传统的全基因组甲基化检测方法是基于重亚硫酸氢盐转化，是甲基化检测的金标准方案，但会在一定程度上损伤DNA，且所需样本量较高。之前我们深入探讨了EM-seq技术在cfDNA液体活检领域的临床应用，揭示了它在疾病的早期诊断，治疗评估以及预后复发应用的巨大潜力。然而EM-seq的应用远不止于此，由于其温和的转化反应和更稳定的数据表现，它在基因组DNA甲基化研究领域也具有应用价值。
案例1：
EM-seq比WGBS更适用于植物甲基化研究
研究文章：Efficient and accurate determination of genome-wide DNA methylation patterns in Arabidopsis thaliana with enzymatic methyl sequencing
研究材料：拟南芥花和叶片基因组DNA
研究方法：EM-seq、WGBS
研究内容：发现EM-seq在检测DNA甲基化方面比WGBS更准确、可靠，在重复性、映射率、重复率、背景噪声、平均覆盖率和总胞嘧啶覆盖率方面均优于WGBS。拟南芥中，CHG甲基化水平在花中显著高于叶子，尤其是在着丝粒周围区域，表明这种甲基化模式可能与植物的发育和器官功能有关。EM-seq可以检测到更细微的甲基化差异，并且具有更低的背景噪声，使其更适合于甲基化研究。
EM-seq比对率更高，重复率更低、无效数据更少，甲基化胞嘧啶平均覆盖率更高。
案例2：
EM-seq助力植物基因体动态甲基化与表达可塑性联系
研究文章：Dynamic DNA methylation turnover in gene bodies is associated with enhanced gene expression plasticity in plants
研究材料：拟南芥DDRT四突突变体、拟南芥不同组织
研究方法：EM-seq
研究内容：通过EM-seq发现了一种新的基因体甲基化（GbM）类型在植物的所有细胞中，包括生殖细胞中，都处于不断的添加和移除的动态变化中。这种动态GbM并且在进化上是保守的，与增强的基因表达可塑性相关，而稳定甲基化的GbM基因表现出较低的可塑性，表明DNA去甲基化和基因表达可塑性增强之间的联系。
基因组中两种不同类型的基因体甲基化
案例3：
EM-seq筛选牛乳腺炎相关的甲基化标志物
与奶牛患乳腺炎的潜在甲基化位点分析
艾斯基因
🌟项目经验丰富
艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商，每通量＞10万例，已经成功完成对人临床样本，大小鼠，猪，牛，食蟹猴，拟南芥，大豆，水稻，桃，白菜等近百个物种的甲基化测序分析，每年服务100+海外和国内企业及200+高校和医院等客户。
🌟交付流程稳定
艾斯基因已实现甲基化全自动化测序，标准化流程、拥有低成本优势，项目30天极速交付。
🌟高分文章支撑
团队专注表观多组学15年，拥有资深的表观研究经验，多篇CNS及子刊研究成果，助力客户在Nature Communications、Genome Biology、Cell Research等国际期刊上累计发表百余篇论文。
🌟专业的服务团队
艾斯基因有专业的技术与生信分析团队，项目配备一对一专项解答。
🌟可选干冰邮寄或上门取样服务
在北京 、上海 、广州 、深圳均可上门取样。其余地区提供免费的干冰寄样服务。
点点赞
点分享
点在看
