调了绒毛膜发生过程中的许多基因，尤其是转录因子ftz-f1。在卵巢卵泡细胞中，ftz-f1启动子区域的低甲基化增加并延长了ftz-f1的表达，从而导致20-羟基蜕皮激素(20E)水平异常升高和基质金属蛋白酶(Mmp1) 基因的表达显著上调，引起卵泡细胞的异常、绒毛膜蛋白的缺乏和海绵体的畸形而进一步损害绒毛膜的形成和破坏受精。这项研究极大地促进了对DNA 5mC修饰如何调节昆虫雌性生殖的理解。图4 Dnmt1介导的5mC维持是绒毛膜形成和受精不可缺少🌟项目经验丰富
艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商，每通量＞10万例，已经成功完成对人临床样本，大小鼠，猪，牛，食蟹猴，拟南芥，大豆，水稻，桃，白菜等近百个物种的甲基化测序分析，每年服务100+海外和国内企业及200+高校和医院等客户。
🌟交付流程稳定
艾斯基因已实现甲基化全自动化测序，标准化流程、拥有低成本优势，项目30天极速交付。
🌟高分文章支撑
团队专注表观多组学15年，拥有资深的表观研究经验，多篇CNS及子刊研究成果，助力客户在Nature Communications、Genome Biology、Cell Research等国际期刊上累计发表百余篇论文。
🌟专业的服务团队
艾斯基因有专业的技术与生信分析团队，项目配备一对一专项解答。
🌟可选干冰邮寄或上门取样服务
在北京 、上海 、广州 、深圳均可上门取样。其余地区提供免费的干冰寄样服务。
![]()
创建于2016年，隶属于国家高新技术企业和创新型中小企业。核心团队是国内最早一批表观多组学科研技术开拓者之一，在Nature、Cell 等顶级期刊发表论文数十篇。公司全力打造赋能基础科研、精准医学及人群队列研究的 “创新多组学1+N” 技术服务体系，服务于每一个合作项目。每年为 100+海外和国内企业客户、200+ 高校和医院等客户提供 10万例样本的技术服务。
1、The genomic architecture of EBV and infected gastric tissue from precursor lesions to carcinoma. Genome Med. 2021 Sep 7;13(1):146. doi: 10.1186/s13073-021-00963-2. PMID: 34493320; PMCID: PMC8422682.
2、TET2 is required to suppress mTORC1 signaling through urea cycle with therapeutic potential. Cell Discov. 2023 Sep 21;9(1):97. doi: 10.1038/s41421-023-00600-9. PMID: 37550284; PMCID: PMC10406918. 3、DNA methylation role in subgenome expression dominance of Juglans regia and its wild relative J. mandshurica. Plant Physiol. 2023 Sep 22;193(2):1313-1329. doi: 10.1093/plphys/kiad394. PMID: 37403190.4、5mC modification orchestrates choriogenesis and fertilization by preventing prolonged ftz-f1 expression. Nat Commun 14, 8234 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-43987-5
